More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_1135 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011989  Avi_0076  myo-inositol catabolism IolC protein  55.36 
 
 
634 aa  710    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3547  ribokinase-like domain-containing protein  53 
 
 
646 aa  640    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2413  PfkB domain protein  60.45 
 
 
642 aa  788    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2315  ribokinase-like domain-containing protein  54.04 
 
 
636 aa  642    Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7803  PfkB domain protein  53.72 
 
 
640 aa  644    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3562  ribokinase-like domain-containing protein  70.03 
 
 
655 aa  913    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.249096 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3837  ribokinase-like domain-containing protein  55.5 
 
 
633 aa  691    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.27619  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1135  PfkB domain protein  100 
 
 
644 aa  1313    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.488845 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0982  PfkB domain protein  97.05 
 
 
644 aa  1276    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1676  ribokinase-like domain-containing protein  52.96 
 
 
635 aa  633  1e-180  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20646  normal  0.588931 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50040  myo-inositol catabolism protein IolC  50.39 
 
 
647 aa  607  9.999999999999999e-173  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1341  PfkB domain protein  47.87 
 
 
634 aa  598  1e-170  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1594  ribokinase-like domain-containing protein  46.42 
 
 
652 aa  597  1e-169  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2996  Protein of unknown function DUF2090  47.72 
 
 
634 aa  592  1e-168  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0303  myo-inositol catabolism protein  47.24 
 
 
636 aa  594  1e-168  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1326  putative myo-inositol catabolism LolC protein  46.57 
 
 
680 aa  590  1e-167  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2809  PfkB domain protein  46.42 
 
 
681 aa  590  1e-167  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.760381  normal  0.234684 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4711  PfkB domain protein  47.34 
 
 
643 aa  587  1e-166  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.00995478  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1600  ribokinase-like domain-containing protein  45.04 
 
 
670 aa  586  1e-166  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161608  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3500  iolC protein  47.4 
 
 
645 aa  578  1.0000000000000001e-163  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.782212  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4660  ribokinase-like domain-containing protein  47.72 
 
 
642 aa  577  1.0000000000000001e-163  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3274  carbohydrate kinase, PfkB  47.17 
 
 
645 aa  571  1e-161  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0475711  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3334  PfkB domain protein  45.37 
 
 
647 aa  565  1e-160  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2647  iolC protein  47.75 
 
 
666 aa  563  1.0000000000000001e-159  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146165  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3041  ribokinase-like domain-containing protein  45.53 
 
 
656 aa  560  1e-158  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1655  iolC protein  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0913  iolC protein  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1831  iolC protein  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-157  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.463805  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0726  iolC protein  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.179784  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2969  PfkB family kinase  45.21 
 
 
654 aa  556  1e-157  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1444  iolC protein  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.640476  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0436  iolC protein  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-157  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.171756  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1677  iolC protein  48.04 
 
 
666 aa  555  1e-156  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1870  PfkB family kinase  45.31 
 
 
625 aa  551  1e-155  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.0201058 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1728  PfkB  45.24 
 
 
645 aa  547  1e-154  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.371371  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0985  ribokinase-like domain-containing protein  44.96 
 
 
659 aa  531  1e-149  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.570475 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1240  transferase kinase protein  45.2 
 
 
650 aa  526  1e-148  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3314  ribokinase-like domain-containing protein  44.11 
 
 
646 aa  520  1e-146  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0941  PfkB  44.77 
 
 
651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00555431  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1401  ribokinase-like domain-containing protein  44.93 
 
 
651 aa  518  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1423  ribokinase-like domain-containing protein  44.77 
 
 
651 aa  516  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.693668  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4567  PfkB family carbohydrate kinase  44.77 
 
 
652 aa  512  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1342  ribokinase-like domain-containing protein  44.62 
 
 
651 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1303  ribokinase-like domain-containing protein  44.46 
 
 
651 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0065  ribokinase-like domain-containing protein  42.75 
 
 
674 aa  496  1e-139  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1892  ribokinase-like domain-containing protein  44.62 
 
 
651 aa  494  9.999999999999999e-139  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.333312 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3703  PfkB  38.35 
 
 
630 aa  419  1e-116  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830468  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1622  hypothetical protein  39.39 
 
 
628 aa  280  9e-74  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1617  hypothetical protein  38.83 
 
 
628 aa  277  5e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5700  PfkB domain protein  33.62 
 
 
335 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.738338  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1697  PfkB domain-containing protein  35.65 
 
 
337 aa  172  1e-41  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0662  PfkB domain-containing protein  33.33 
 
 
327 aa  161  4e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.478793  normal  0.638402 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0300  myo-inositol catabolism protein  32.04 
 
