More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3762 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3762  histidine kinase  100 
 
 		 339 aa  670    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.026612 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3277  histidine kinase  89.97 
 
 		 405 aa  597  1e-170  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.389696  normal  0.564269 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0185  histidine kinase  31.03 
 
 		 395 aa  113  5e-24  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000303796  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2510  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 640 aa  103  4e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1215  PAS  32.27 
 
 		 515 aa  102  1e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2326  histidine kinase  31.43 
 
 		 396 aa  102  1e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0153  histidine kinase  34.56 
 
 		 325 aa  100  2e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5386  two component sensor kinase  30.92 
 
 		 361 aa  101  2e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1121  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.07 
 
 		 661 aa  100  5e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1496  putative signal transduction histidine kinase  30.77 
 
 		 462 aa  97.8  3e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0938967  normal  0.650695 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3850  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 351 aa  96.7  5e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000154691  hitchhiker  0.000000000165716 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1494  sensor histidine kinase  32.23 
 
 		 351 aa  96.7  6e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000467986  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0301  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.59 
 
 		 748 aa  96.7  6e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4345  putative signal transduction histidine kinase  33.91 
 
 		 466 aa  96.3  6e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.262209 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1362  histidine kinase  31.08 
 
 		 351 aa  95.9  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0117705  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3669  histidine kinase  31.62 
 
 		 489 aa  95.1  1e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2171  histidine kinase  33.17 
 
 		 594 aa  95.5  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5078  histidine kinase  31.15 
 
 		 368 aa  95.5  1e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.45 
 
 		 463 aa  95.5  1e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0044  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.71 
 
 		 560 aa  94.4  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.158232 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1390  putative signal transduction histidine kinase  31.43 
 
 		 462 aa  95.1  2e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1232  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 334 aa  94.4  2e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.380961  normal  0.783946 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1652  histidine kinase  33.18 
 
 		 373 aa  94.4  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000168648  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19690  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.43 
 
 		 352 aa  94  3e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1600  sensor histidine kinase  30.28 
 
 		 351 aa  94.4  3e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000000696667  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1983  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 		 469 aa  93.6  4e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.143525 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1347  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.31288  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1456  sensor histidine kinase  30.92 
 
 		 351 aa  93.6  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00592106  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1321  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000000375238  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1320  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00123004  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1530  sensor histidine kinase  31.75 
 
 		 351 aa  93.2  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.90364e-25 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4226  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.56 
 
 		 682 aa  92.4  9e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.203059 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0252  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.57 
 
 		 591 aa  92  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0165579 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0974  histidine kinase  32.5 
 
 		 384 aa  92  1e-17  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.103866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4276  histidine kinase  33.93 
 
 		 309 aa  91.3  2e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.574796  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2612  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 391 aa  91.7  2e-17  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1562  sensor histidine kinase  29.88 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000749794  n/a   
 
 
-
 
NC_013207  Aaci_3079  histidine kinase  33.18 
 
 		 223 aa  90.9  3e-17  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1763  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 		 594 aa  90.9  3e-17  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1580  histidine kinase  31.8 
 
 		 349 aa  90.9  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2077  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 594 aa  90.5  3e-17  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0939  histidine kinase  30.84 
 
 		 363 aa  90.5  4e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0191  transmembrane two component system sensor kinase transcription regulator protein  33.03 
 
 		 458 aa  90.1  5e-17  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0364977 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2942  ATPase domain-containing protein  34.2 
 
 		 485 aa  89.4  7e-17  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3064  GAF sensor signal transduction histidine kinase  28.57 
 
 		 544 aa  89.4  9e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6559  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.62 
 
 		 541 aa  89  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.59439 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2414  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.02 
 
 		 545 aa  88.2  2e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2790  Sensor DegS domain protein  31.03 
 
 		 393 aa  87.8  2e-16  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38910  putative sensor kinase  29.03 
 
 		 216 aa  87.8  2e-16  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1809  histidine kinase  30.45 
 
 		 640 aa  88.2  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5321  histidine kinase  34.7 
 
