More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1130 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1130  methyltransferase small  100 
 
 		 198 aa  410  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.157552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3753  methyltransferase small  92.42 
 
 		 198 aa  380  1e-105  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0210542  unclonable  0.0000136364 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3679  methyltransferase small  75.9 
 
 		 202 aa  299  2e-80  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0110795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2367  methyltransferase small  37.99 
 
 		 205 aa  121  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.709959  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2883  methyltransferase small  40.52 
 
 		 195 aa  112  3e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0553  methyltransferase small  38.51 
 
 		 196 aa  108  4.0000000000000004e-23  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0322683  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0056  methyltransferase small  35.4 
 
 		 202 aa  106  3e-22  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.612359  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0055  methyltransferase small  34.57 
 
 		 202 aa  103  2e-21  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.494853 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0047  hypothetical protein  34.16 
 
 		 202 aa  100  1e-20  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.23937  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2935  methyltransferase small  36.76 
 
 		 196 aa  100  1e-20  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0097  methyltransferase  37.58 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00285716  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0095  methyltransferase  37.58 
 
 		 199 aa  96.3  2e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00417025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0112  ybxB protein  37.58 
 
 		 199 aa  97.1  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  8.23527e-62 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0101  ybxB protein  37.58 
 
 		 199 aa  95.9  3e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.021137  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0132  ybxB protein  37.58 
 
 		 199 aa  96.3  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000351533  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0101  ybxB protein  37.58 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0743942  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0101  methyltransferase  37.58 
 
 		 199 aa  95.5  4e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00115806  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0213  methyltransferase small  36 
 
 		 192 aa  95.1  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5204  ybxB protein  36.24 
 
 		 199 aa  94.7  8e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000704133  unclonable  8.56715e-26 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0122  ybxB protein  35.57 
 
 		 199 aa  90.9  1e-17  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000225895  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0096  methyltransferase small  34.23 
 
 		 199 aa  89.4  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0441969  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0102  methyltransferase small  31.85 
 
 		 200 aa  83.6  0.000000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00000000344491  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0095  methyltransferase small  38.93 
 
 		 199 aa  83.2  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000227182  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0098  methyltransferase small  33.79 
 
 		 202 aa  81.6  0.000000000000007  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1561  methyltransferase small  35.44 
 
 		 205 aa  80.9  0.00000000000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.345198  hitchhiker  0.0075327 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0182  hypothetical protein  31.79 
 
 		 202 aa  80.1  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.56568  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1573  methyltransferase small  32.65 
 
 		 200 aa  80.5  0.00000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0163  16S RNA G1207 methylase  34.59 
 
 		 218 aa  79.7  0.00000000000002  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1532  16S RNA G1207 methylase RsmC  33.09 
 
 		 227 aa  80.5  0.00000000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0496562  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0183  methyltransferase small  29.94 
 
 		 198 aa  79.7  0.00000000000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1465  methyltransferase small  32.3 
 
 		 204 aa  78.6  0.00000000000005  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0738691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41240  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.33 
 
 		 333 aa  78.6  0.00000000000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0354958  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1053  methyltransferase small  31.97 
 
 		 200 aa  77.8  0.00000000000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0790  methyltransferase small  28.85 
 
 		 198 aa  77.8  0.0000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.196081  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0339  methyltransferase small  30.61 
 
 		 200 aa  75.9  0.0000000000004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0564  hypothetical protein  29.75 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.000796636  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0578  hypothetical protein  29.75 
 
 		 202 aa  74.3  0.000000000001  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00141674  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0188  methyltransferase small  29.86 
 
 		 196 aa  74.3  0.000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1683  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  33.14 
 
 		 205 aa  73.2  0.000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3892  methyltransferase small  31.68 
 
 		 201 aa  72.8  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.488752  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1467  methyltransferase small  31.06 
 
 		 207 aa  73.2  0.000000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000184007 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_07280  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  36.02 
 
 		 211 aa  72.8  0.000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.385173  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1221  methyltransferase small  34.18 
 
 		 200 aa  73.2  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0856374 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1502  methyltransferase small  35.19 
 
 		 202 aa  72  0.000000000005  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0750839  normal  0.296506 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2010  methyltransferase small  35.85 
 
 		 199 aa  71.2  0.000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1368  methyltransferase small  29.09 
 
 		 186 aa  71.2  0.00000000001  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_23080  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  28.79 
 
