More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0956 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012850  Rleg_0956  adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 		 401 aa  803    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0836  adenylate/guanylate cyclase  91.77 
 
 		 401 aa  741    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.805634 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0018  adenylate/guanylate cyclase  55.5 
 
 		 420 aa  414  1e-114  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0171686 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3993  putative adenylate/guanylate cyclase  54.55 
 
 		 388 aa  398  9.999999999999999e-111  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.339564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0574  adenylate/guanylate cyclase  38.99 
 
 		 396 aa  239  4e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6772  adenylate/guanylate cyclase  38.38 
 
 		 416 aa  231  2e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.942447  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7519  adenylate/guanylate cyclase  37.53 
 
 		 426 aa  230  4e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.156263  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0582  adenylate/guanylate cyclase  39.34 
 
 		 425 aa  226  7e-58  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0247859  hitchhiker  0.00751197 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0617  adenylate/guanylate cyclase  37.68 
 
 		 424 aa  216  4e-55  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.654981  normal  0.11859 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0606  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  37.68 
 
 		 466 aa  216  5e-55  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.387711  normal  0.106969 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  37.17 
 
 		 421 aa  216  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  36.01 
 
 		 410 aa  215  9e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2471  adenylate/guanylate cyclase  38.64 
 
 		 391 aa  214  1.9999999999999998e-54  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5435  hypothetical protein  35.58 
 
 		 404 aa  209  9e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.423535  normal  0.185404 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1213  adenylate/guanylate cyclase  35.88 
 
 		 399 aa  208  1e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.782915  normal  0.51515 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1395  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 399 aa  205  1e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0858263  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  34.28 
 
 		 407 aa  196  5.000000000000001e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5268  adenylate/guanylate cyclase  36.36 
 
 		 379 aa  183  4.0000000000000006e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0287319  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0854  adenylate/guanylate cyclase  31.32 
 
 		 464 aa  169  1e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  33.78 
 
 		 411 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.78 
 
 		 411 aa  166  8e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0773  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  32.88 
 
 		 465 aa  160  3e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0986  adenylate/guanylate cyclase  33.42 
 
 		 400 aa  160  5e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0675159  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  33.16 
 
 		 427 aa  159  1e-37  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2375  adenylate/guanylate cyclase  33.43 
 
 		 348 aa  158  2e-37  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.165554  decreased coverage  0.00302475 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2654  adenylate/guanylate cyclase  29.58 
 
 		 517 aa  157  2e-37  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3196  adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 		 406 aa  158  2e-37  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4661  putative adenylate/guanylate cyclase  30.79 
 
 		 424 aa  150  4e-35  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.249101  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3770  adenylate/guanylate cyclase  28.64 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.154148  normal  0.656684 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4896  putative adenylate/guanylate cyclase  27.5 
 
 		 401 aa  147  3e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.549571 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2619  adenylate/guanylate cyclase  33.24 
 
 		 381 aa  147  3e-34  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.556471 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2756  putative adenylate/guanylate cyclase  31.76 
 
 		 406 aa  147  4.0000000000000006e-34  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3482  adenylate/guanylate cyclase  28.25 
 
 		 405 aa  146  8.000000000000001e-34  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.285449  normal  0.641305 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  43.66 
 
 		 367 aa  144  2e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  41.9 
 
 		 370 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2682  adenylate/guanylate cyclase  39.91 
 
 		 367 aa  136  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_7122  putative adenylate/guanylate cyclase  28.24 
 
 		 447 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.526481  normal  0.239769 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5969  putative adenylate/guanylate cyclase  27.85 
 
 		 447 aa  126  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.552237  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5605  adenylate cyclase  26.2 
 
 		 450 aa  119  9.999999999999999e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4590  putative adenylate/guanylate cyclase  25.65 
 
 		 494 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0480836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5021  adenylate/guanylate cyclase  29.04 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1110  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 348 aa  98.2  2e-19  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0224811  normal  0.236606 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1583  adenylate/guanylate cyclase  36.41 
 
 		 483 aa  98.2  2e-19  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000000336338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3621  putative adenylate/guanylate cyclase  32.73 
 
 		 607 aa  97.8  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1295  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  26.02 
 
 		 584 aa  97.4  4e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1264  adenylate/guanylate cyclase with GAF sensor(s)  25.78 
 
 		 584 aa  96.3  8e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  33.71 
 
 		 859 aa  94.4  3e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1795  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  33.17 
 
 		 440 aa  94.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  hitchhiker  0.000135307  normal  0.424488 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  28.51 
 
 		 483 aa  93.6  5e-18  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0671  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.78 
 
 		 500 aa  94  5e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0415363  normal  0.502054 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  28.51 
 
 		 483 aa  93.6  6e-18  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2534  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.41 
 
