121 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_C6088 on replicon NC_007336
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007336  Reut_C6088  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  100 
 
 		 93 aa  184  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3528  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  91.4 
 
 		 93 aa  170  5e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.937942  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3818  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  74.19 
 
 		 93 aa  122  1e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0784034  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0893  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase, N-terminal  72.04 
 
 		 93 aa  121  4e-27  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2004  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  59.78 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2006  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  59.78 
 
 		 94 aa  104  4e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2155  SAF domain protein  54.35 
 
 		 94 aa  103  1e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.105827  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2374  SAF domain protein  57.14 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.248717  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2037  hypothetical protein  46.15 
 
 		 96 aa  94.4  5e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.270273  normal  0.0861172 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5980  hypothetical protein  48.35 
 
 		 105 aa  90.1  9e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.763547  normal  0.292793 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2325  SAF domain protein  49.46 
 
 		 92 aa  89.4  1e-17  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1765  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like protein  55.22 
 
 		 94 aa  89  2e-17  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0520313  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3705  SAF domain protein  47.25 
 
 		 105 aa  87.8  5e-17  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0838638  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0482  SAF domain protein  44.44 
 
 		 93 aa  81.6  0.000000000000004  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1141  SAF domain-containing protein  43.62 
 
 		 99 aa  74.7  0.0000000000004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  0.80997 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1011  SAF domain protein  43.68 
 
 		 107 aa  73.9  0.0000000000007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.734245  normal  0.489175 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2217  SAF domain protein  39.36 
 
 		 99 aa  72.4  0.000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.0515295  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2463  SAF domain-containing protein  41.38 
 
 		 110 aa  70.1  0.00000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.959016 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1123  SAF domain-containing protein  38.2 
 
 		 95 aa  68.2  0.00000000004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4419  SAF domain protein  41.11 
 
 		 98 aa  67.4  0.00000000007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0582  Altronate dehydratase  50 
 
 		 533 aa  66.6  0.0000000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.165825 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2050  SAF domain protein  37.78 
 
 		 98 aa  61.2  0.000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000230395  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0706  UxaA family hydrolase  37.08 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.387559  normal  0.92532 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0766  UxaA family hydrolase  35.96 
 
 		 96 aa  58.9  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0809  UxaA family hydrolase  37.08 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.316171  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0692  hydrolase, UxaA family  37.08 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.035451  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0752  UxaA family hydrolase  37.08 
 
 		 96 aa  59.3  0.00000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.317969  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2591  altronate hydrolase  32.22 
 
 		 107 aa  58.9  0.00000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.109004  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3559  altronate dehydratase  42.22 
 
 		 495 aa  57  0.00000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3527  altronate dehydratase  42.22 
 
 		 495 aa  57  0.00000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3383  altronate dehydratase  42.22 
 
 		 495 aa  57  0.00000009  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5792  Altronate dehydratase  40 
 
 		 523 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2533  Galactarate dehydratase  50 
 
 		 533 aa  56.6  0.0000001  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5795  Altronate dehydratase  41.18 
 
 		 523 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.228862  normal  0.947174 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6356  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  32.61 
 
 		 96 aa  56.2  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0883722  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3225  Altronate dehydratase  39.29 
 
 		 501 aa  56.2  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3509  Altronate dehydratase  49.06 
 
 		 496 aa  55.1  0.0000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1754  Altronate dehydratase  45.28 
 
 		 514 aa  54.7  0.0000004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3274  SAF domain protein  39.76 
 
 		 103 aa  55.1  0.0000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.759034  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4928  galactarate dehydratase  33.33 
 
 		 508 aa  54.3  0.0000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.314092  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0208  SAF domain-containing protein  49.06 
 
 		 106 aa  54.3  0.0000006  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0610  Altronate dehydratase  41.11 
 
 		 495 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3512  D-altronate dehydratase  47.17 
 
 		 507 aa  53.9  0.0000007  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3383  Altronate dehydratase  45.28 
 
 		 496 aa  52.8  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02960  altronate hydrolase  40 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5297  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase, N-terminal  34.72 
 
 		 96 aa  52.8  0.000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.494371  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3805  SAF domain-containing protein  35.96 
 
 		 113 aa  52  0.000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.862182 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3274  altronate dehydratase  40 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02911  hypothetical protein  40 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0609  Altronate dehydratase  40 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4406  altronate dehydratase  40 
 
 		 495 aa  52.8  0.000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.731196 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0154  Altronate dehydratase  36.9 
 
