145 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B4913 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B4913  resolvase, N-terminal  100 
 
 		 197 aa  403  1.0000000000000001e-112  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6401  resolvase domain-containing protein  36.22 
 
 		 214 aa  109  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.332632  normal  0.660753 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0105  resolvase, N-terminal:resolvase helix-turn-helix region  34.57 
 
 		 192 aa  100  2e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3231  transposon Tn2501 resolvase  32.98 
 
 		 191 aa  98.6  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2100  Resolvase domain protein  32.52 
 
 		 196 aa  93.6  1e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000956779  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1284  transposon Tn2501 resolvase  31.94 
 
 		 191 aa  94  1e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.1264  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01345  predicted site-specific recombinase  32.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01504  predicted site-specific recombinase  32.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.133152  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2272  Resolvase domain protein  32.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.861059  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1762  resolvase-like protein  32.45 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01357  hypothetical protein  32.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2374  resolvase domain-containing protein  32.45 
 
 		 192 aa  93.2  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1803  resolvase domain-containing protein  32.8 
 
 		 193 aa  93.2  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01515  hypothetical protein  32.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.088804  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1635  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00540929  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1754  site-specific recombinase resolvase family protein PinR  32.52 
 
 		 196 aa  93.6  2e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0427296  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2113  resolvase domain-containing protein  32.52 
 
 		 196 aa  93.2  2e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0120982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2132  resolvase domain-containing protein  30.93 
 
 		 198 aa  93.2  2e-18  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0356691 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4379  resolvase-like protein  31.22 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.907706  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4555  resolvase-like protein  31.22 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.849085  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4663  resolvase domain-containing protein  31.75 
 
 		 197 aa  91.3  8e-18  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.94015  n/a   
 
 
-
 
NC_009036  Sbal_4419  resolvase domain-containing protein  31.52 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00736052  normal  0.464308 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2084  resolvase domain-containing protein  31.52 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2173  resolvase domain-containing protein  31.52 
 
 		 196 aa  89.7  2e-17  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2494  resolvase domain-containing protein  31.94 
 
 		 191 aa  89  4e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2003  transposon Tn2501 resolvase  29.32 
 
 		 222 aa  85.1  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  decreased coverage  0.00181715  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2427  resolvase domain-containing protein  30.85 
 
 		 193 aa  84  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0929457  n/a   
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4223  resolvase domain-containing protein  29.94 
 
 		 194 aa  80.9  0.00000000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.150601  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3652  resolvase, N-terminal  32.09 
 
 		 192 aa  78.6  0.00000000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.000000770175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5792  resolvase TnpR  32.43 
 
 		 212 aa  72  0.000000000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.923438  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3423  Resolvase domain protein  31.95 
 
 		 185 aa  71.6  0.000000000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3135  resolvase TnpR  28.42 
 
 		 217 aa  67.8  0.0000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1807  resolvase domain-containing protein  27.08 
 
 		 201 aa  57.4  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.261116  unclonable  0.00000000603181 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  31.08 
 
 		 188 aa  57  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0088  resolvase domain-containing protein  25.69 
 
 		 199 aa  57  0.0000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.223955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2351  resolvase-like protein  27.04 
 
 		 235 aa  56.6  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.329475 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  27.22 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0279  recombinase  28.65 
 
 		 248 aa  55.8  0.0000004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.000482548  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0014  resolvase domain-containing protein  26.71 
 
 		 184 aa  55.5  0.0000005  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.125158  n/a   
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4084  resolvase domain-containing protein  27.52 
 
 		 188 aa  54.7  0.0000008  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.236689  normal  0.0346573 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0991  resolvase domain-containing protein  29.12 
 
 		 205 aa  54.3  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0378771  normal  1 
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  27.04 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  27.04 
 
 		 201 aa  53.1  0.000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2264  resolvase-like protein  29.58 
 
 		 183 aa  53.1  0.000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.0723164  hitchhiker  0.00531394 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  28.47 
 
 		 186 aa  52.4  0.000004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  27.67 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  30.2 
 
 		 189 aa  52.4  0.000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 201 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4775  resolvase domain-containing protein  29.86 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  29.86 
 
 		 189 aa  52.4  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4473  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  26.58 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0992302  decreased coverage  0.00348712 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4599  serine-based site-specific recombinase activity TnpR  26.58 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.0000321893  hitchhiker  0.00456228 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_15430  putative resolvase, essential for transposition  26.58 
 
