65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3370 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_3370  band 7 protein  100 
 
 		 306 aa  625  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.40732  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2221  band 7 protein  89.87 
 
 		 310 aa  572  1.0000000000000001e-162  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.814731  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3763  band 7 protein  74.02 
 
 		 303 aa  441  1e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.882094  normal  1 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0842  band 7 protein  23.48 
 
 		 290 aa  62  0.00000001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.360301 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1052  band 7 protein  27.71 
 
 		 298 aa  60.1  0.00000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4807  band 7 protein  28.19 
 
 		 336 aa  55.5  0.000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1572  band 7 protein  23.63 
 
 		 307 aa  54.7  0.000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1703  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.6 
 
 		 345 aa  54.3  0.000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1731  HflC protein  26.69 
 
 		 295 aa  53.1  0.000005  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000316611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2098  HflC protein  22.88 
 
 		 300 aa  52.8  0.000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0730184 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0606  band 7 protein  22.81 
 
 		 380 aa  52.8  0.000008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.907805  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1327  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.81 
 
 		 285 aa  52.4  0.000009  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.7737 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0832  band 7 protein  24.31 
 
 		 289 aa  52.4  0.000009  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.687867  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0970  band 7 protein  23.83 
 
 		 356 aa  52  0.00001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.196355  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1863  stomatin like protein  23.15 
 
 		 312 aa  52  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.510549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3684  band 7 protein  23.28 
 
 		 327 aa  50.8  0.00003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2195  HflC protein  22.87 
 
 		 301 aa  50.4  0.00004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0657  band 7 protein  24.64 
 
 		 386 aa  49.7  0.00007  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.398051  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3264  band 7 protein  25.67 
 
 		 359 aa  48.9  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.0364403  normal  0.314741 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0307  band 7 protein  24.19 
 
 		 285 aa  48.9  0.0001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2809  band 7 protein  25.84 
 
 		 293 aa  47.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.361864  normal  0.174393 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3454  band 7 protein  25 
 
 		 307 aa  48.1  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.944398 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1938  band 7 protein  22.63 
 
 		 381 aa  48.1  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1352  HflC protein  25.74 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1396  hflC protein  25.74 
 
 		 300 aa  48.1  0.0002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.685975  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2641  band 7 protein  22.93 
 
 		 409 aa  47.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0069  band 7 protein  25.36 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.212621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8850  SPFH/band 7 domain protein  25.97 
 
 		 356 aa  47  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1401  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.36 
 
 		 293 aa  47  0.0004  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2578  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  22.16 
 
 		 376 aa  47  0.0004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1614  band 7 protein  23.27 
 
 		 361 aa  46.6  0.0005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1795  HflC protein  25.46 
 
 		 300 aa  46.2  0.0006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2911  band 7 protein  23.62 
 
 		 376 aa  46.2  0.0007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.484171  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5164  band 7 protein  24.58 
 
 		 298 aa  46.2  0.0007  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1748  HflC protein  27.47 
 
 		 328 aa  46.2  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.224393  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0072  HflC protein  23.96 
 
 		 302 aa  45.8  0.0009  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.055112  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0666  HflC protein  21.77 
 
 		 289 aa  45.8  0.001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2039  HflC protein  23.2 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.826229 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0768  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  24.15 
 
 		 295 aa  45.4  0.001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.441934 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0703  HflC protein  24.1 
 
 		 281 aa  45.1  0.001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1156  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  21.16 
 
 		 318 aa  45.4  0.001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.149138  normal  0.809172 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0702  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.18 
 
 		 314 aa  44.7  0.002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.718702  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2078  hypothetical protein  22.26 
 
 		 303 aa  45.1  0.002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1571  band 7 protein  23.7 
 
 		 508 aa  45.1  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.225372 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0502  band 7 protein  21.65 
 
 		 363 aa  45.1  0.002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0935  antifreeze protein, type I  24 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0721084  normal  0.297325 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1828  HflC protein  24.04 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.540549  normal  0.180131 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0504  band 7 protein  24.74 
 
 		 361 aa  43.9  0.003  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2261  antifreeze protein, type I  24 
 
 		 369 aa  43.9  0.003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.633229  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1742  HflC protein  24.04 
 
 		 299 aa  43.9  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0613  band 7 protein  24.57 
 
 		 295 aa  43.9  0.003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.953423  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0014  band 7 protein  20.12 
 
 		 267 aa  43.5  0.004  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3992  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  26.12 
 
 		 296 aa  43.9  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3087  band 7 protein  24.28 
 
 		 360 aa  43.5  0.005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.681726  hitchhiker  0.00992897 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1179  band 7 protein  22.28 
 
 		 403 aa  43.1  0.005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.473377  decreased coverage  0.000901683 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0923  putative HflC protein  25.13 
 
 		 290 aa  43.5  0.005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0462  band 7 protein  24.14 
 
 		 304 aa  43.5  0.005  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2227  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  23.95 
 
 		 359 aa  43.1  0.005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.491741  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1352  SPFH domain-containing protein/band 7 family protein  25.81 
 
 		 314 aa  43.1  0.006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1491  band 7 protein  24.05 
 
 		 368 aa  43.1  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0171305  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1804  HflC protein  23.5 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.266909  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2990  band 7 protein  22.22 
 
 		 384 aa  42.4  0.009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0844  hypothetical protein  21.26 
 
 		 290 aa  42.4  0.009  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6275  HflC protein  23.5 
 
 		 299 aa  42.4  0.009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.364844  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0942  band 7 protein  21.48 
 
 		 259 aa  42.4  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.69232  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>