32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_2227 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_2227  hypothetical protein  100 
 
 		 429 aa  883    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.410036  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2008  hypothetical protein  91.84 
 
 		 429 aa  806    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.574447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0477  hypothetical protein  48.85 
 
 		 443 aa  392  1e-108  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.179646  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0919  hypothetical protein  46.76 
 
 		 435 aa  382  1e-105  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.432365  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0811  hypothetical protein  45.64 
 
 		 435 aa  379  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.563774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2717  hypothetical protein  46.08 
 
 		 432 aa  374  1e-102  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.452061 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0556  hypothetical protein  45.27 
 
 		 453 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.559091  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7591  hypothetical protein  45.35 
 
 		 449 aa  370  1e-101  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.29036  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2844  hypothetical protein  47.65 
 
 		 432 aa  364  1e-99  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2249  hypothetical protein  41.76 
 
 		 432 aa  320  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.121683  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2980  hypothetical protein  37.64 
 
 		 431 aa  265  8e-70  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.177531  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0362  hypothetical protein  31.04 
 
 		 437 aa  216  5e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0639849  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0799  hypothetical protein  32.33 
 
 		 468 aa  203  6e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7530  hypothetical protein  28.98 
 
 		 511 aa  166  5e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0869  hypothetical protein  29.25 
 
 		 477 aa  165  1.0000000000000001e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4788  hypothetical protein  26.81 
 
 		 461 aa  149  7e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.110982 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0933  hypothetical protein  29.31 
 
 		 473 aa  149  7e-35  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.509725  normal  0.298047 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0894  hypothetical protein  29.31 
 
 		 477 aa  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.889276  normal  0.647337 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4864  hypothetical protein  26.12 
 
 		 462 aa  144  3e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.739447 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5224  hypothetical protein  25.65 
 
 		 478 aa  118  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.313763  normal  0.0844208 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6382  hypothetical protein  25.64 
 
 		 482 aa  107  3e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.260621  normal  0.316539 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2084  hypothetical protein  31.45 
 
 		 549 aa  63.9  0.000000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0227  von Willebrand factor type A  31.21 
 
 		 436 aa  53.5  0.000007  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3346  von Willebrand factor type A  24.89 
 
 		 411 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.688988 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1938  putative signal peptide protein  42.31 
 
 		 126 aa  50.8  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.608545 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2738  von Willebrand factor type A  24.61 
 
 		 419 aa  49.7  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3648  hypothetical protein  29.32 
 
 		 400 aa  47.4  0.0005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2274  hypothetical protein  27.88 
 
 		 666 aa  47  0.0006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.378789  normal  0.805615 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1104  hypothetical protein  26.04 
 
 		 483 aa  46.6  0.0008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4760  hypothetical protein  26.67 
 
 		 390 aa  45.8  0.001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.636154  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3057  hypothetical protein  25.26 
 
 		 464 aa  44.3  0.004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1697  hypothetical protein  24.84 
 
 		 605 aa  43.5  0.007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0623596  normal  0.82432 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>