254 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_3243 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009767  Rcas_3243  beta-lactamase domain-containing protein  100 
 
 
308 aa  620  1e-176  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.012802  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2143  beta-lactamase domain-containing protein  83.44 
 
 
308 aa  518  1e-146  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2223  beta-lactamase domain protein  53.49 
 
 
310 aa  301  1e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0323902  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1472  beta-lactamase domain protein  44.7 
 
 
307 aa  252  5.000000000000001e-66  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.765905  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2947  beta-lactamase-like protein  43.33 
 
 
309 aa  228  7e-59  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1348  beta-lactamase-like protein  42.14 
 
 
307 aa  198  1.0000000000000001e-49  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.724396  normal  0.104789 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4192  beta-lactamase domain protein  43.19 
 
 
291 aa  190  2e-47  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0846  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 
319 aa  182  4.0000000000000006e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1530  beta-lactamase domain protein  37.93 
 
 
297 aa  173  2.9999999999999996e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.788095  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2019  beta-lactamase domain-containing protein  35.54 
 
 
308 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.677789  normal  0.140339 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1991  beta-lactamase domain protein  35.25 
 
 
310 aa  169  7e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2040  Zn-dependent hydrolase  36.33 
 
 
331 aa  169  8e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2163  beta-lactamase domain protein  34.94 
 
 
312 aa  164  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0111163  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6066  beta-lactamase domain protein  34.3 
 
 
308 aa  163  3e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0136  beta-lactamase domain-containing protein  40 
 
 
305 aa  158  1e-37  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3036  Zn-dependent hydrolase  37.55 
 
 
337 aa  158  1e-37  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.111196  normal  0.908964 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5455  beta-lactamase domain protein  36.51 
 
 
322 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.245866  normal  0.258375 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2482  beta-lactamase domain protein  32.79 
 
 
318 aa  155  1e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2978  beta-lactamase domain-containing protein  35.15 
 
 
298 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0655  Beta-lactamase-like  36.68 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.336467  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1813  beta-lactamase domain protein  34.32 
 
 
318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000846092  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1319  beta-lactamase domain protein  35.98 
 
 
302 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1924  beta-lactamase related protein  32.92 
 
 
326 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3186  metallo-beta-lactamase family protein  32.92 
 
 
323 aa  142  7e-33  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2129  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 
323 aa  142  8e-33  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1963  beta-lactamase domain-containing protein  32.38 
 
 
321 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0193185  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2269  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 
323 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1948  Zn-dependent hydrolase  32.51 
 
 
326 aa  140  3e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0179068  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1030  beta-lactamase domain protein  36.55 
 
 
325 aa  140  3e-32  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2152  metallo-beta-lactamase family protein  32.51 
 
 
323 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3306  beta-lactamase domain protein  35.15 
 
 
320 aa  139  8.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1969  metallo-beta-lactamase family protein  32.1 
 
 
326 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2117  metallo-beta-lactamase family protein  32.1 
 
 
323 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.624298  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1910  beta-lactamase domain protein  33.56 
 
 
301 aa  135  9.999999999999999e-31  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.107716  normal  0.197937 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02855  metallo-beta-lactamase superfamily protein  33.48 
 
 
312 aa  135  9.999999999999999e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0007  beta-lactamase domain protein  32.31 
 
 
306 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.963887 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2233  Beta-lactamase-like  35.16 
 
 
316 aa  132  5e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00000172042  hitchhiker  0.000000000286118 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4188  beta-lactamase domain-containing protein  34.35 
 
 
361 aa  130  2.0000000000000002e-29  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0768  beta-lactamase domain-containing protein  31.62 
 
 
307 aa  130  3e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00503809  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0376  beta-lactamase domain protein  34.85 
 
 
308 aa  129  5.0000000000000004e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0740  beta-lactamase domain protein  33.19 
 
 
304 aa  129  6e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal  0.429662 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2704  metallo-beta-lactamase superfamily protein  32.1 
 
 
316 aa  129  7.000000000000001e-29  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2185  beta-lactamase domain protein  33.47 
 
 
305 aa  128  1.0000000000000001e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.714423  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2919  beta-lactamase related protein  31.23 
 
 
327 aa  128  1.0000000000000001e-28  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.352974  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1869  Beta-lactamase-like  36.23 
 
 
330 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.356372  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1506  beta-lactamase-like protein  33.74 
 
 
320 aa  125  6e-28  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4355  beta-lactamase domain protein  31.27 
 
 
297 aa  125  8.000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.27465  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1666  beta-lactamase domain-containing protein  32.58 
 
 
328 aa  124  2e-27  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2520  beta-lactamase domain-containing protein  33.2 
 
 
306 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0118194  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0266  beta-lactamase domain-containing protein  35.5 
 
 
306 aa  120  3e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.024576  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1649  beta-lactamase domain-containing protein  31.4 
 