 		 500 aa  52.8  0.000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0475003  normal  0.0157822 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_05270  altronate dehydratase  37.18 
 
 		 525 aa  51.2  0.000004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0160  Galactarate dehydratase  36.9 
 
 		 500 aa  51.6  0.000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00621613  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_07160  altronate dehydratase  41.18 
 
 		 508 aa  50.4  0.000007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0589773  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0748  Altronate dehydratase  38.75 
 
 		 496 aa  50.4  0.000007  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013745  Htur_4455  SAF domain protein  35.71 
 
 		 106 aa  50.4  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  decreased coverage  0.0000169605  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2834  UxaA family hydrolase  35.44 
 
 		 513 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1027  galactarate dehydratase  48 
 
 		 509 aa  50.1  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1575  Altronate dehydratase  37.84 
 
 		 498 aa  50.1  0.00001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3043  Altronate dehydratase  41.25 
 
 		 500 aa  49.7  0.00001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.551416  normal  0.217859 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2855  Altronate dehydratase  35.44 
 
 		 513 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.547251  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0531  Altronate dehydratase  40 
 
 		 496 aa  49.7  0.00001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4320  Altronate dehydratase  41.51 
 
 		 496 aa  50.1  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0691  Altronate dehydratase  46.55 
 
 		 496 aa  48.9  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2068  Altronate dehydratase  40 
 
 		 511 aa  49.3  0.00002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.186874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2948  galactarate dehydratase  42 
 
 		 513 aa  48.9  0.00002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.439252  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3059  galactarate dehydratase  43.42 
 
 		 507 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.364841  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3545  D-altronate dehydratase  36.67 
 
 		 495 aa  48.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.444536 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2945  putative D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase  47.17 
 
 		 507 aa  48.5  0.00003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0792126  normal  0.661993 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1247  Altronate dehydratase  36.47 
 
 		 507 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.665181  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1138  galactarate dehydratase  35.37 
 
 		 523 aa  47.8  0.00005  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2740  Altronate dehydratase  34.94 
 
 		 493 aa  47.8  0.00005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000642568  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1221  Altronate dehydratase  38.82 
 
 		 507 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1537  Altronate dehydratase  40 
 
 		 513 aa  47.4  0.00006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.281722 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3856  D-galactarate dehydratase  31.4 
 
 		 111 aa  47.4  0.00006  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0465799  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1102  altronate hydrolase  38.6 
 
 		 496 aa  47.4  0.00006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4299  SAF domain-containing protein  41.18 
 
 		 105 aa  47.8  0.00006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.762591 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0800  Altronate dehydratase  41.18 
 
 		 512 aa  47.4  0.00008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3970  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  41.18 
 
 		 509 aa  47  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5478  Altronate dehydratase  37.65 
 
 		 508 aa  47  0.00009  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0767398  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0493  altronate dehydratase  38.6 
 
 		 496 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1546  D-galactarate dehydratase/altronate hydrolase-like protein  40.38 
 
 		 98 aa  46.6  0.0001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0556  Altronate dehydratase  38.6 
 
 		 496 aa  46.2  0.0001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.370951  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5155  Altronate dehydratase  37.18 
 
 		 515 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.522272 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0590  Galactarate dehydratase  41.18 
 
 		 512 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.413028  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4448  Altronate dehydratase  38.37 
 
 		 508 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0228  D-altronate dehydratase  35.23 
 
 		 503 aa  45.4  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4671  Altronate dehydratase  38.64 
 
 		 523 aa  45.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2431  D-galactarate dehydratase/Altronate hydrolase-like  40.43 
 
 		 109 aa  45.1  0.0003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1602  galactarate dehydratase  44.23 
 
 		 513 aa  45.4  0.0003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0783  Galactarate dehydratase  48.84 
 
 		 508 aa  44.7  0.0005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0125  SAF domain-containing protein  34.09 
 
 		 96 aa  44.3  0.0005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0806  UxaA family hydrolase  38.82 
 
 		 514 aa  43.5  0.0009  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.941516  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0756  UxaA family hydrolase  38.82 
 
 		 514 aa  43.5  0.0009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1610  altronate hydrolase  37.74 
 
 		 500 aa  43.5  0.001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6467  Altronate dehydratase  35.23 
 
 		 507 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.457294  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6702  Altronate dehydratase  35.23 
 
 		 507 aa  43.1  0.001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.159063 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1155  Altronate dehydratase  34.43 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1790  dehydratase; D-galactarate dehydratase; altronate dehydratase  34.43 
 
 		 106 aa  43.5  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>