More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_3372 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_3372  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 339 aa  683    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.125996 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5554  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  56.02 
 
 		 336 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0347599 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2697  LacI family transcription regulator  31.94 
 
 		 339 aa  132  9e-30  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0956022  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3367  transcriptional regulator, LacI family  27.51 
 
 		 337 aa  129  7.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3000  transcriptional regulator, LacI family  26.02 
 
 		 346 aa  123  5e-27  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0114429  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1559  alanine racemase  27.63 
 
 		 333 aa  122  8e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  decreased coverage  0.0000066632  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1883  transcriptional regulator, LacI family  30.7 
 
 		 350 aa  122  9.999999999999999e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.275447 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1461  transcriptional regulator, LacI family  26.49 
 
 		 333 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2079  transcriptional regulator, LacI family  29.17 
 
 		 341 aa  121  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.275805  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  30 
 
 		 353 aa  120  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  29.49 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  29.49 
 
 		 333 aa  119  7e-26  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1697  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 351 aa  119  7.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0499  LacI family transcription regulator  28.05 
 
 		 330 aa  119  9.999999999999999e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0169  transcriptional regulator, LacI family  32.13 
 
 		 377 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.042764  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13150  transcriptional regulator, LacI family  27.53 
 
 		 344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0091  LacI family transcription regulator  31.3 
 
 		 346 aa  117  1.9999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0549  Alanine racemase  33.71 
 
 		 340 aa  117  1.9999999999999998e-25  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.275696 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3470  transcriptional regulator, LacI family  31.9 
 
 		 331 aa  116  6e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1620  LacI family transcription regulator  31.88 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2790  LacI family transcription regulator  33.71 
 
 		 348 aa  115  1.0000000000000001e-24  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4877  transcriptional regulator, LacI family  30.9 
 
 		 346 aa  114  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  decreased coverage  0.00304627  normal  0.857214 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.57 
 
 		 336 aa  114  3e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0418  alanine racemase  27.92 
 
 		 338 aa  114  3e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.923997  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1550  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  28.48 
 
 		 328 aa  113  4.0000000000000004e-24  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000390905  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  29.46 
 
 		 368 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1600  LacI family transcription regulator  27.88 
 
 		 328 aa  112  1.0000000000000001e-23  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  29.45 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3252  transcriptional regulator, LacI family  31.34 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0513601 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2600  LacI family transcription regulator  29.22 
 
 		 349 aa  110  5e-23  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.383865  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3625  LacI family transcription regulator  30.51 
 
 		 351 aa  109  8.000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0480447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1744  transcriptional regulator, LacI family  29.29 
 
 		 336 aa  109  8.000000000000001e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0128  transcriptional regulator, LacI family  28.86 
 
 		 340 aa  108  9.000000000000001e-23  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.531775 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  27.43 
 
 		 341 aa  108  1e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1340  LacI family transcription regulator  26.1 
 
 		 337 aa  108  1e-22  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.00000460933  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2210  transcriptional regulator, LacI family  29.5 
 
 		 342 aa  108  1e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2733  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.4 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_01670  transcriptional regulator  27.17 
 
 		 348 aa  108  2e-22  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1547  LacI family transcription regulator  25.81 
 
 		 337 aa  108  2e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0111532  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0971  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.23 
 
 		 350 aa  107  2e-22  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0355372 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0285  alanine racemase  26.45 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0728  transcriptional regulator, LacI family  29.94 
 
 		 337 aa  106  5e-22  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.3979  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2999  transcriptional regulator, LacI family  25.37 
 
 		 336 aa  106  5e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  0.00000104253  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2046  LacI family transcription regulator  28.82 
 
 		 344 aa  106  6e-22  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3338  transcriptional regulator, LacI family  32.88 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.680798  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  26.25 
 
 		 341 aa  106  6e-22  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2751  transcriptional regulator, LacI family  30.59 
 
 		 335 aa  105  8e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.360192  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4888  LacI family transcription regulator  31.96 
 
 		 336 aa  105  8e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.630665  normal  0.338127 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0698  global transcriptional regulator, catabolite control protein A  28.76 
 
 		 330 aa  105  1e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0294  LacI family transcription regulator  26.69 
 
 		 335 aa  105  2e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.28119  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19800  transcriptional regulator, LacI family  25.44 
 