 
333 aa  118  9.999999999999999e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.658515 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0244  beta-lactamase domain protein  31.43 
 
 
310 aa  117  1.9999999999999998e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.3408  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3160  beta-lactamase domain protein  35.89 
 
 
318 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3052  beta-lactamase domain protein  35.41 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.944882  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2964  Beta-lactamase-like  35.41 
 
 
318 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0153  beta-lactamase domain-containing protein  29.41 
 
 
296 aa  105  9e-22  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0871  beta-lactamase domain-containing protein  30.95 
 
 
264 aa  95.9  8e-19  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0621  beta-lactamase domain-containing protein  31.9 
 
 
266 aa  94.4  2e-18  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1591  beta-lactamase domain-containing protein  28.63 
 
 
266 aa  94  3e-18  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1024  beta-lactamase domain-containing protein  28.87 
 
 
307 aa  92.8  7e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0125344  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0639  beta-lactamase domain-containing protein  28.76 
 
 
267 aa  91.7  2e-17  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1454  beta-lactamase domain-containing protein  29.13 
 
 
259 aa  88.6  1e-16  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0546  beta-lactamase-like protein  31.99 
 
 
297 aa  85.1  0.000000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.858223  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0685  beta-lactamase domain protein  29.47 
 
 
267 aa  84  0.000000000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0528  beta-lactamase-like protein  29.3 
 
 
317 aa  73.9  0.000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.000304282  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1322  beta-lactamase domain protein  30.51 
 
 
329 aa  67.8  0.0000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1440  beta-lactamase domain-containing protein  27.6 
 
 
331 aa  65.1  0.000000001  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.482344  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0307  beta-lactamase domain-containing protein  26.88 
 
 
208 aa  60.5  0.00000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.85444  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0390  beta-lactamase domain protein  28.8 
 
 
318 aa  57.8  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2578  beta-lactamase domain protein  31.15 
 
 
340 aa  58.2  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0468  beta-lactamase domain protein  28.19 
 
 
348 aa  57.4  0.0000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  decreased coverage  0.00306027  normal  0.41592 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4236  Beta-lactamase-like  30.26 
 
 
500 aa  56.6  0.0000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1162  beta-lactamase domain-containing protein  30.15 
 
 
234 aa  56.6  0.0000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0619  beta-lactamase domain protein  28.92 
 
 
240 aa  55.1  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.256454 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3171  beta-lactamase domain protein  29.06 
 
 
211 aa  55.1  0.000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.343145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3947  beta-lactamase domain protein  26.74 
 
 
246 aa  54.7  0.000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.304771  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4392  beta-lactamase domain protein  30.1 
 
 
497 aa  53.9  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0725  beta-lactamase domain protein  24.9 
 
 
303 aa  54.3  0.000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264304  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1138  beta-lactamase domain-containing protein  25.62 
 
 
221 aa  53.5  0.000004  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1111  Beta-lactamase  31.25 
 
 
299 aa  53.5  0.000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4369  beta-lactamase domain protein  29.59 
 
 
497 aa  53.1  0.000006  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1123  beta-lactamase-like protein  28.89 
 
 
214 aa  52.8  0.000007  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0569426  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4053  beta-lactamase domain-containing protein  31.69 
 
 
212 aa  52.8  0.000008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000967513 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0773  beta-lactamase domain protein  30.14 
 
 
320 aa  52.8  0.000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000303439 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4114  beta-lactamase domain-containing protein  29.68 
 
 
209 aa  52  0.00001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4375  metallo-beta-lactamase family protein  28.93 
 
 
209 aa  52.4  0.00001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3798  beta-lactamase domain protein  26.06 
 
 
324 aa  52  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  0.273419  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1446  beta-lactamase domain-containing protein  29.53 
 
 
215 aa  52  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.746343  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003129  hydroxyacylglutathione hydrolase  29.3 
 
 
216 aa  51.2  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000730462  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3586  metallo-beta-lactamase family protein  29.66 
 
 
219 aa  51.2  0.00002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4003  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 
209 aa  51.2  0.00002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1263  beta-lactamase domain protein  22.82 
 
 
231 aa  51.2  0.00002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.795749 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1728  beta-lactamase domain protein  28.51 
 
 
324 aa  51.2  0.00002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4875  hydroxyacylglutathione hydrolase  30.06 
 
 
257 aa  51.6  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1288  beta-lactamase-like protein  30.06 
 
 
329 aa  51.6  0.00002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4526  beta-lactamase domain protein  23.04 
 
 
307 aa  50.8  0.00003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00779806  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0228  beta-lactamase domain-containing protein  32.64 
 
 
212 aa  50.8  0.00003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3173  beta-lactamase domain protein  26.34 
 
 
344 aa  50.1  0.00004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4281  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 
209 aa  50.1  0.00004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4013  metallo-beta-lactamase family protein  30.97 
 
 
209 aa  50.4  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.098472  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>