62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Francci3_2710 on replicon NC_007777
Organism: Frankia sp. CcI3



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007777  Francci3_2710  hypothetical protein  100 
 
 		 316 aa  634    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1983  Methyltransferase type 11  28.93 
 
 		 252 aa  54.3  0.000003  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.600797 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0586  Methyltransferase type 12  33.33 
 
 		 239 aa  50.4  0.00004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0511353 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02405  methyltransferase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G14390)  31.82 
 
 		 258 aa  48.9  0.0001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2609  Methyltransferase type 11  38.89 
 
 		 259 aa  48.9  0.0001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.337876 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1458  methyltransferase type 11  31.06 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0556  LmbE family protein  36.84 
 
 		 464 aa  47.8  0.0003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0403  putative methyltransferase  51.35 
 
 		 210 aa  47.4  0.0003  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00297063  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2364  Methyltransferase type 11  39.19 
 
 		 245 aa  47.4  0.0003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.695358  decreased coverage  0.00329401 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1880  transcriptional regulator, ArsR family  33.8 
 
 		 354 aa  47  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.265795 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1599  methyltransferase type 11  33.8 
 
 		 349 aa  47  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.318356  normal  0.150084 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0204  Methyltransferase type 12  25.47 
 
 		 203 aa  47  0.0004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2080  MCP methyltransferase, CheR-type  32.79 
 
 		 825 aa  46.6  0.0005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.646014  normal  0.992336 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4293  Methyltransferase type 11  43.33 
 
 		 305 aa  46.6  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.943104  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1146  Methyltransferase type 11  46.81 
 
 		 251 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.114976  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2029  Methyltransferase type 12  42.31 
 
 		 215 aa  46.2  0.0008  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0474  hypothetical protein  28.67 
 
 		 252 aa  46.2  0.0008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1869  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.235933  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1357  methyltransferase type 11  39.66 
 
 		 232 aa  45.4  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1915  methyltransferase type 11  25.71 
 
 		 259 aa  45.4  0.001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.107391  normal  0.797863 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001478  SAM-dependent methyltransferase  42.5 
 
 		 191 aa  45.4  0.001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.544466  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3404  methyltransferase type 11  36.46 
 
 		 226 aa  45.4  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.236605  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2111  hypothetical protein  22.11 
 
 		 237 aa  45.4  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05419  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.29 
 
 		 232 aa  45.8  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4001  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2049  methyltransferase type 12  53.33 
 
 		 246 aa  44.3  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.690149  normal  0.594586 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1640  transcriptional regulator, ArsR family  33.1 
 
 		 342 aa  44.7  0.002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0529  Methyltransferase type 11  31.37 
 
 		 444 aa  45.1  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1238  methyltransferase type 11  39.58 
 
 		 219 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2970  hypothetical protein  53.66 
 
 		 226 aa  45.1  0.002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4043  Methyltransferase type 11  38.6 
 
 		 248 aa  44.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3423  rRNA (adenine-N(6)-)-methyltransferase  46.94 
 
 		 253 aa  44.3  0.002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2387  Methyltransferase type 11  35.19 
 
 		 253 aa  44.7  0.002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14890  Methyltransferase type 11  30.72 
 
 		 276 aa  44.3  0.003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.223529  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0198  TPR domain-containing protein  25.58 
 
 		 358 aa  44.3  0.003  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.890473  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1849  methyltransferase type 11  28.97 
 
 		 259 aa  44.3  0.003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0681  Methyltransferase type 11  28.7 
 
 		 243 aa  43.5  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000237384  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0040  transcriptional regulator, ArsR family  45.83 
 
 		 307 aa  43.9  0.004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.516661  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2119  Methyltransferase type 12  28.3 
 
 		 234 aa  43.5  0.004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.54361  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1251  methyltransferase, putative  41.94 
 
 		 229 aa  43.9  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1751  putative methyltransferase  39.24 
 
 		 222 aa  43.5  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13046  hypothetical protein  34.38 
 
 		 274 aa  43.5  0.005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0765338  hitchhiker  0.00655804 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0248  methyltransferase type 11  40.74 
 
 		 195 aa  43.1  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3332  Methyltransferase type 11  43.75 
 
 		 268 aa  43.1  0.006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3359  hypothetical protein  36.36 
 
 		 239 aa  43.1  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.488904 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0289  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.705778  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1433  trans-aconitate 2-methyltransferase  40.24 
 
 		 259 aa  43.1  0.006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1932  Mg-protoporphyrin IX methyl transferase  37.18 
 
 		 222 aa  43.1  0.006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4011  methyltransferase type 12  35 
 
 		 317 aa  43.1  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.550687  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4652  Methyltransferase type 11  32.35 
 
 		 254 aa  43.1  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.230067 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6054  methyltransferase type 11  41.98 
 
 		 241 aa  43.1  0.006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.202203  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3590  methyltransferase type 12  42.86 
 
 		 253 aa  43.1  0.006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.698799  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1552  methyltransferase type 11  44 
 
 		 242 aa  42.7  0.007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.093627 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4081  methyltransferase type 12  32.84 
 
 		 456 aa  43.1  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000110716 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2825  Methyltransferase type 12  42.11 
 
 		 436 aa  42.7  0.007  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1885  methyltransferase  21.94 
 
 		 237 aa  42.7  0.007  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2207  trans-aconitate 2-methyltransferase  51.92 
 
 		 260 aa  42.7  0.008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1186  methyltransferase type 11  32.09 
 
 		 262 aa  42.7  0.008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.315285  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2173  Methyltransferase type 11  40.3 
 
 		 252 aa  42.7  0.008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04339  methyltransferase  37.97 
 
 		 261 aa  42.7  0.009  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4055  putative methyltransferase  40.48 
 
 		 194 aa  42.4  0.01  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0463  ubiquinone/menaquinone biosynthesis methyltransferase  37.5 
 
 		 250 aa  42.4  0.01  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>