 		 336 aa  104  2e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2505  LacI family transcription regulator  25.29 
 
 		 342 aa  104  2e-21  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3985  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 338 aa  105  2e-21  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.610149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4933  transcriptional regulator, LacI family  33 
 
 		 339 aa  104  2e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0794709  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7027  LacI family transcription regulator  27.78 
 
 		 353 aa  104  2e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.777473  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3033  LacI family transcription regulator  28.95 
 
 		 351 aa  103  3e-21  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0352  transcriptional regulator, LacI family  33.43 
 
 		 347 aa  103  3e-21  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  decreased coverage  0.00162695  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1601  alanine racemase  27.06 
 
 		 337 aa  103  3e-21  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.520299  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0907  LacI family transcription regulator  31.23 
 
 		 341 aa  104  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.625918  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2659  transcriptional regulator, LacI family  31.21 
 
 		 339 aa  103  4e-21  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.34431  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8999  transcriptional regulator  31.03 
 
 		 361 aa  103  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.450526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0539  transcriptional regulator, LacI family  28.83 
 
 		 340 aa  103  5e-21  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13210  transcriptional regulator, LacI family  25.14 
 
 		 345 aa  103  6e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3319  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 337 aa  103  6e-21  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.419074  normal  0.0675752 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1344  transcriptional regulator, LacI family  29.56 
 
 		 365 aa  103  6e-21  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1972  DNA-binding transcriptional repressor EbgR  27.56 
 
 		 326 aa  103  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0103522 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2385  transcriptional regulator, LacI family  29.08 
 
 		 346 aa  103  6e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.171577  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0819  transcriptional regulator, LacI family  30.55 
 
 		 348 aa  102  9e-21  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3723  transcriptional regulator, LacI family  29.38 
 
 		 346 aa  102  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0543452  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1824  transcriptional regulator, LacI family  30.77 
 
 		 347 aa  101  1e-20  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.021809  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1929  LacI family transcription regulator  26.52 
 
 		 347 aa  102  1e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.959619  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1050  transcriptional regulator, LacI family  31.23 
 
 		 335 aa  101  1e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.107431  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15580  transcriptional regulator, LacI family  24.93 
 
 		 336 aa  101  1e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  26.01 
 
 		 339 aa  101  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2699  transcriptional regulator, LacI family  29.2 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0121  LacI family transcription regulator  27.01 
 
 		 335 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0425024  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3272  LacI family transcription regulator  28.65 
 
 		 352 aa  101  2e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1756  LacI family transcription regulator  29.71 
 
 		 370 aa  101  2e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0985  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.93 
 
 		 339 aa  101  2e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0961  transcriptional regulator, LacI family  28.27 
 
 		 359 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4293  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.1 
 
 		 342 aa  101  2e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.719683 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  31.64 
 
 		 357 aa  101  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3350  LacI family transcriptional regulator  30.92 
 
 		 364 aa  100  3e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1072  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  24.48 
 
 		 330 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4918  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3841  transcriptional regulator, LacI family  28.93 
 
 		 346 aa  100  3e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.455211 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0632  LacI family transcription regulator  25.65 
 
 		 344 aa  100  3e-20  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  26.47 
 
 		 339 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1790  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.65 
 
 		 337 aa  100  3e-20  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00351385  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02412  transcriptional regulator  30.99 
 
 		 343 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  27.38 
 
 		 386 aa  100  3e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  26.01 
 
 		 336 aa  100  3e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1262  LacI family transcription regulator  26.53 
 
 		 347 aa  100  4e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.00000000000350604  unclonable  0.0000000118995 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_23440  transcriptional regulator, LacI family  29.53 
 
 		 350 aa  100  4e-20  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.769589  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5764  transcriptional regulator LacI family  28.02 
 
 		 337 aa  100  5e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.73775  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2556  transcriptional regulator, LacI family  25.4 
 
 		 317 aa  99.8  5e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000904675  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01255  putative LacI-family transcriptional regulator  23.5 
 
 		 341 aa  100  5e-20  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  25.22 
 
 		 337 aa  99.8  7e-20  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4613  LacI family transcription regulator  29.15 
 
 		 335 aa  99.8  7e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.406396 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2557  LacI family transcriptional regulator  30.32 
 
 		 341 aa  99.4  8e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00000811694  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>