More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0585 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0585  phosphate uptake regulator, PhoU  100 
 
 		 214 aa  411  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.504755 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4153  phosphate uptake regulator, PhoU  71.56 
 
 		 224 aa  281  6.000000000000001e-75  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.429365  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0239  phosphate uptake regulator, PhoU  41.04 
 
 		 218 aa  140  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0310  phosphate uptake regulator, PhoU  42.06 
 
 		 218 aa  139  3.9999999999999997e-32  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.368967  normal  0.0297359 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0031  phosphate uptake regulator, PhoU  37.2 
 
 		 219 aa  119  3.9999999999999996e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.320331  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2451  transcriptional regulator PhoU  36.18 
 
 		 232 aa  118  7.999999999999999e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.509556  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0992  phosphate uptake regulator, PhoU  39.15 
 
 		 219 aa  114  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1633  phosphate uptake regulator, PhoU  37.13 
 
 		 222 aa  110  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21540  phosphate uptake regulator, PhoU  33 
 
 		 215 aa  107  1e-22  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0974  hypothetical protein  35.78 
 
 		 228 aa  104  9e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4212  transcriptional regulator PhoU  31.79 
 
 		 242 aa  104  9e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4003  transcriptional regulator PhoU  32.31 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3453  phosphate uptake regulator, PhoU  34.56 
 
 		 216 aa  103  3e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0109346  normal  0.62241 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4001  phosphate uptake regulator, PhoU  36.04 
 
 		 227 aa  102  3e-21  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0571  phosphate uptake regulator, PhoU  30.66 
 
 		 217 aa  102  4e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000468215  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0700  phosphate uptake regulator, PhoU  32.37 
 
 		 219 aa  102  4e-21  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.977876 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3161  phosphate uptake regulator, PhoU  32.35 
 
 		 224 aa  102  4e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.997477  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01034  transcriptional regulator PhoU  34.85 
 
 		 232 aa  102  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4919  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 		 239 aa  102  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.214462 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4141  transcriptional regulator PhoU  31.34 
 
 		 241 aa  102  5e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2105  phosphate uptake regulator, PhoU  30.14 
 
 		 221 aa  102  6e-21  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4241  transcriptional regulator PhoU  31.34 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.468604  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4062  transcriptional regulator PhoU  31.34 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4184  transcriptional regulator PhoU  31.34 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.727294  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4134  transcriptional regulator PhoU  31.34 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.116669  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4078  transcriptional regulator PhoU  31.34 
 
 		 241 aa  101  7e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4267  transcriptional regulator PhoU  30.73 
 
 		 243 aa  101  7e-21  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7424  phosphate uptake regulator, PhoU  32.54 
 
 		 239 aa  101  7e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4588  transcriptional regulator PhoU  30.73 
 
 		 243 aa  101  9e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5184  phosphate uptake regulator, PhoU  31.73 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.841473 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1671  phosphate uptake regulator, PhoU  27.88 
 
 		 217 aa  100  1e-20  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000164191  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1482  phosphate uptake regulator, PhoU  29.29 
 
 		 225 aa  100  1e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.12558  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4717  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.73 
 
 		 237 aa  100  1e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.286694 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5262  phosphate uptake regulator, PhoU  34.21 
 
 		 238 aa  100  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004377  phosphate transport system regulatory protein PhoU  33.67 
 
 		 232 aa  100  2e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.174299  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5256  phosphate uptake regulator, PhoU  31.25 
 
 		 237 aa  100  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0641266  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0983  phosphate uptake regulator, PhoU  29.21 
 
 		 216 aa  99.4  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.073439 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1990  phosphate uptake regulator, PhoU  32.63 
 
 		 238 aa  99.4  3e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0261  transcriptional regulator PhoU  32.84 
 
 		 236 aa  99.8  3e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.303362  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0639  phosphate uptake regulator, PhoU  35.6 
 
 		 238 aa  99.4  3e-20  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0482  phosphate uptake regulator, PhoU  34.15 
 
 		 227 aa  99.8  3e-20  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.102781  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1238  phosphate uptake regulator, PhoU  29.67 
 
 		 219 aa  99.4  4e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.17919  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1991  phosphate uptake regulator, PhoU  32.23 
 
 		 217 aa  99.4  4e-20  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4193  transcriptional regulator PhoU  30.24 
 
 		 240 aa  99  4e-20  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.149526  hitchhiker  0.00684322 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0016  transcriptional regulator PhoU  30.24 
 
 		 244 aa  99.4  4e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.417309  normal  0.132936 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4167  transcriptional regulator PhoU  30.24 
 