 		 186 aa  52  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  7.34084e-16  unclonable  6.55355e-22 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0041  resolvase domain-containing protein  28.45 
 
 		 184 aa  52  0.000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.0000573211 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003898  resolvase putative  25.67 
 
 		 202 aa  51.6  0.000007  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4764  resolvase domain-containing protein  25.79 
 
 		 189 aa  51.6  0.000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  32.87 
 
 		 194 aa  51.6  0.000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_008573  Shewana3_4319  resolvase domain-containing protein  25.95 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0053  transposon Tn21 resolvase  25.95 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.509225 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5399  resolvase domain-containing protein  26.9 
 
 		 186 aa  51.2  0.000009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  decreased coverage  0.00909416  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.11 
 
 		 218 aa  50.8  0.00001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3464  resolvase domain-containing protein  26.58 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2381  Resolvase domain  26 
 
 		 196 aa  50.4  0.00002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3829  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008608  Ppro_3846  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.40246  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1914  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1490  resolvase domain-containing protein  28.97 
 
 		 183 aa  50.1  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.832501  hitchhiker  0.00333462 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2680  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 185 aa  50.1  0.00002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1206  Resolvase domain protein  26.58 
 
 		 186 aa  50.4  0.00002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1104  Resolvase domain  26 
 
 		 196 aa  49.3  0.00003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1256  resolvase domain-containing protein  26.42 
 
 		 185 aa  49.7  0.00003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.249423  n/a   
 
 
-
 
NC_004633  PSPTOA0011  resolvase, putative  23.42 
 
 		 181 aa  48.9  0.00004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  21.62 
 
 		 188 aa  48.9  0.00004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1594  resolvase domain-containing protein  23.91 
 
 		 189 aa  49.3  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.94865  normal  0.455677 
 
 
-
 
NC_009470  Acry_3553  resolvase domain-containing protein  28.65 
 
 		 181 aa  49.3  0.00004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.467372  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  25.95 
 
 		 186 aa  49.3  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0438  putative resolvase  26.88 
 
 		 318 aa  48.5  0.00006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008263  CPR_A0002  resolvase  23.31 
 
 		 190 aa  47.4  0.0001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000000141759  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0409  resolvase domain-containing protein  28.37 
 
 		 186 aa  47.4  0.0001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00000318958  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  26.9 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  26.62 
 
 		 197 aa  47.8  0.0001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal  1 
 
 
-
 
NC_011664  Sbal223_4352  Resolvase domain protein  27.04 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00813261  normal  1 
 
 
-
 
NC_011665  Sbal223_4489  Resolvase domain protein  27.04 
 
 		 186 aa  47.8  0.0001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000146883  normal  1 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5066  resolvase domain-containing protein  27.78 
 
 		 313 aa  47.4  0.0001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.436238  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  26.35 
 
 		 203 aa  47.8  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal  1 
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0037  transposon Tn21 resolvase  25 
 
 		 205 aa  47.4  0.0001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.335597 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1615  resolvase family site-specific recombinase  25.48 
 
 		 197 aa  46.6  0.0002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4228  resolvase family site-specific recombinase  25.83 
 
 		 187 aa  47.4  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.623835  n/a   
 
 
-
 
NC_008264  CPR_B0006  resolvase  24.54 
 
 		 189 aa  47  0.0002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00548662  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D08  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  31.58 
 
 		 193 aa  47  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.942713  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1125  resolvase domain-containing protein  27.12 
 
 		 184 aa  47  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.577602  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2033  resolvase domain-containing protein  28.95 
 
 		 192 aa  47  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.188765  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  23.45 
 
 		 184 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  30.82 
 
 		 192 aa  46.6  0.0003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2781  resolvase domain-containing protein  25.34 
 
 		 190 aa  46.2  0.0003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.183587  normal  0.43479 
 
 
-
 
NC_009432  Rsph17025_4382  resolvase domain-containing protein  28.67 
 
 		 194 aa  46.6  0.0003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2144  Resolvase domain protein  25.74 
 
 		 196 aa  46.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0618608  normal  1 
 
 
-
 
NC_010157  YpAngola_B0090  resolvase TnpR  25 
 
 		 183 aa  46.2  0.0003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.707126  normal  0.345515 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0545  hypothetical protein  22.95 
 
 		 186 aa  45.8  0.0004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.0606652 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0166  Resolvase domain protein  30.5 
 
 		 188 aa  45.8  0.0004  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>