More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0933 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_1918  ABC transporter related  66.21 
 
 
506 aa  693    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0933  ABC transporter related  100 
 
 
508 aa  1025    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2505  ABC transporter related  69.64 
 
 
506 aa  727    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0820  ABC transporter related  93.45 
 
 
506 aa  957    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231233  normal  0.570609 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2771  ABC transporter related  36.74 
 
 
578 aa  270  7e-71  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.512603  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2529  ABC transporter-related protein  36.86 
 
 
571 aa  267  2.9999999999999995e-70  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377308  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2048  ABC transporter related  36.27 
 
 
569 aa  265  2e-69  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.671831 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7259  ABC transporter ATPase  34.98 
 
 
574 aa  260  4e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  33.4 
 
 
714 aa  213  7.999999999999999e-54  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.81 
 
 
644 aa  211  2e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  31.04 
 
 
643 aa  211  2e-53  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  31.91 
 
 
641 aa  209  1e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  31.81 
 
 
643 aa  208  2e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  34.57 
 
 
618 aa  208  2e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  30.19 
 
 
638 aa  206  1e-51  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  31.87 
 
 
643 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  31.87 
 
 
643 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  31.87 
 
 
643 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  32.06 
 
 
646 aa  203  6e-51  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  31.23 
 
 
657 aa  203  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  32.25 
 
 
640 aa  203  7e-51  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  29.47 
 
 
532 aa  203  8e-51  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  31.54 
 
 
650 aa  202  8e-51  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  30.04 
 
 
532 aa  202  8e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  31.59 
 
 
615 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  31.68 
 
 
643 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  31.59 
 
 
615 aa  201  3e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
646 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
646 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
646 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.19 
 
 
649 aa  201  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  31.23 
 
 
646 aa  201  3e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  31.49 
 
 
643 aa  200  3.9999999999999996e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  32.04 
 
 
642 aa  200  5e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3394  ABC transporter related  32.17 
 
 
575 aa  200  5e-50  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.232814 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 
646 aa  200  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 
646 aa  199  7e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  30.35 
 
 
546 aa  199  7e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  32.21 
 
 
669 aa  199  9e-50  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  29.68 
 
 
535 aa  199  1.0000000000000001e-49  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  32.02 
 
 
636 aa  199  1.0000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0224  ABC transporter, ATP-binding protein  29.94 
 
 
663 aa  198  2.0000000000000003e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0722  ABC transporter-like  31.76 
 
 
564 aa  198  2.0000000000000003e-49  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.112137  normal  0.972889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  30.69 
 
 
647 aa  197  5.000000000000001e-49  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0130  ABC transporter related  29.59 
 
 
685 aa  196  6e-49  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.906602  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  32.63 
 
 
643 aa  196  6e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  31.17 
 
 
646 aa  196  6e-49  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  33.27 
 
 
691 aa  196  7e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1937  ABC transporter related  31.63 
 
 
628 aa  196  8.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.832952 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  31.33 
 
 
660 aa  195  1e-48  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_200  ABC transporter, ATP-binding protein  29.64 
 
 
663 aa  195  2e-48  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  31.19 
 
 
615 aa  195  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  31.81 
 
 
646 aa  195  2e-48  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  30.41 
 
 
634 aa  193  7e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0324  ABC transporter related  30.36 
 
 
659 aa  193  7e-48  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843371  normal  0.526275 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0279  ABC transporter related  32.02 
 
 
673 aa  192  8e-48  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2351  ABC transpoter ATPase  29.65 
 
 
650 aa  192  1e-47  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  30.87 
 
 
633 aa  192  1e-47  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0945  ABC transporter related  30.69 
 
 
580 aa  192  1e-47  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0877  ABC transporter, ATP-binding protein  30.49 
 
 
636 aa  191  2e-47  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0902951  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1237  ABC transporter ATPase  29.72 
 
 
639 aa  191  2e-47  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0857839  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  27.34 
 
 
545 aa  191  2.9999999999999997e-47  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  26.52 
 
 
536 aa  191  2.9999999999999997e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  32.63 
 
 
633 aa  191  2.9999999999999997e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  29.66 
 
 
645 aa  191  4e-47  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0250  ATPase  31.11 
 
 
662 aa  191  4e-47  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  31.05 
 
 
624 aa  191  4e-47  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  28.36 
 
 
637 aa  189  8e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2338  ABC transporter related protein  32.56 
 
 
635 aa  189  1e-46  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3740  ABC transporter related  29.92 
 
 
667 aa  189  1e-46  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.345281  hitchhiker  0.00604484 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  31.98 
 
 
615 aa  189  1e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  30.89 
 
 
625 aa  189  1e-46  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  26.58 
 
 
541 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0310  ABC transporter related  30.26 
 
 
649 aa  189  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  28.03 
 
 
659 aa  188  2e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  30.42 
 
 
687 aa  188  2e-46  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  28.44 
 
 
544 aa  187  3e-46  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  26.77 
 
 
541 aa  187  3e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3501  ABC transporter related  31.02 
 
 
656 aa  187  3e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0678  ABC transporter related  30.58 
 
 
657 aa  187  4e-46  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  26.83 
 
 
641 aa  187  5e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0594  ABC transporter related protein  30.58 
 
 
767 aa  186  6e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  30.95 
 
 
565 aa  186  6e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3284  ABC transporter related  31.03 
 
 
636 aa  186  8e-46  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2609  ABC transporter-like  29.48 
 
 
528 aa  186  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.195276 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  29.66 
 
 
651 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3897  ABC transporter related  31.68 
 
 
613 aa  185  1.0000000000000001e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2480  ABC transporter-related protein  30.81 
 
 
676 aa  185  1.0000000000000001e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.404041  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6057  ABC transporter related protein  30.71 
 
 
688 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  31.2 
 
 
659 aa  184  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  31.61 
 
 
676 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0241  ABC transporter related  29.17 
 
 
658 aa  185  2.0000000000000003e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.348865  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0312  ABC transporter, ATP-binding protein  29.87 
 
 
644 aa  184  2.0000000000000003e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0790869  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1158  ABC transporter ATPase  30.72 
 
 
635 aa  184  2.0000000000000003e-45  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5031  ABC transporter, ATP-binding protein  29.17 
 
 
644 aa  184  3e-45  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0210373  normal  0.641963 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0067  ABC transporter related  30.99 
 
 
581 aa  184  3e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0593  ABC transporter-related protein  30.96 
 
 
636 aa  184  3e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.40682 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1808  ABC transporter related  29.8 
 
 
672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.762366 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  28.14 
 
 
630 aa  184  4.0000000000000006e-45  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2996  ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 
635 aa  184  5.0000000000000004e-45  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>