More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smed_2505 on replicon NC_009636
Organism: Sinorhizobium medicae WSM419



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009667  Oant_1918  ABC transporter related  62.7 
 
 		 506 aa  649    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2505  ABC transporter related  100 
 
 		 506 aa  1013    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.222915 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0933  ABC transporter related  69.64 
 
 		 508 aa  727    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0820  ABC transporter related  68.86 
 
 		 506 aa  716    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.231233  normal  0.570609 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7259  ABC transporter ATPase  34.97 
 
 		 574 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2529  ABC transporter-related protein  35.36 
 
 		 571 aa  269  8.999999999999999e-71  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.377308  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2048  ABC transporter related  36.17 
 
 		 569 aa  268  2e-70  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.671831 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2771  ABC transporter related  35.16 
 
 		 578 aa  262  1e-68  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.512603  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0929  ABC transporter related  32.58 
 
 		 714 aa  221  3e-56  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.526225  normal  0.675301 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1349  ABC transporter related  33.86 
 
 		 618 aa  206  8e-52  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.238944 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1024  hypothetical protein  30.21 
 
 		 535 aa  206  1e-51  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002950  PG2199  ABC transporter, ATP-binding protein, putative  31.03 
 
 		 645 aa  205  2e-51  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1820  ABC transporter related  32.68 
 
 		 615 aa  205  2e-51  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.273612  normal  0.489617 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0324  ABC transporter related  31.37 
 
 		 659 aa  201  1.9999999999999998e-50  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.843371  normal  0.526275 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1404  ABC transporter-related protein  31.67 
 
 		 640 aa  201  1.9999999999999998e-50  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0880457  normal  0.193066 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0093  ABC transporter ATP-binding protein  27.2 
 
 		 536 aa  200  3.9999999999999996e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.785822  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1763  ABC transporter, ATP-binding protein  29.31 
 
 		 546 aa  200  5e-50  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.208486  normal  0.0362941 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2696  ABC transporter related  32.55 
 
 		 659 aa  200  6e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2727  ABC transporter related  30.51 
 
 		 649 aa  198  2.0000000000000003e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.26231  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2473  ABC transporter related  31.31 
 
 		 650 aa  198  2.0000000000000003e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000325943 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_01021  ABC transporter, ATP binding component  27.81 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.663375  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_01041  ABC transporter, ATP binding component  27.57 
 
 		 541 aa  198  2.0000000000000003e-49  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.15596  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1539  ABC transporter related  32.68 
 
 		 615 aa  196  7e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.176229  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2895  putative ABC transporter, fused ATPase subunits  32.68 
 
 		 615 aa  196  8.000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1241  ABC transporter related  32.25 
 
 		 643 aa  196  9e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1265  ABC transporter related  28.31 
 
 		 638 aa  196  1e-48  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.870161 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1664  ABC transporter ATP-binding protein  30.93 
 
 		 657 aa  195  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0247067 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1126  ABC transporter related  32.87 
 
 		 642 aa  195  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0852453 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1347  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 646 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3237  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 646 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.660205  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1572  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 646 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.50284  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1930  ABC transporter related  30.58 
 
 		 643 aa  194  3e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2075  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 646 aa  194  3e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.491633  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2455  ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 		 646 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.242369  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0741  ABC transporter related  27.87 
 
 		 545 aa  193  6e-48  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0595182  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0402  ABC transporter ATPase  29.72 
 
 		 643 aa  193  6e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.930478  hitchhiker  0.0019806 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2511  ABC transporter, ATP-binding protein  30.86 
 
 		 646 aa  193  6e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.271255  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2010  ABC transporter, ATP-binding protein  31.55 
 
 		 646 aa  192  1e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.146801  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2055  ABC transporter related  31.42 
 
 		 643 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.035925  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6041  ABC transporter related  31.42 
 
 		 643 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2036  ABC transporter related  31.42 
 
 		 643 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.252943  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5345  ABC transporter, fused ATPase subunits  31.61 
 
 		 643 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.249552 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0378  ABC transporter related  28.96 
 
 		 630 aa  191  2.9999999999999997e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0506  ABC transporter related  32.94 
 
 		 691 aa  191  2.9999999999999997e-47  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2068  ABC transporter related  31.42 
 
 		 643 aa  191  4e-47  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1860  ABC transporter related  28.47 
 
 		 637 aa  190  5e-47  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.155598  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2600  ABC transporter, ATP-binding protein  30.67 
 
 		 646 aa  190  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0562857  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0954  ABC transporter related  31.8 
 
 		 633 aa  189  9e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2203  ABC transporter related  31.04 
 
 		 669 aa  189  1e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_01001  ABC transporter, ATP binding component  27.43 
 
 		 540 aa  189  1e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1761  ABC transporter related  30.45 
 
 		 647 aa  189  1e-46  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0222  ABC transporter related  29.07 
 
