More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_0797 on replicon NC_012850
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012850  Rleg_0797  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  100 
 
 
158 aa  330  3e-90  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0700  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  91.72 
 
 
157 aa  297  4e-80  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.192591  normal  0.865877 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0944  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.95 
 
 
160 aa  138  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.91853  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5084  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  45.16 
 
 
163 aa  134  7.000000000000001e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.326252  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2704  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.05 
 
 
158 aa  128  3e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.426066  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1141  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.67 
 
 
174 aa  126  9.000000000000001e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.935538  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2065  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  43.14 
 
 
240 aa  121  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.448828  normal  0.178855 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3962  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.67 
 
 
158 aa  114  3.9999999999999997e-25  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1094  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.67 
 
 
166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2431  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.33 
 
 
194 aa  110  6e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2730  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.42 
 
 
169 aa  110  6e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  38 
 
 
170 aa  109  1.0000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.598256  normal  0.775972 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1491  putative cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  40.67 
 
 
180 aa  109  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0201643  normal  0.443288 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2127  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.08 
 
 
168 aa  109  2.0000000000000002e-23  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4186  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.56 
 
 
180 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0842  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  39.47 
 
 
178 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2635  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40 
 
 
180 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.824071 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1137  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.07 
 
 
171 aa  107  5e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1995  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  40.94 
 
 
158 aa  105  2e-22  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.410686 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0774  hypothetical protein  39.33 
 
 
166 aa  104  6e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  decreased coverage  0.00906515  normal 
 
 
-
 
NC_002950  PG1728  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  50 
 
 
150 aa  103  7e-22  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0120  cytosine/adenosine deaminase-like  46.79 
 
 
161 aa  103  1e-21  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.585423  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2118  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  35.86 
 
 
174 aa  102  3e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.154407  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4568  cytosine/adenosine deaminase  46.61 
 
 
141 aa  101  4e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0674269 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3645  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  36.49 
 
 
156 aa  101  4e-21  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.174881  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2056  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.33 
 
 
169 aa  100  7e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.0971976  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3970  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.79 
 
 
176 aa  99.8  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.440685  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3057  dCMP deaminase  46 
 
 
157 aa  99.4  2e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.876762  normal  0.403626 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1094  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  43.24 
 
 
119 aa  99  2e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3453  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  43.54 
 
 
157 aa  98.2  3e-20  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4330  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.81 
 
 
163 aa  96.3  1e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.278025  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2072  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  39.1 
 
 
154 aa  95.5  2e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.466878  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2902  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.42 
 
 
157 aa  94.7  4e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000164713  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0109  cytosine/adenosine deaminase  35.76 
 
 
148 aa  94.7  4e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.329241 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2797  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.15 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.129572  normal  0.840022 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2770  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding protein  40.15 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.168453  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2814  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.15 
 
 
159 aa  94.7  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.14611 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1723  hypothetical protein  40.14 
 
 
163 aa  94.4  6e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1083  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  37.09 
 
 
169 aa  94.4  6e-19  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0860  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  40.52 
 
 
160 aa  93.2  1e-18  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00617037 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1166  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  35.53 
 
 
190 aa  93.2  1e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011693  PHATRDRAFT_49924  predicted protein  37.97 
 
 
564 aa  93.2  1e-18  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1731  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  43.1 
 
 
157 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.120946  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1211  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  37.41 
 
 
153 aa  92  3e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.728122  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2805  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42.48 
 
 
158 aa  91.7  3e-18  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04155  putative cytosine/adenosine deaminase  35.9 
 
 
149 aa  91.7  3e-18  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.411988  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1657  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  37.04 
 
 
144 aa  91.7  4e-18  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4602  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein; guanine deaminase  36.76 
 
 
153 aa  91.3  5e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  44.68 
 
 
155 aa  91.3  5e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.552121  hitchhiker  0.000693547 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2515  guanine deaminase  36.57 
 
 
154 aa  90.5  7e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0479995  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11560  cytosine/adenosine deaminase  36.65 
 
 
163 aa  89.7  1e-17  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.40278  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4584  tRNA-adenosine deaminase  42.59 
 
 
165 aa  89.7  1e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1093  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.82 
 
