More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3442 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3442  SecC motif-containing protein  100 
 
 		 284 aa  575  1.0000000000000001e-163  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.75762  normal  0.0634478 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1602  SecC motif-containing protein  84.81 
 
 		 286 aa  483  1e-135  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.197596  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0603  SEC-C motif domain protein  48.13 
 
 		 288 aa  250  2e-65  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000558134  normal  0.543762 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3341  SecC motif-containing protein  45.39 
 
 		 325 aa  246  2e-64  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1290  SEC-C motif domain protein  28.03 
 
 		 457 aa  68.9  0.00000000009  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.98442e-32 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1143  SecC motif-containing protein  30.61 
 
 		 864 aa  68.9  0.0000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1402  hypothetical protein  25.7 
 
 		 454 aa  65.1  0.000000001  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3272  SecC motif-containing protein  28.97 
 
 		 669 aa  60.8  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2827  preprotein translocase subunit SecA  90.91 
 
 		 932 aa  59.7  0.00000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.235252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3488  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 904 aa  57.8  0.0000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.185524 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0611  preprotein translocase subunit SecA  95.24 
 
 		 910 aa  57.8  0.0000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.26873  normal  0.632332 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2039  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 914 aa  57  0.0000003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.732229  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3418  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 909 aa  57  0.0000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.487797  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04358  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 912 aa  57  0.0000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3540  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2540  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.569911  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1320  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3535  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.90437  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3654  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 932 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.321986  normal  0.974408 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1127  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 930 aa  57  0.0000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.201414  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3242  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.358257  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1959  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 914 aa  57  0.0000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3515  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.275917  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0462  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 931 aa  57  0.0000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.125035  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0087  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 932 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0569  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 932 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0539  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 932 aa  56.6  0.0000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.117164  normal  0.600522 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13340  preprotein translocase subunit SecA  90.48 
 
 		 915 aa  55.8  0.0000007  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2970  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 924 aa  55.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0497  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 931 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.433884  normal  0.665829 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0495  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 936 aa  55.1  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.132079  normal  0.377475 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3118  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 930 aa  55.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.224374  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3193  preprotein translocase, SecA subunit  95 
 
 		 992 aa  55.1  0.000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.22203 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0472  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 931 aa  55.1  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.611662  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10624  hypothetical protein  27.51 
 
 		 855 aa  55.5  0.000001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.75536 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2664  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 936 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3461  preprotein translocase subunit SecA  76 
 
 		 936 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.126577  decreased coverage  0.000173777 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0738  preprotein translocase subunit SecA  86.36 
 
 		 921 aa  55.1  0.000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.687802  normal  0.0603491 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4232  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 930 aa  54.7  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.41363  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2834  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 934 aa  54.7  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.745089 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3079  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 934 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7284  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 1118 aa  54.3  0.000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.884849  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3351  SEC-C motif domain protein  28.48 
 
 		 731 aa  54.7  0.000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0736  protein translocase subunit secA  74.07 
 
 		 962 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0236421  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0773  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 962 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0773  preprotein translocase, SecA subunit  74.07 
 
 		 962 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0780  preprotein translocase, SecA subunit  71.43 
 
 		 944 aa  54.3  0.000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.358011  normal  0.32086 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3211  SEC-C motif domain protein  56.41 
 
 		 731 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.777206  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2714  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 934 aa  54.7  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0131  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 923 aa  53.9  0.000003  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.449185 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1677  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 1004 aa  53.9  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.243336  normal  0.336231 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57220  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 916 aa  53.5  0.000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0943  SecC motif-containing protein  61.11 
 
 		 291 aa  53.9  0.000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000368461  hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3346  SEC-C motif domain protein  41.67 
 
 		 104 aa  53.5  0.000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0931  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 939 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.667374  normal  0.20776 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0828  preprotein translocase subunit SecA  81.82 
 
 		 921 aa  53.1  0.000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2181  protein translocase subunit secA  85.71 
 
 		 912 aa  53.5  0.000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.139816  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5240  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 1067 aa  53.5  0.000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0916466  normal  0.569995 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4974  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 916 aa  53.5  0.000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2851  SecA protein  89.47 
 
 		 903 aa  53.1  0.000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1791  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 958 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.29973  normal  0.0159583 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4454  preprotein translocase, SecA subunit  80.95 
 
 		 893 aa  52.8  0.000007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1999  preprotein translocase, SecA subunit  85.71 
 
 		 920 aa  52.8  0.000007  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.974197  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3583  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 900 aa  52.8  0.000007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.00157477  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3254  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 956 aa  52.8  0.000007  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0148  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000541074 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1478  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 970 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.301651  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0148  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0152  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0708  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 958 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0145  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0153  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 901 aa  52.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00245139  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2744  protein translocase subunit secA  81.82 
 
 		 918 aa  52.8  0.000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.413449  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1756  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 970 aa  52.8  0.000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0619  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 897 aa  52.4  0.000008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00370749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0737  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 963 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0793771  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0420  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 844 aa  52.4  0.000008  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.737547  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1478  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 970 aa  52.4  0.000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.130752 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0858  preprotein translocase, SecA subunit  100 
 
 		 980 aa  52.4  0.000008  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00606549  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2909  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 904 aa  52.4  0.000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00674204  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3771  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 916 aa  52.4  0.000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0995653  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3509  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 904 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.259592  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3378  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 904 aa  52.4  0.000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000297957  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3689  preprotein translocase subunit SecA  94.74 
 
 		 922 aa  52.4  0.000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3502  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 901 aa  52  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.145428  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5497  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 915 aa  52  0.00001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.441973  normal  0.259871 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0759  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 917 aa  52  0.00001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2525  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 949 aa  52.4  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0225  preprotein translocase, SecA subunit  89.47 
 
 		 914 aa  52  0.00001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0103  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 901 aa  52  0.00001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000742397  normal  0.588036 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03250  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 902 aa  51.6  0.00001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0770  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 910 aa  52  0.00001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00309975  normal  0.728457 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3803  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 907 aa  52  0.00001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000517033  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0100  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 901 aa  52  0.00001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000000373806  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2911  preprotein translocase subunit SecA  77.27 
 
 		 921 aa  52  0.00001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.507728  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3559  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 901 aa  52  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0691587  hitchhiker  0.00319368 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2234  protein translocase subunit secA  89.47 
 
 		 908 aa  52  0.00001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0826801  normal  0.15252 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0363  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 907 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000126522  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0362  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 908 aa  52  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0221508  unclonable  0.0000124471 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0796  preprotein translocase subunit SecA  89.47 
 
 		 917 aa  52  0.00001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.392281  normal  0.48861 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>