38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4557 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_4557  2',5' RNA ligase  100 
 
 		 199 aa  412  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0162437  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4293  2',5' RNA ligase  69.35 
 
 		 197 aa  266  1e-70  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.775847 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2442  2',5' RNA ligase  39.89 
 
 		 196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.900073 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2222  hypothetical protein  37.57 
 
 		 205 aa  109  3e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.19028  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1290  2'-5' RNA ligase  38.07 
 
 		 195 aa  93.2  2e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.334257 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01767  2'-5' RNA ligase  34 
 
 		 200 aa  92  5e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.680529  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2482  2'-5' RNA ligase  33.91 
 
 		 189 aa  91.7  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.097083  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1443  putative ligase protein  35.75 
 
 		 198 aa  91.7  6e-18  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1320  2'-5' RNA ligase  34.64 
 
 		 222 aa  85.9  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0321525  normal  0.761807 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1384  2'-5' RNA ligase  33.33 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.605515  normal  0.876718 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2337  Phosphoesterase HXTX  37.06 
 
 		 201 aa  80.5  0.00000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.714494 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2787  2'-5' RNA ligase  35.09 
 
 		 206 aa  79.7  0.00000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.320306  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1918  putative ligase  36.17 
 
 		 201 aa  79.3  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.102106  normal  0.252687 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1982  2'-5' RNA ligase  29.55 
 
 		 207 aa  73.9  0.000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6095  2',5' RNA ligase  28.57 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0652023  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2006  2'-5' RNA ligase  30.11 
 
 		 207 aa  73.6  0.000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1350  2'-5' RNA ligase-like protein  36.67 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1426  2',5' RNA ligase  31.32 
 
 		 201 aa  66.2  0.0000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0723245  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2421  2',5' RNA ligase  30.43 
 
 		 201 aa  65.1  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0368864  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3202  hypothetical protein  31.49 
 
 		 183 aa  63.9  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.59985  normal  0.950309 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0923  2',5' RNA ligase  27.01 
 
 		 177 aa  57.4  0.0000001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3271  2'-5' RNA ligase  31.82 
 
 		 181 aa  53.5  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2424  2'-5' RNA ligase  31.03 
 
 		 181 aa  50.4  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2116  2',5' RNA ligase  30.27 
 
 		 179 aa  50.8  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.529013  normal  0.178928 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2064  2'-5' RNA ligase  33.9 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3075  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 181 aa  50.4  0.00002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3983  2'-5' RNA ligase  27.17 
 
 		 180 aa  50.1  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000701591  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2212  2'-5' RNA ligase  28.98 
 
 		 186 aa  50.1  0.00002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2923  2',5' RNA ligase  30.73 
 
 		 194 aa  49.3  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0916331  normal  0.627654 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1002  2'-5' RNA ligase  27.22 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.018778  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3466  2'-5' RNA ligase  27.22 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3336  2'-5' RNA ligase  27.22 
 
 		 191 aa  47.8  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00058753  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3240  2',5' RNA ligase  27.17 
 
 		 174 aa  47.8  0.0001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1005  2',5' RNA ligase  28.09 
 
 		 183 aa  47.4  0.0002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0968272  normal  0.0378462 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8886  2'-5' RNA ligase  28.26 
 
 		 190 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.979447  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_23030  2-5 RNA ligase protein  28.96 
 
 		 176 aa  44.7  0.001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1286  2'-5' RNA ligase  25.27 
 
 		 188 aa  42  0.006  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.757621  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1659  2'-5' RNA ligase  27.08 
 
 		 192 aa  41.6  0.009  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000321406  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>