 		 764 aa  92  2e-17  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.263424  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00483  adenylate cyclase  32.09 
 
 		 358 aa  91.7  2e-17  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1100  putative adenylate/guanylate cyclase  29.77 
 
 		 479 aa  91.3  3e-17  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1430  adenylate/guanylate cyclase  35.56 
 
 		 1160 aa  90.9  4e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0380252  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0663  putative adenylate/guanylate cyclase  31.33 
 
 		 632 aa  90.5  4e-17  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.389437  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1894  putative Chase2 sensor protein  36.02 
 
 		 729 aa  90.5  4e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0276882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0613  adenylate/guanylate cyclase  32.43 
 
 		 586 aa  90.5  4e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.0360418  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0078  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  34.67 
 
 		 585 aa  90.9  4e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0981996 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1763  putative Chase2 sensor protein  30.6 
 
 		 725 aa  90.1  6e-17  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.544846  normal  0.0880592 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3744  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  32.22 
 
 		 858 aa  89.7  7e-17  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  33.76 
 
 		 741 aa  89.4  1e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0400  adenylate/guanylate cyclase  33.53 
 
 		 864 aa  89  1e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4645  adenylate/guanylate cyclase  29.94 
 
 		 546 aa  88.2  2e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.98897  normal  0.0884819 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  33.9 
 
 		 699 aa  88.2  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0647  adenylate/guanylate cyclase  27.31 
 
 		 911 aa  89  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.707555  normal  0.864231 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5302  putative adenylate cyclase  34.27 
 
 		 431 aa  88.2  2e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0714229 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3735  adenylate/guanylate cyclase  29.73 
 
 		 860 aa  87.8  3e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0169064  normal  0.419577 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1406  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  32.04 
 
 		 757 aa  87.8  3e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.9726 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  35.08 
 
 		 645 aa  87.4  4e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3153  adenylate/guanylate cyclase  29.32 
 
 		 759 aa  87.4  4e-16  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.79 
 
 		 656 aa  87  5e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3501  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.85 
 
 		 652 aa  87  5e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.703236  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.28 
 
 		 672 aa  86.3  9e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0401  adenylate/guanylate cyclase catalytic domain-containing protein  36.62 
 
 		 797 aa  85.9  0.000000000000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.173302  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp1446  hypothetical protein  27.31 
 
 		 441 aa  85.9  0.000000000000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5181  putative adenylate/guanylate cyclase  38.2 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.0517978 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4795  adenylate/guanylate cyclase  38.2 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4881  putative adenylate/guanylate cyclase  38.2 
 
 		 528 aa  85.9  0.000000000000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.0270875 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3665  adenylate/guanylate cyclase  31.07 
 
 		 439 aa  84.7  0.000000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.125818  normal  0.715111 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3090  putative Chase2 sensor protein  30.85 
 
 		 614 aa  85.5  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1823  putative adenylate/guanylate cyclase  29.91 
 
 		 462 aa  85.5  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.534836  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0494  adenylate/guanylate cyclase  37.5 
 
 		 364 aa  85.1  0.000000000000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0343  transmembrane sensor-like domain-containing protein  33.33 
 
 		 638 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4085  adenylate/guanylate cyclase  33.11 
 
 		 746 aa  85.5  0.000000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.104935 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2413  GAF/PAS/PAC sensor-containing adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 		 861 aa  85.5  0.000000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3163  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  31.03 
 
 		 643 aa  84.7  0.000000000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2346  CHASE2 domain-containing protein  28.27 
 
 		 760 aa  84.7  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.285183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2176  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  28.91 
 
 		 662 aa  84.3  0.000000000000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.249495  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2575  adenylate/guanylate cyclase  31.15 
 
 		 740 aa  84  0.000000000000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0521558  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2169  adenylate/guanylate cyclase  30.37 
 
 		 756 aa  84  0.000000000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0505849  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0163  adenylate/guanylate cyclase  36.52 
 
 		 469 aa  84.3  0.000000000000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0163377  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2239  adenylate/guanylate cyclase  31.05 
 
 		 1156 aa  84  0.000000000000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.159061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_22620  hypothetical protein  31.02 
 
 		 463 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.438633  hitchhiker  0.00108909 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  29.03 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1908  hypothetical protein  31.02 
 
 		 446 aa  83.6  0.000000000000006  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.798697  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.86 
 
 		 650 aa  83.6  0.000000000000006  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1538  hypothetical protein  26.51 
 
 		 431 aa  83.2  0.000000000000008  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4585  adenylate/guanylate cyclase  30.11 
 
 		 744 aa  83.2  0.000000000000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0862409  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0730  hypothetical protein  31.41 
 
 		 437 aa  82.8  0.000000000000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>