More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_4763 on replicon NC_011368
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011368  Rleg2_4763  ABC transporter related  100 
 
 
352 aa  719    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.373169  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5360  ABC transporter related  75.35 
 
 
356 aa  554  1e-157  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.220389  normal  0.603091 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0503  ABC transporter related  65.36 
 
 
358 aa  474  1e-133  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0364  ABC transporter related  67.52 
 
 
352 aa  472  1e-132  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0356421  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2893  ABC transporter related  66.57 
 
 
353 aa  470  1.0000000000000001e-131  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.401174  normal  0.250176 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3579  hypothetical protein  64.79 
 
 
354 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5712  ABC transporter related  63.56 
 
 
355 aa  456  1e-127  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.268173 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2066  ABC transporter related  64 
 
 
349 aa  455  1e-127  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.626309  normal  0.0289677 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3647  ABC transporter related  63.66 
 
 
355 aa  456  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.265226 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3323  ABC transporter related  64.12 
 
 
354 aa  455  1e-127  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.89405  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2096  ABC transporter related  63.56 
 
 
354 aa  451  1.0000000000000001e-126  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00542123 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5338  ABC transporter related  62.99 
 
 
355 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.708738  normal  0.0411085 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1412  ABC transporter related  64.84 
 
 
364 aa  448  1e-125  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4327  ABC transporter related  62.61 
 
 
355 aa  448  1e-125  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0513882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3961  ABC transporter related  63.84 
 
 
354 aa  450  1e-125  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.565548  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3553  ABC transporter ATP-binding protein  64.24 
 
 
345 aa  446  1.0000000000000001e-124  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4690  ABC transporter related  64.45 
 
 
353 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.219476  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0823  ABC transporter related  64.01 
 
 
364 aa  446  1.0000000000000001e-124  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0254  ABC transporter related  62.71 
 
 
353 aa  442  1e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1257  ABC transporter related  62.78 
 
 
357 aa  439  9.999999999999999e-123  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4721  ABC transporter related  63.29 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0283  ABC transporter related  61.58 
 
 
353 aa  439  9.999999999999999e-123  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.157903  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3684  ABC transporter related  63.84 
 
 
355 aa  436  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1240  ABC transporter related  62.4 
 
 
360 aa  437  1e-121  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2119  ABC transporter related  61.62 
 
 
355 aa  432  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.445034 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6393  ABC transporter related  61.93 
 
 
355 aa  432  1e-120  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2311  ABC transporter related  64.06 
 
 
361 aa  432  1e-120  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.223454  normal  0.474249 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7355  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugars)  60.86 
 
 
350 aa  422  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.216197  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3526  ABC transporter related  60 
 
 
356 aa  424  1e-117  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.457931  normal  0.0981822 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1098  ABC transporter related  61.56 
 
 
352 aa  422  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3768  ABC transporter related  60.68 
 
 
351 aa  424  1e-117  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4666  ABC transporter related  61.13 
 
 
356 aa  419  1e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.47492 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4747  ABC transporter related  60.72 
 
 
356 aa  416  9.999999999999999e-116  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.155462 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4521  ABC transporter related  59.94 
 
 
352 aa  417  9.999999999999999e-116  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.116859  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3572  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.79 
 
 
364 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3706  ABC transporter related  56.79 
 
 
364 aa  409  1e-113  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4019  carbohydrate ABC transporter ATP-binding protein  56.51 
 
 
364 aa  407  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0312  ABC transporter related  54.95 
 
 
363 aa  399  9.999999999999999e-111  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.982046  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1869  ABC transporter related  58.31 
 
 
357 aa  398  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.443333 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1688  ABC transporter related  57.7 
 
 
357 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.350685  normal  0.966803 
 
 
-
 
NC_004310  BR0238  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  53.59 
 
 
363 aa  392  1e-108  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4055  ABC transporter related  56.15 
 
 
354 aa  394  1e-108  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4976  ABC transporter related  54.67 
 
 
365 aa  393  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0894214 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2423  ABC transporter related  58.52 
 
 
354 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.34011 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1495  ABC transporter related  55.68 
 
 
367 aa  389  1e-107  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.407646  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0701  ABC transporter related  54.32 
 
 
362 aa  388  1e-107  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.453676  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3893  ABC transporter related  56.73 
 
 
350 aa  390  1e-107  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.154073  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4511  ABC transporter related  55.83 
 