 
181 aa  90.1  1e-17  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  hitchhiker  0.00512356  hitchhiker  0.0000000000228725 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4544  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.36 
 
 
183 aa  90.1  1e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.285833  normal  0.383896 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4125  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.1 
 
 
159 aa  89.4  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.551525  normal  0.0879812 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0390  zinc-binding domain-containing protein  40.38 
 
 
193 aa  89.4  2e-17  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5071  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.67 
 
 
158 aa  89  2e-17  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.724864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2493  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  38.89 
 
 
158 aa  89.4  2e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0857  Guanine deaminase  36.15 
 
 
163 aa  89.4  2e-17  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_32340  putative deaminase  42.42 
 
 
151 aa  89  3e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.319572  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1249  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.16 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2297  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  42 
 
 
155 aa  88.2  4e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00000194857  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1840  tRNA-adenosine deaminase  42.31 
 
 
168 aa  88.2  5e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0533758  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004282  tRNA-specific adenosine-34 deaminase  39.84 
 
 
182 aa  87.8  6e-17  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3417  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  42.31 
 
 
158 aa  87.4  6e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3135  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.05 
 
 
153 aa  87.4  7e-17  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.581984  normal  0.065238 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2923  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  36.51 
 
 
163 aa  87.4  7e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.650072 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3456  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.95 
 
 
153 aa  87  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2603  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  38.79 
 
 
155 aa  86.3  1e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000499641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1592  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.12 
 
 
361 aa  86.7  1e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2282  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  41.12 
 
 
361 aa  86.7  1e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.134141  normal  0.095707 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4204  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.24 
 
 
150 aa  86.7  1e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.906022  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1299  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  40.38 
 
 
178 aa  86.7  1e-16  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00201602  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1450  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  36.05 
 
 
163 aa  85.9  2e-16  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.875484  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2740  putative deaminase  41.41 
 
 
151 aa  86.3  2e-16  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5394  CMP/dCMP deaminase zinc-binding protein  35.29 
 
 
144 aa  85.5  2e-16  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2050  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.73 
 
 
165 aa  86.3  2e-16  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.932057  normal  0.385935 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3722  CMP/dCMP deaminase  40.2 
 
 
156 aa  85.5  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.804018  normal  0.286118 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3058  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.29 
 
 
159 aa  86.3  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.315568 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3082  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.25 
 
 
484 aa  85.9  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.323933  normal  0.500889 
 
 
-
 
NC_002950  PG0738  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  38.24 
 
 
150 aa  85.1  3e-16  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00510  cytosine/adenosine deaminase  34.42 
 
 
163 aa  85.1  3e-16  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2509  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  34.84 
 
 
154 aa  85.5  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0557203  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0231  hypothetical protein  34.44 
 
 
155 aa  85.1  3e-16  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3669  cytidine/deoxycytidylate deaminase zinc-binding domain-containing protein  31.72 
 
 
182 aa  85.1  4e-16  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408377  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1525  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  31.29 
 
 
147 aa  84.7  4e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3332  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  38.95 
 
 
153 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0542  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  41.35 
 
 
152 aa  85.1  4e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.600523  normal 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1532  cytidine/deoxycytidylate deaminase family protein  37.86 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00420564  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1461  hypothetical protein  37.86 
 
 
159 aa  84.7  5e-16  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.252188  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2502  tRNA-adenosine deaminase  33.11 
 
 
161 aa  84.3  6e-16  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000000211119  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1416  CMP/dCMP deaminase, zinc-binding  39.25 
 
 
152 aa  84  8e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0327  putative deaminase  42.45 
 
 
159 aa  84  8e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.69995e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39680  Cytidine/deoxycytidylate deaminase-like protein  41.35 
 
 
158 aa  83.6  9e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.774336  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0576  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  42 
 
 
161 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2029  cytidine/deoxycytidylate deaminase, zinc-binding region  40.59 
 
 
141 aa  82.8  0.000000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0009  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.77 
 
 
148 aa  82.8  0.000000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000143091  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01142  hypothetical protein  39.09 
 
 
164 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1302  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  43.68 
 
 
187 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0817948 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4222  CMP/dCMP deaminase zinc-binding  33.61 
 
 
157 aa  82.4  0.000000000000002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>