 		 240 aa  99  4e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03608  negative regulator of PhoR/PhoB two-component regulator  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4243  phosphate uptake regulator, PhoU  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4088  transcriptional regulator PhoU  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4204  transcriptional regulator PhoU  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03552  hypothetical protein  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0780  phosphate uptake regulator, PhoU  32.63 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.287945 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5153  transcriptional regulator PhoU  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.543817 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4235  transcriptional regulator PhoU  30.24 
 
 		 238 aa  99  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3939  transcriptional regulator PhoU  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4235  transcriptional regulator PhoU  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4270  transcriptional regulator PhoU  30.35 
 
 		 241 aa  99  5e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR2142  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.85 
 
 		 240 aa  98.2  7e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2057  phosphate transport system regulatory protein PhoU  29.85 
 
 		 240 aa  98.2  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.187102  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2340  phosphate uptake regulator, PhoU  34.45 
 
 		 239 aa  98.2  8e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.521848  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2889  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.114573 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2904  phosphate uptake regulator, PhoU  33.33 
 
 		 218 aa  98.2  8e-20  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.18358  normal  0.0218976 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0892  phosphate uptake regulator, PhoU  34.86 
 
 		 238 aa  98.2  9e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3639  transcriptional regulator PhoU  33.16 
 
 		 233 aa  97.4  1e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.910146  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2950  phosphate uptake regulator, PhoU  37.13 
 
 		 239 aa  97.8  1e-19  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1678  phosphate uptake regulator, PhoU  30.5 
 
 		 219 aa  97.4  1e-19  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  decreased coverage  0.00615654  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0767  phosphate uptake regulator, PhoU  29.52 
 
 		 240 aa  96.7  2e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0148031  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0748  phosphate uptake regulator, PhoU  33.01 
 
 		 216 aa  96.7  2e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00678381  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0822  phosphate uptake regulator, PhoU  32.04 
 
 		 240 aa  96.7  3e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.591011  hitchhiker  0.00503775 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1042  phosphate uptake regulator, PhoU  34.11 
 
 		 228 aa  96.3  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00000260045  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3165  transcriptional regulator PhoU  34.16 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1504  transcriptional regulator PhoU  34 
 
 		 236 aa  95.9  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.682781  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0510  hypothetical protein  32.84 
 
 		 238 aa  95.5  5e-19  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.487232 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1486  phosphate transport system regulatory protein PhoU  30.48 
 
 		 224 aa  94  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.130643  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2830  phosphate uptake regulator, PhoU  28.43 
 
 		 220 aa  94  1e-18  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0602  phosphate uptake regulator, PhoU  30.93 
 
 		 243 aa  93.6  2e-18  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.226674  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1632  phosphate uptake regulator, PhoU  33.5 
 
 		 229 aa  94  2e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.6883  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1080  phosphate uptake regulator, PhoU  29.13 
 
 		 219 aa  92.8  3e-18  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0158991  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6686  phosphate uptake regulator, PhoU  31.1 
 
 		 240 aa  93.2  3e-18  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0844932  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2870  phosphate uptake regulator, PhoU  30.35 
 
 		 220 aa  92.8  3e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.905503  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1616  phosphate uptake regulator, PhoU  30.43 
 
 		 228 aa  92.8  3e-18  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.46313  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1411  transcriptional regulator PhoU  31.53 
 
 		 236 aa  92.8  3e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.816456  normal  0.0228624 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2395  phosphate transporter PhoU  32.99 
 
 		 237 aa  92.4  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3566  phosphate uptake regulator, PhoU  31.82 
 
 		 229 aa  92.4  5e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1241  hypothetical protein  31.09 
 
 		 228 aa  92  5e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.375245  normal  0.531566 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2769  phosphate transport system regulatory protein PhoU  32.31 
 
 		 234 aa  92  5e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.338608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1360  transcriptional regulator PhoU  31.84 
 
 		 231 aa  92  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.465651  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0784  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.79 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.701508  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1489  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.79 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1622  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.79 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0573  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.79 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.219505  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0578  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.79 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.141913  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1295  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.79 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.617631  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1519  phosphate transport system regulatory protein PhoU  31.79 
 
 		 234 aa  92  6e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2742  transcriptional regulator PhoU  34 
 
 		 236 aa  91.7  7e-18  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.498773  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1193  phosphate uptake regulator, PhoU  31.98 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.132592  normal  0.461227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0115  phosphate uptake regulator, PhoU  31.43 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1181  phosphate uptake regulator, PhoU  31.98 
 
 		 234 aa  91.7  7e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.449533  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2581  transcriptional regulator PhoU  31.03 
 
 		 236 aa  91.7  8e-18  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2506  phosphate uptake regulator, PhoU  28.36 
 
 		 223 aa  90.9  1e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>