231 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg2_1101 on replicon NC_011369
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011369  Rleg2_1101  putative adenylate/guanylate cyclase  100 
 
 
353 aa  720    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.969933  normal  0.21412 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1248  adenylate/guanylate cyclase  90.65 
 
 
353 aa  671    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.166673  normal  0.0871939 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0798  putative adenylate/guanylate cyclase  57.32 
 
 
360 aa  377  1e-103  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.65462  normal  0.907597 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3172  adenylate/guanylate cyclase  47.42 
 
 
357 aa  322  6e-87  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0526222  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1386  adenylate/guanylate cyclase  46.3 
 
 
366 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.171471 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4159  putative adenylate/guanylate cyclase  48.36 
 
 
366 aa  318  1e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5244  adenylate/guanylate cyclase  46.43 
 
 
355 aa  314  9.999999999999999e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.557763 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4777  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  47.11 
 
 
355 aa  312  6.999999999999999e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.369959  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5319  adenylate/guanylate cyclase  46.81 
 
 
355 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.161099  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3927  putative adenylate/guanylate cyclase  44.94 
 
 
384 aa  295  1e-78  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.389107 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4423  putative adenylate/guanylate cyclase  45.95 
 
 
381 aa  291  9e-78  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.558408 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0812  putative adenylate/guanylate cyclase  43.32 
 
 
353 aa  278  1e-73  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0784  putative adenylate/guanylate cyclase  43.16 
 
 
354 aa  271  1e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.437942  normal  0.192467 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0521  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  40.91 
 
 
375 aa  265  7e-70  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.257311  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1274  putative adenylate/guanylate cyclase  40 
 
 
348 aa  254  1.0000000000000001e-66  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.771245  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3613  putative adenylate/guanylate cyclase  44.55 
 
 
339 aa  253  4.0000000000000004e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  decreased coverage  0.000523054  normal  0.123391 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0821  putative adenylate/guanylate cyclase  34.6 
 
 
361 aa  152  7e-36  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1218  putative adenylate/guanylate cyclase  35.5 
 
 
365 aa  144  3e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.262332  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2784  adenylate cyclase-related protein  33.57 
 
 
342 aa  143  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000200279  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0934  putative adenylate/guanylate cyclase  34.93 
 
 
363 aa  139  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.60151  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2947  putative adenylate/guanylate cyclase  34.42 
 
 
340 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00299422  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1019  putative adenylate/guanylate cyclase  33.63 
 
 
357 aa  132  9e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.000266807  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1226  putative adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
355 aa  129  7.000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000096707  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0861  adenylate cyclase-related protein  33.18 
 
 
358 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000465021  normal  0.0622951 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1329  adenylate cyclase-related protein  32.58 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1259  putative adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000268805  normal  0.0612766 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4694  putative adenylate/guanylate cyclase  30.84 
 
 
340 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2867  putative adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000124231  normal  0.451777 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2949  putative adenylate/guanylate cyclase  32.58 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000324695  normal  0.274146 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3045  adenylate cyclase-related protein  32.58 
 
 
335 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000460708  normal  0.431544 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1182  putative adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000431014  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3131  putative adenylate/guanylate cyclase  33.03 
 
 
355 aa  129  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.0000000056797  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1140  putative adenylate/guanylate cyclase  32.13 
 
 
355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000308183  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1225  putative adenylate/guanylate cyclase  33.33 
 
 
355 aa  126  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.000000275809  hitchhiker  0.00922778 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1130  putative adenylate/guanylate cyclase  32.29 
 
 
357 aa  121  1.9999999999999998e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000248184  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1036  putative adenylate/guanylate cyclase  31.25 
 
 
339 aa  117  3.9999999999999997e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000150987  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1062  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.85 
 
 
744 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.171253  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0280  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  25.24 
 
 
656 aa  72.8  0.000000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0296  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.19 
 
 
672 aa  72.8  0.000000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0714  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  27.05 
 
 
637 aa  71.6  0.00000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.17996  normal  0.926966 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3188  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.41 
 
 
411 aa  67.4  0.0000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3512  adenylate/guanylate cyclase  29.35 
 
 
411 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.596783  normal  0.617288 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3875  putative adenylate/guanylate cyclase  31.98 
 
 
367 aa  67.4  0.0000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.579671  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4273  putative adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
421 aa  67  0.0000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.889875  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6677  ferredoxin  30.88 
 
 
577 aa  66.6  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.869083  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0831  adenylate/guanylate cyclase  29.65 
 
 
643 aa  66.2  0.0000000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2129  adenylate/guanylate cyclase  27.52 
 
 
741 aa  65.9  0.000000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3496  adenylate/guanylate cyclase  27.17 
 
 
407 aa  65.9  0.000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.7892 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3462  putative adenylate/guanylate cyclase  28.02 
 
 
651 aa  65.5  0.000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3791  adenylate/guanylate cyclase  27.62 
 
 
410 aa  64.3  0.000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0331  putative adenylate/guanylate cyclase  26 
 