 		 217 aa  70.9  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0618095 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0957  methyltransferase small  27.15 
 
 		 202 aa  70.9  0.00000000001  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0639  methyltransferase small  28.08 
 
 		 201 aa  70.9  0.00000000001  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.465584  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1165  methyltransferase small  33.13 
 
 		 210 aa  70.1  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.0025369  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0582  methyltransferase small domain protein  29.78 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000002  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.719477 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0761  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.09 
 
 		 332 aa  69.7  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0952  hypothetical protein  31.65 
 
 		 196 aa  69.7  0.00000000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0886021  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0789  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  36.09 
 
 		 332 aa  69.3  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.482733 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1254  methyltransferase small  31.28 
 
 		 210 aa  68.9  0.00000000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0852  hypothetical protein  32.37 
 
 		 196 aa  68.9  0.00000000004  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4427  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.59 
 
 		 331 aa  68.6  0.00000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1050  methyltransferase small  37.12 
 
 		 225 aa  68.6  0.00000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  0.157378 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4283  methyltransferase small  32.75 
 
 		 201 aa  68.2  0.00000000007  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.128853  hitchhiker  0.00530067 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0803  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  34.59 
 
 		 332 aa  67.4  0.0000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3378  methyltransferase small  28.4 
 
 		 207 aa  67.4  0.0000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.480246  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04246  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.15683  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_04212  hypothetical protein  35.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.200167  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3628  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0414269  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3665  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  31.93 
 
 		 331 aa  66.6  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3686  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.217552  hitchhiker  0.00016948 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4914  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000234243  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4918  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.00252655  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5883  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.6  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.336763  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4966  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431948  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4605  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 343 aa  66.2  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000649874  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3870  methyltransferase small  32.9 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61220  hypothetical protein  32.93 
 
 		 332 aa  65.9  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.527408  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3620  methyltransferase small  28 
 
 		 201 aa  65.5  0.0000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000543036  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1127  methyltransferase small  32.59 
 
 		 210 aa  65.1  0.0000000006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000198355  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2378  methyltransferase small  45.45 
 
 		 341 aa  64.7  0.0000000008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4964  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 342 aa  64.7  0.0000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.00179249  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4912  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00321391  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4877  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.71 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  decreased coverage  0.0000245426  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2376  methyltransferase small  35.34 
 
 		 228 aa  64.7  0.000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00101773  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4970  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.11 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  hitchhiker  0.000752166  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4809  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.71 
 
 		 342 aa  64.3  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.0000202401  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0530  16S ribosomal RNA m2G1207 methyltransferase  35.88 
 
 		 342 aa  63.5  0.000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0427566  normal  0.0234717 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2720  methyltransferase small  29.66 
 
 		 199 aa  63.2  0.000000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.269634  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2548  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  28.67 
 
 		 383 aa  63.2  0.000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.525194 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5273  hypothetical protein  31.93 
 
 		 332 aa  63.5  0.000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1798  methyltransferase small  35.66 
 
 		 203 aa  62.8  0.000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.397225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0365  16S RNA G1207 methylase RsmC  27.56 
 
 		 217 aa  63.2  0.000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000491167 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2886  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25 
 
 		 401 aa  62.8  0.000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0986  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  30.53 
 
 		 332 aa  62.4  0.000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23400  16S RNA G1207 methylase RsmC  28.57 
 
 		 411 aa  62.4  0.000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.498455  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3702  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  33.33 
 
 		 356 aa  62.4  0.000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3099  rRNA (guanine-N(2)-)-methyltransferase  25.39 
 
 		 365 aa  62  0.000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3417  methyltransferase small  36.09 
 
 		 378 aa  62  0.000000006  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.173456  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1502  methyltransferase small  32.37 
 
 		 225 aa  61.6  0.000000007  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1146  ribosomal RNA small subunit methyltransferase C  29.77 
 
 		 332 aa  61.6  0.000000008  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11150  16S RNA G1207 methylase RsmC  31.33 
 
 		 401 aa  61.6  0.000000008  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5261  hypothetical protein  34.11 
 
 		 374 aa  61.2  0.000000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61090  hypothetical protein  34.11 
 
 		 374 aa  61.2  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5504  16S rRNA m(2)G 1207 methyltransferase  35.61 
 
 		 209 aa  61.2  0.00000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0852168  normal  0.0738737 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>