 
332 aa  157  4e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2333  iolC protein  31.86 
 
 
332 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2296  myo-inositol catabolism protein  32.14 
 
 
332 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.192741  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2252  carbohydrate kinase; myo-inositol catabolism protein  31.86 
 
 
332 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.608064  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2512  myo-inositol catabolism protein IolC  31.86 
 
 
332 aa  157  5.0000000000000005e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0082  myo-inositol catabolism protein IolC  31.27 
 
 
338 aa  150  1.0000000000000001e-34  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3455  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 
326 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.84523  normal  0.0336691 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3605  PfkB domain protein  31.55 
 
 
336 aa  142  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0937  PfkB domain protein  30.47 
 
 
338 aa  141  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4404  ribokinase-like domain-containing protein  29.76 
 
 
322 aa  141  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.168915  normal  0.135313 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0820  ribokinase-like domain-containing protein  29.97 
 
 
364 aa  140  4.999999999999999e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.501006  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5449  PfkB domain protein  31.4 
 
 
312 aa  139  1e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.443082  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19960  PfkB domain protein  26.49 
 
 
323 aa  139  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1268  PfkB domain protein  30.98 
 
 
333 aa  138  4e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.63046  normal  0.760626 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4016  ribokinase-like domain-containing protein  31.78 
 
 
322 aa  135  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.213483 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0725  PfkB domain protein  31.02 
 
 
322 aa  134  6e-30  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4018  PfkB domain protein  29 
 
 
338 aa  132  2.0000000000000002e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00301504  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2602  ribokinase-like domain-containing protein  30.96 
 
 
323 aa  130  5.0000000000000004e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.386766  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2742  PfkB domain protein  31.45 
 
 
320 aa  129  2.0000000000000002e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.118303  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4488  PfkB domain protein  30.12 
 
 
314 aa  127  8.000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.3303  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1803  ribokinase-like domain-containing protein  30.11 
 
 
349 aa  127  8.000000000000001e-28  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal  0.453248 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4542  PfkB domain protein  30.36 
 
 
317 aa  126  1e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1214  ribokinase-like domain-containing protein  30.28 
 
 
329 aa  126  1e-27  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3349  PfkB  30.18 
 
 
324 aa  125  4e-27  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0814732  normal  0.201328 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0389  PfkB  23.88 
 
 
323 aa  122  1.9999999999999998e-26  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.211683  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1419  PfkB  29.66 
 
 
326 aa  122  3e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204315  normal  0.109001 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8494  ribokinase-like domain-containing protein  29.57 
 
 
321 aa  121  3.9999999999999996e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.813332  normal  0.57227 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1365  PfkB domain protein  32.31 
 
 
321 aa  121  4.9999999999999996e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3078  PfkB domain-containing protein  29.75 
 
 
314 aa  120  9e-26  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3414  PfkB domain protein  29.79 
 
 
317 aa  118  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5563  ribokinase-like domain-containing protein  28.96 
 
 
320 aa  117  5e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4189  PfkB domain protein  29.7 
 
 
317 aa  115  2.0000000000000002e-24  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1737  PfkB  30.06 
 
 
314 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.482727  normal  0.803501 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1119  ribokinase-like domain-containing protein  25.51 
 
 
322 aa  113  9e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18220  Fructokinase  30.39 
 
 
320 aa  113  1.0000000000000001e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.749798  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3707  ribokinase-like domain-containing protein  28.36 
 
 
319 aa  112  3e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.973516 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4188  hypothetical protein  30.93 
 
 
290 aa  110  6e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7727  ribokinase-like domain-containing protein  30.56 
 
 
314 aa  110  1e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0954  PfkB domain protein  24.85 
 
 
321 aa  109  2e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.102628  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1253  ribokinase-like domain-containing protein  28.27 
 
 
320 aa  109  2e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0781765  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3559  ribokinase-like domain-containing protein  30.13 
 
 
340 aa  109  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2278  PfkB domain protein  29.03 
 
 
327 aa  107  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.741137  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6848  PfkB domain protein  29.85 
 
 
323 aa  107  6e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.71176  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1980  sugar (2-ketogluconate) kinase  28.91 
 
 
327 aa  107  7e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0210202 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3755  PfkB domain protein  29.97 
 
 
307 aa  106  2e-21  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0212856  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000598  fructokinase  27.54 
 
 
337 aa  105  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00217717  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1526  ribokinase-like domain-containing protein  28.15 
 
 
328 aa  104  5e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.198304  normal  0.764115 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0615  PfkB  28.12 
 
 
317 aa  102  1e-20  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>