 
641 aa  63.9  0.000000004  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3461  adenylate/guanylate cyclase  25 
 
 
459 aa  63.5  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2619  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  23.17 
 
 
658 aa  62.8  0.00000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.103266  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2648  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
464 aa  62.4  0.00000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1827  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  29.17 
 
 
618 aa  61.6  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.183401  hitchhiker  0.00645983 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0231  putative adenylate/guanylate cyclase  30.81 
 
 
675 aa  61.6  0.00000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0742762  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2364  putative adenylate/guanylate cyclase  29.07 
 
 
558 aa  61.2  0.00000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1205  adenylate/guanylate cyclase  28.21 
 
 
724 aa  60.8  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.000104961  normal  0.0234559 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4050  histidine kinase HAMP region domain protein  26.7 
 
 
514 aa  60.5  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4597  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.84 
 
 
622 aa  60.5  0.00000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.334368  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1703  hypothetical protein  25.45 
 
 
758 aa  60.5  0.00000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0668  putative adenylate/guanylate cyclase  28 
 
 
701 aa  60.1  0.00000005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00673986  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2958  adenylate/guanylate cyclase  28.44 
 
 
421 aa  60.1  0.00000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000879483 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2515  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  28.26 
 
 
650 aa  59.7  0.00000007  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.764918 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3612  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  29.63 
 
 
1089 aa  59.7  0.00000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.758157  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2386  adenylate/guanylate cyclase  31.4 
 
 
681 aa  59.3  0.00000009  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0015  putative adenylate/guanylate cyclase  25.91 
 
 
284 aa  58.5  0.0000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.391867  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2359  adenylate/guanylate cyclase  32.24 
 
 
370 aa  58.9  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.071599  normal  0.155439 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1889  putative adenylate/guanylate cyclase  27.7 
 
 
645 aa  59.3  0.0000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2024  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  26.35 
 
 
618 aa  59.3  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1704  hypothetical protein  25 
 
 
758 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1276  hypothetical protein  24.73 
 
 
701 aa  58.2  0.0000002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0091  adenylate/guanylate cyclase  27.67 
 
 
859 aa  58.2  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.101175 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0721  adenylate/guanylate cyclase  24.8 
 
 
729 aa  58.2  0.0000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.164553  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0353  adenylate/guanylate cyclase  29.51 
 
 
699 aa  58.2  0.0000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.213992 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0558  adenylate/guanylate cyclase  25.79 
 
 
665 aa  58.5  0.0000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.132478  normal  0.264577 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_28331  guanylate cyclase  23.89 
 
 
632 aa  58.2  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.345698 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7278  adenylate/guanylate cyclase  29.5 
 
 
1094 aa  57.8  0.0000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.137597 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2343  adenylate/guanylate cyclase with integral membrane sensor  26.14 
 
 
465 aa  57  0.0000004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0671  putative adenylate/guanylate cyclase  26.36 
 
 
593 aa  57  0.0000005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.810132 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0048  adenylate/guanylate cyclase  29.93 
 
 
1142 aa  57  0.0000005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0983  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  25 
 
 
737 aa  56.6  0.0000006  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1277  hypothetical protein  26.23 
 
 
701 aa  56.2  0.0000008  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3384  adenylate/guanylate cyclase  27.27 
 
 
427 aa  56.2  0.0000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.141185  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1131  adenylate cyclase  25.33 
 
 
483 aa  56.2  0.0000009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3083  adenylyl cyclase class-3/4/guanylyl cyclase  30.72 
 
 
575 aa  55.8  0.0000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.526373  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3403  adenylate/guanylate cyclase  30.72 
 
 
575 aa  56.2  0.0000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006369  lpl1135  adenylate cyclase  24.67 
 
 
483 aa  55.5  0.000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1200  histidine kinase HAMP region domain protein  29.17 
 
 
570 aa  55.5  0.000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.265792  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_03401  hypothetical protein  28.06 
 
 
645 aa  55.8  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.689704 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3278  adenylate/guanylate cyclase  29.34 
 
 
575 aa  55.8  0.000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.147867 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0104  adenylate/guanylate cyclase  21.47 
 
 
437 aa  55.1  0.000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1236  adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.818625  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1253  putative adenylate/guanylate cyclase  28.79 
 
 
320 aa  55.1  0.000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344364  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0722  adenylate/guanylate cyclase with Chase sensor  27.42 
 
 
613 aa  55.1  0.000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.144066 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0034  TPR repeat-containing adenylate/guanylate cyclase  28.67 
 
 
758 aa  54.7  0.000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.00000015313  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1477  putative adenylate/guanylate cyclase  27.66 
 
 
903 aa  55.1  0.000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.861008  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4698  adenylate/guanylate cyclase  24.74 
 
 
735 aa  54.3  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13674  transmembrane protein  29.38 
 
 
549 aa  54.3  0.000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.0475504 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1986  adenylate/guanylate cyclase  19.31 
 
 
643 aa  54.3  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>