 
356 aa  389  1e-107  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1543  ABC transporter related  55.68 
 
 
367 aa  389  1e-107  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0163  ABC transporter related  55 
 
 
369 aa  389  1e-107  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2947  ABC transporter related  56.94 
 
 
356 aa  390  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.196762  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0351  ABC transporter related  55.25 
 
 
357 aa  387  1e-106  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0745  sugar ABC transporter, ATP-binding protein, putative  55.59 
 
 
350 aa  386  1e-106  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.407234  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5849  ABC transporter related  58.33 
 
 
352 aa  386  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.932892  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0696  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  55.59 
 
 
350 aa  386  1e-106  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.766735  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6762  ABC transporter related  58.62 
 
 
352 aa  387  1e-106  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.377611  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4268  ABC transporter-related protein  55.96 
 
 
360 aa  383  1e-105  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1692  ABC transporter-related protein  55.08 
 
 
355 aa  382  1e-105  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.291181 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0231  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  52.76 
 
 
363 aa  383  1e-105  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4290  ABC transporter related  55.96 
 
 
360 aa  382  1e-105  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.439892  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3282  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.37 
 
 
349 aa  382  1e-105  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.434692  normal  0.636051 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1161  ABC transporter related  53.44 
 
 
367 aa  378  1e-104  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0422  ABC sugar transporter, ATPase subunit  55.12 
 
 
360 aa  381  1e-104  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1059  ABC transporter related  55.18 
 
 
402 aa  379  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.649165  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2654  putative maltose/maltodextrin ABC transporter, ATP-binding protein  53.74 
 
 
369 aa  379  1e-104  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2340  ABC transporter  53.46 
 
 
369 aa  378  1e-104  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0777  ABC transporter related  54.85 
 
 
367 aa  381  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.540961  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00450  ABC transporter related  53.02 
 
 
372 aa  378  1e-104  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2199  ABC transporter related protein  53.74 
 
 
380 aa  379  1e-104  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4019  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.85 
 
 
349 aa  379  1e-104  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0228  ABC transporter related  55.21 
 
 
353 aa  378  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3427  ABC transporter related  56.73 
 
 
349 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5695  ABC transporter related  53.07 
 
 
365 aa  375  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.6347  normal  0.0823174 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3287  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.57 
 
 
349 aa  376  1e-103  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.241244  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0274  ABC transporter related  53.33 
 
 
368 aa  375  1e-103  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.533134 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1769  ABC transporter related  52.51 
 
 
366 aa  375  1e-103  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7210  ABC transporter related  54.57 
 
 
360 aa  377  1e-103  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3396  ABC transporter related  52.49 
 
 
364 aa  376  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.304213  normal  0.67181 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0852  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  56.15 
 
 
351 aa  375  1e-103  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.520251  normal 
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6527  ABC transporter related  54.42 
 
 
360 aa  374  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.146695 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2717  ABC transporter-related protein  52.33 
 
 
366 aa  374  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00458164  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4137  ABC transporter, ATPase subunit  55.52 
 
 
362 aa  373  1e-102  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6115  ABC transporter related  54.97 
 
 
360 aa  371  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.914553 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2366  ABC transporter-like protein  52.6 
 
 
381 aa  372  1e-102  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0296  ABC transporter related  53.63 
 
 
362 aa  370  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.459609  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1267  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  53.93 
 
 
365 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0621  ABC transporter related  52.33 
 
 
370 aa  368  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0838339  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0658  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.02 
 
 
351 aa  368  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.143884  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0183  ABC transporter related  53.91 
 
 
359 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7338  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (sugar)  55.01 
 
 
332 aa  369  1e-101  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.016848  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3611  ABC transporter related  53.19 
 
 
370 aa  370  1e-101  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5333  ABC transporter related  52.22 
 
 
369 aa  369  1e-101  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4132  ABC transporter related  54.82 
 
 
357 aa  368  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.751697  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3753  glycerol-3-phosphate transporter ATP-binding subunit  54.49 
 
 
351 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0916  ABC transporter related  52.66 
 
 
358 aa  370  1e-101  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0452434 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3925  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0573898  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3757  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.305831  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3773  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.41 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0367372  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3677  ABC sugar transporter, ATPase subunit  53.35 
 
 
359 aa  366  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4232  sugar ABC transporter ATP-binding protein  50.41 
 
 
366 aa  365  1e-100  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.253901  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>