60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4938 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4938  NodS  100 
 
 		 203 aa  414  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3000  methyltransferase, putative  45.86 
 
 		 208 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5417  methyltransferase type 12  44.5 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.791352 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2654  methyltransferase type 12  44.1 
 
 		 199 aa  163  1.0000000000000001e-39  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.268056  normal  0.772066 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2239  Methyltransferase type 12  43.72 
 
 		 201 aa  163  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2504  methyltransferase type 12  46.41 
 
 		 199 aa  160  9e-39  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2541  NodS  44.79 
 
 		 199 aa  160  2e-38  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.43061 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2028  putative methyltransferase protein  43.22 
 
 		 201 aa  160  2e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3133  methyltransferase, putative  44.75 
 
 		 208 aa  158  6e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0805315  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3257  methyltransferase, putative  45.3 
 
 		 199 aa  158  7e-38  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.509429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2638  NodS family protein  42.16 
 
 		 199 aa  154  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.589636 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0511  LmbE family protein  45.05 
 
 		 464 aa  153  2e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.211712  decreased coverage  0.000000388452 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3271  LmbE family protein  42.78 
 
 		 462 aa  150  1e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000861736  hitchhiker  0.0000637715 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20100  uncharacterized LmbE-like protein  42.86 
 
 		 502 aa  150  1e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.153307  normal  0.245779 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  44.02 
 
 		 464 aa  148  5e-35  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0336  LmbE family protein  40.31 
 
 		 471 aa  139  3.9999999999999997e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5873  methyltransferase type 12  38.74 
 
 		 197 aa  135  3.0000000000000003e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444387 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1799  methyltransferase type 12  32.46 
 
 		 265 aa  130  2.0000000000000002e-29  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.399656  normal  0.0767519 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2920  Methyltransferase type 12  37.08 
 
 		 195 aa  129  4.0000000000000003e-29  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.338698  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1345  methyltransferase type 12  38.55 
 
 		 191 aa  123  1e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0930798  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0200  Methyltransferase type 12  43.31 
 
 		 240 aa  123  2e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3661  methyltransferase type 12  42.38 
 
 		 197 aa  116  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0983592  normal  0.117601 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_01090  uncharacterized LmbE-like protein  37.43 
 
 		 708 aa  115  3e-25  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3595  Methyltransferase type 12  43.88 
 
 		 192 aa  115  6e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4100  NodS  44.37 
 
 		 192 aa  114  7.999999999999999e-25  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.246696  normal  0.139963 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0577  methyltransferase type 12  43.71 
 
 		 192 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5977  LmbE family protein  36.72 
 
 		 447 aa  107  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4156  Methyltransferase type 12  43.17 
 
 		 198 aa  103  1e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0265563  normal  0.868511 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3847  methyltransferase type 12  36.22 
 
 		 198 aa  102  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0019  NodS family protein  37.16 
 
 		 207 aa  98.2  6e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.136752  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2568  LmbE family protein  37.43 
 
 		 427 aa  95.1  7e-19  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.219184  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4304  Methyltransferase type 12  40.14 
 
 		 197 aa  94  2e-18  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0637573  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0800  Methyltransferase type 12  38.19 
 
 		 202 aa  91.3  8e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.721847 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_10900  hypothetical protein  32.89 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.028052  normal  0.399666 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7716  NodS family protein  30.28 
 
 		 209 aa  68.2  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0210387  normal  0.935412 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2950  glycosyl transferase family 2  35.07 
 
 		 1001 aa  67.4  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.611527 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3198  glycosyl transferase family 2  33.58 
 
 		 1015 aa  60.1  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3533  Methyltransferase type 11  28.15 
 
 		 250 aa  54.3  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.066309 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3896  Methyltransferase type 11  23.81 
 
 		 175 aa  53.9  0.000001  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0957  methyltransferase type 12  32.03 
 
 		 190 aa  53.5  0.000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.0352326 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0339  hypothetical protein  38.46 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.255644  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1983  methyltransferase type 12  38.46 
 
 		 189 aa  51.2  0.00001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.377104  normal  0.388188 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5940  amino acid adenylation domain-containing protein  32.35 
 
 		 6999 aa  50.8  0.00001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2300  methyltransferase type 11  28.17 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2952  amino acid adenylation domain protein  26.67 
 
 		 2012 aa  46.6  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.537682 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3471  methyltransferase type 11  24.68 
 
 		 207 aa  46.6  0.0003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00055475  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0192  amino acid adenylation domain-containing protein  29.46 
 
 		 1914 aa  45.8  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.33939 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2103  Methyltransferase type 11  29.89 
 
 		 241 aa  45.8  0.0005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1968  amino acid adenylation domain-containing protein  34.31 
 
 		 3639 aa  45.1  0.0007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00734125 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10090  methyltransferase  29.85 
 
 		 197 aa  45.1  0.0007  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.542368  normal  0.16327 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0157  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  33.66 
 
 		 229 aa  44.7  0.001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  32.22 
 
 		 8211 aa  44.7  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3445  Methyltransferase type 11  26.32 
 
 		 269 aa  43.9  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1282  hypothetical protein  26.67 
 
 		 231 aa  43.5  0.002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1635  Methyltransferase type 11  33.65 
 
 		 252 aa  43.1  0.003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.977952  normal  0.0455749 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0249  Methyltransferase type 11  27.34 
 
 		 244 aa  43.1  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.404751 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3066  MCP methyltransferase, CheR-type  30.1 
 
 		 4483 aa  42.7  0.004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  25.93 
 
 		 7541 aa  42.4  0.005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2710  hypothetical protein  31.58 
 
 		 316 aa  42.4  0.005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1408  membrane-associated protein  24.17 
 
 		 213 aa  41.6  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>