 		 644 aa  188  2e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3997  ABC transporter related  31.24 
 
 		 641 aa  187  4e-46  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2041  ABC transporter related  29.41 
 
 		 651 aa  187  4e-46  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1376  ABC transporter ATP-binding protein  30.83 
 
 		 676 aa  187  5e-46  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.636737  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2884  ABC transporter related  28.57 
 
 		 634 aa  187  5e-46  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.314966  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1075  ABC transporter related  30.56 
 
 		 627 aa  186  6e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000840512 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1743  ABC transporter related  30.75 
 
 		 633 aa  187  6e-46  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0202205 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0168  ABC transporter ATP-binding protein  29.09 
 
 		 532 aa  187  6e-46  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.508364  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1937  ABC transporter related  31.29 
 
 		 628 aa  186  7e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.832952 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3480  ABC transporter related  31.06 
 
 		 634 aa  186  7e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549576 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1355  ABC transporter related  30.25 
 
 		 646 aa  186  9e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.195008  normal  0.583297 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1249  ABC transporter related  30.89 
 
 		 645 aa  186  1.0000000000000001e-45  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0840692  normal  0.705767 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_4007  ABC transporter related protein  27.21 
 
 		 641 aa  186  1.0000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0167  ABC transporter related protein  31.27 
 
 		 624 aa  186  1.0000000000000001e-45  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.692888  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2379  ABC transporter related  29.32 
 
 		 660 aa  186  1.0000000000000001e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2470  ABC transporter related  31.03 
 
 		 620 aa  184  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0276149  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3136  ABC transporter related  31.28 
 
 		 644 aa  184  2.0000000000000003e-45  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A2156  ABC transporter, ATP-binding protein  28.71 
 
 		 532 aa  185  2.0000000000000003e-45  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2217  ABC transporter related  30.52 
 
 		 565 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1101  ABC transporter related protein  29.14 
 
 		 641 aa  184  3e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2596  ABC transporter related  30.57 
 
 		 627 aa  184  3e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0581  ABC transporter related  32.23 
 
 		 647 aa  184  3e-45  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0247  ABC transporter-related protein  29.4 
 
 		 659 aa  184  4.0000000000000006e-45  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2424  ABC transporter related  31.48 
 
 		 672 aa  184  4.0000000000000006e-45  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0758588 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2351  ABC transpoter ATPase  28.91 
 
 		 650 aa  183  8.000000000000001e-45  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.683326 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4548  ABC transporter related protein  29.57 
 
 		 644 aa  183  8.000000000000001e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.550971 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1315  ABC transporter related  31.47 
 
 		 692 aa  182  1e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.199616  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0692  ABC transporter, ATP-binding protein  30.42 
 
 		 627 aa  181  2e-44  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.242868  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1233  ABC transporter related  31.03 
 
 		 659 aa  182  2e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.632204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0061  ABC transporter related  30.71 
 
 		 635 aa  182  2e-44  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.234701 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2170  ABC transporter component  31.62 
 
 		 645 aa  181  2e-44  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1992  ABC transporter related  28.36 
 
 		 678 aa  181  2e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1747  ABC transporter related  32.25 
 
 		 615 aa  181  2e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.219257  normal  0.123618 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0690  ABC transporter related  31.83 
 
 		 636 aa  181  2.9999999999999997e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0683  ABC transporter, ATP-binding protein  30.62 
 
 		 640 aa  181  2.9999999999999997e-44  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2715  ABC transporter related  28.6 
 
 		 650 aa  181  2.9999999999999997e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0106  ABC transporter related  26.62 
 
 		 544 aa  181  2.9999999999999997e-44  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01943  ABC transporter ATP-binding protein  30.77 
 
 		 630 aa  181  2.9999999999999997e-44  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1220  ABC transporter related  30.16 
 
 		 627 aa  180  4e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000289587 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1754  ABC transporter related  29.81 
 
 		 625 aa  180  4e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.544165  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2729  ABC transporter, ATPase subunit  31.05 
 
 		 635 aa  180  4.999999999999999e-44  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3608  ABC transporter related  28.91 
 
 		 687 aa  180  5.999999999999999e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.100909  normal  0.0123712 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1649  ABC transporter related  32.22 
 
 		 642 aa  180  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1808  ABC transporter related  29.1 
 
 		 672 aa  179  8e-44  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.762366 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4309  ABC transporter ATP-binding protein  29.5 
 
 		 540 aa  179  8e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.167754 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1367  ABC transporter, ATP-binding protein  31.46 
 
 		 634 aa  179  1e-43  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1894  ABC transporter related  29.25 
 
 		 656 aa  179  1e-43  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0716  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  29.56 
 
 		 541 aa  178  2e-43  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3138  ABC transporter related  30.4 
 
 		 621 aa  178  2e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00577211  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>