43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_2596 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_2596  hypothetical protein  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3500  hypothetical protein  87.4 
 
 		 346 aa  437  9.999999999999999e-123  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3061  hypothetical protein  28.97 
 
 		 345 aa  106  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.41699  normal  0.49585 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2417  hypothetical protein  28.57 
 
 		 345 aa  104  1e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.486324 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0771  hypothetical protein  27.59 
 
 		 348 aa  101  1e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3828  hypothetical protein  28.63 
 
 		 361 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2627  hypothetical protein  26.85 
 
 		 355 aa  63.5  0.000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0802533  normal  0.461146 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_02480  cation-translocating P-type ATPase with extended N-terminal transmembrane region  30.77 
 
 		 1195 aa  61.6  0.00000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3323  hypothetical protein  35.9 
 
 		 801 aa  57  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.991041  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0597  hypothetical protein  34.62 
 
 		 392 aa  56.2  0.0000005  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.729747  hitchhiker  0.00000000000000683959 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1298  hypothetical protein  33.05 
 
 		 342 aa  52.8  0.000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3430  hypothetical protein  31.5 
 
 		 783 aa  51.6  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.011046  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0706  hypothetical protein  32.08 
 
 		 811 aa  51.6  0.00001  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.778922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5132  hypothetical protein  30.66 
 
 		 803 aa  51.2  0.00002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3255  hypothetical protein  42.67 
 
 		 313 aa  51.2  0.00002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.153938 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1489  protein of unknown function DUF470  33.33 
 
 		 861 aa  51.2  0.00002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.70166  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2430  hypothetical protein  31.63 
 
 		 843 aa  50.1  0.00003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.0000163867  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1204  hypothetical protein  29.2 
 
 		 795 aa  49.7  0.00004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1413  hypothetical protein  29.36 
 
 		 318 aa  49.7  0.00005  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00553932  normal  0.0166848 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0723  hypothetical protein  26.59 
 
 		 326 aa  49.3  0.00006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0275507  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8950  integral membrane protein-like protein  36.14 
 
 		 793 aa  48.9  0.00007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3190  hypothetical protein  25.93 
 
 		 875 aa  48.5  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3856  hypothetical protein  33.06 
 
 		 329 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.213587  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0733  hypothetical protein  24.17 
 
 		 350 aa  47.8  0.0002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.97575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0170  hypothetical protein  35.42 
 
 		 318 aa  47.8  0.0002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1403  hypothetical protein  28.44 
 
 		 318 aa  47  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.209526  normal  0.367043 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2537  hypothetical protein  28.57 
 
 		 341 aa  46.2  0.0004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0828  hypothetical protein  25.81 
 
 		 339 aa  46.6  0.0004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.175071  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1950  integral membrane protein  27.27 
 
 		 773 aa  46.2  0.0005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.298583  normal  0.0915506 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2780  hypothetical protein  28.33 
 
 		 333 aa  45.8  0.0006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0650  integral membrane protein  23.85 
 
 		 342 aa  45.4  0.0007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.182615  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0835  hypothetical protein  22 
 
 		 340 aa  45.4  0.0009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1560  hypothetical protein  35.71 
 
 		 792 aa  44.3  0.002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.596723  normal  0.0176466 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7814  hypothetical protein  28.3 
 
 		 854 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0140  hypothetical protein  26.92 
 
 		 351 aa  43.5  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00167342 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4203  hypothetical protein  25.97 
 
 		 374 aa  43.5  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0586399  normal  0.529559 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0450  integral membrane protein-like protein  26.24 
 
 		 298 aa  42.7  0.005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00950527  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1494  hypothetical protein  26.72 
 
 		 333 aa  42.7  0.005  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.060435 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0465  hypothetical protein  26.24 
 
 		 298 aa  42.4  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1977  hypothetical protein  29.29 
 
 		 853 aa  42.4  0.007  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1614  hypothetical protein  30.12 
 
 		 320 aa  42.4  0.007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10596  integral membrane protein  28.69 
 
 		 795 aa  42  0.01  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0917  hypothetical protein  34.52 
 
 		 447 aa  41.6  0.01  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.394263  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>