 		 470 aa  87.8  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6031  Histidine kinase  33.81 
 
 		 338 aa  87.4  3e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.542402  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1308  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 381 aa  86.7  5e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000110665  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1296  GAF sensor signal transduction histidine kinase  33.63 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.99492 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0341  GAF sensor signal transduction histidine kinase  32.44 
 
 		 725 aa  86.7  5e-16  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0143238  hitchhiker  0.0051816 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0946  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.39 
 
 		 1229 aa  86.7  6e-16  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21830  histidine kinase  28.51 
 
 		 391 aa  86.3  6e-16  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00305219  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2056  histidine kinase  31.31 
 
 		 475 aa  86.7  6e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0284  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.51 
 
 		 591 aa  86.7  6e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2849  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 682 aa  86.3  8e-16  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.790064  normal  0.747278 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3937  histidine kinase  27.43 
 
 		 366 aa  86.3  8e-16  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0383335  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7700  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.2 
 
 		 541 aa  85.9  9e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.163324  normal  0.507763 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1105  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 		 546 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1400  histidine kinase  31.13 
 
 		 413 aa  85.5  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.558809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0795  histidine kinase  33.49 
 
 		 494 aa  85.5  0.000000000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.782448  n/a   
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5200  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.32 
 
 		 695 aa  85.5  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1356  histidine kinase  30.92 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2086  signal transduction histidine kinase NarQ  31 
 
 		 671 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.252663 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0227  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.58 
 
 		 421 aa  84.7  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4230  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 478 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.304751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1864  Sensor DegS domain protein  26.46 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000165606  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3162  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.62 
 
 		 381 aa  84  0.000000000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.541775  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1955  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 		 374 aa  83.6  0.000000000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.630058  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2942  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.48 
 
 		 333 aa  83.6  0.000000000000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.940404  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5127  PAS/PAC sensor Signal transduction histidine kinase  33.78 
 
 		 799 aa  83.6  0.000000000000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1706  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.23 
 
 		 564 aa  84  0.000000000000004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.98975  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1122  histidine kinase  31.67 
 
 		 467 aa  84  0.000000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.94341 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2131  sensor histidine kinase  30.58 
 
 		 394 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0893  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 		 359 aa  83.6  0.000000000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1596  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 		 420 aa  83.6  0.000000000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.310205  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3104  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 		 485 aa  83.2  0.000000000000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1685  Histidine kinase  33.06 
 
 		 397 aa  83.2  0.000000000000006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.842631 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1941  sensor histidine kinase  30.63 
 
 		 394 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2043  histidine kinase  24.7 
 
 		 388 aa  83.2  0.000000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_935  sensor histidine kinase  28.95 
 
 		 1226 aa  83.2  0.000000000000006  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.67 
 
 		 801 aa  83.2  0.000000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1064  sensory box sensor histidine kinase  42.27 
 
 		 1101 aa  83.2  0.000000000000007  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3132  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 424 aa  82.8  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.345137  normal  0.393373 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0607  histidine kinase  30.84 
 
 		 413 aa  82.8  0.000000000000008  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0927  Histidine kinase  35.35 
 
 		 407 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.163259  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2549  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.6 
 
 		 456 aa  82.8  0.000000000000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1992  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.41 
 
 		 574 aa  82.8  0.000000000000009  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0873865  normal  0.754427 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1880  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.89 
 
 		 662 aa  82.4  0.000000000000009  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.0862215  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1965  histidine kinase  28.89 
 
 		 662 aa  82.4  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.632766  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2521  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.65 
 
 		 594 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0533071  normal  0.360744 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0966  Signal transduction histidine kinase  30.37 
 
 		 332 aa  82.4  0.00000000000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.763704  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1268  histidine kinase  26.72 
 
 		 392 aa  82.4  0.00000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2438  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 599 aa  81.6  0.00000000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1998  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.44 
 
 		 658 aa  81.3  0.00000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5015  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 		 399 aa  81.3  0.00000000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.36327  normal  0.324397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>