More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_0392 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_0392  polyprenyl synthetase  100 
 
 		 317 aa  626  1e-178  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0885433 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0139  polyprenyl synthetase  71.7 
 
 		 330 aa  405  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0899  Polyprenyl synthetase  46.33 
 
 		 361 aa  188  1e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0021773  hitchhiker  0.000000547465 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2323  polyprenyl synthetase  42.91 
 
 		 349 aa  180  2.9999999999999997e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.199034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1698  polyprenyl synthetase  42.11 
 
 		 349 aa  179  4.999999999999999e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2345  polyprenyl synthetase  41.01 
 
 		 326 aa  177  1e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.000000529379  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3069  Polyprenyl synthetase  39.48 
 
 		 305 aa  132  6e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.197227  unclonable  0.0000000203915 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3477  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.87 
 
 		 322 aa  131  2.0000000000000002e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00654823 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3415  Polyprenyl synthetase  29.55 
 
 		 322 aa  130  3e-29  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00212563  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0470  heptaprenyl diphosphate synthase component II  31.34 
 
 		 320 aa  129  8.000000000000001e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0672  polyprenyl synthetase  25.93 
 
 		 322 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.188154  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0487  trans-hexaprenyltranstransferase  31.21 
 
 		 335 aa  128  1.0000000000000001e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0552  polyprenyl synthetase  32.15 
 
 		 338 aa  125  9e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0863635 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3448  polyprenyl synthetase  30.25 
 
 		 341 aa  125  1e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.142936 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1350  trans-hexaprenyltranstransferase  34.02 
 
 		 318 aa  124  2e-27  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2277  Polyprenyl synthetase  28.03 
 
 		 322 aa  122  6e-27  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2166  trans-hexaprenyltranstransferase  26.45 
 
 		 320 aa  122  8e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3743  polyprenyl synthetase  29.22 
 
 		 322 aa  122  9e-27  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0534  trans-hexaprenyltranstransferase  32.42 
 
 		 334 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2031  trans-hexaprenyltranstransferase  31.95 
 
 		 333 aa  120  1.9999999999999998e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.613063  normal  0.207674 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1651  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.82 
 
 		 322 aa  120  3e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00299697  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2681  trans-hexaprenyltranstransferase  32.91 
 
 		 334 aa  120  3.9999999999999996e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1267  farnesyltranstransferase  31.66 
 
 		 327 aa  120  3.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000414362  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2830  trans-hexaprenyltranstransferase  28.43 
 
 		 333 aa  119  4.9999999999999996e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000000446804  normal  0.601872 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1248  Trans-hexaprenyltranstransferase  26.35 
 
 		 323 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3230  polyprenyl synthetase  31.27 
 
 		 327 aa  119  4.9999999999999996e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00305524  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6080  polyprenyl synthetase  31.53 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.176249 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1252  trans-hexaprenyltranstransferase  30.55 
 
 		 322 aa  119  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.192713 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1432  polyprenyl synthetase  31.21 
 
 		 344 aa  118  9.999999999999999e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2149  heptaprenyl diphosphate synthase component II  26.95 
 
 		 320 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000900813  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1527  polyprenyl synthetase  24.92 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.261183  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2362  trans-hexaprenyltranstransferase  30.49 
 
 		 323 aa  118  9.999999999999999e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1557  polyprenyl synthetase  24.92 
 
 		 319 aa  118  9.999999999999999e-26  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3742  farnesyltranstransferase  32 
 
 		 336 aa  118  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.326793  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0514  trans-hexaprenyltranstransferase  27.71 
 
 		 337 aa  118  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.655757 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4219  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.45 
 
 		 345 aa  118  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.830845  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0840  dimethylallyltranstransferase  32.79 
 
 		 327 aa  118  1.9999999999999998e-25  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.440008 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5067  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.65 
 
 		 334 aa  117  3e-25  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0949639  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2455  polyprenyl synthetase  29.3 
 
 		 322 aa  117  3.9999999999999997e-25  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000180398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0854  farnesyltranstransferase  28.53 
 
 		 322 aa  116  5e-25  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5946  Trans-hexaprenyltranstransferase  28.89 
 
 		 322 aa  116  6e-25  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.112624  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0564  trans-hexaprenyltranstransferase  26.8 
 
 		 318 aa  115  6.9999999999999995e-25  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0409  Polyprenyl synthetase  29.44 
 
 		 317 aa  115  7.999999999999999e-25  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  unclonable  0.0000000000000164225  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03300  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  32.15 
 
 		 337 aa  115  1.0000000000000001e-24  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3361  octaprenyl diphosphate synthase  28.29 
 
 		 323 aa  115  1.0000000000000001e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  unclonable  0.000000777945  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4051  polyprenyl synthetase  29.87 
 
 		 356 aa  114  2.0000000000000002e-24  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0769  Polyprenyl synthetase  28.1 
 
 		 327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1317  octaprenyl-diphosphate synthase  32.32 
 
 		 322 aa  114  3e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1007  phage tail region protein  30.37 
 
 		 320 aa  114  3e-24  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000193077  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2996  octaprenyl-diphosphate synthase  29.18 
 
 		 340 aa  113  5e-24  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0868  trans-hexaprenyltranstransferase  25.99 
 
 		 323 aa  113  5e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.0000000612724  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1365  Polyprenyl synthetase  30.74 
 
 		 322 aa  113  5e-24  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2470  polyprenyl synthetase  33.19 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.870364  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6668  Polyprenyl synthetase  30.09 
 
 		 333 aa  112  6e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3361  Polyprenyl synthetase  32.39 
 
 		 322 aa  112  7.000000000000001e-24  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00532412  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0360  octaprenyl-diphosphate synthase  26.8 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00089716  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5487  polyprenyl synthetase  31.75 
 
 		 359 aa  112  8.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.057481  normal  0.26211 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2406  trans-hexaprenyltranstransferase  33.33 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.463272  normal  0.792362 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0750  geranylgeranyl pyrophosphate synthase/polyprenyl synthetase  33.33 
 
 		 333 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7677  Polyprenyl synthetase  33.09 
 
 		 351 aa  112  1.0000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3090  trans-hexaprenyltranstransferase  27.12 
 
 		 323 aa  112  1.0000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_40810  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.13 
 
 		 322 aa  111  1.0000000000000001e-23  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.368005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4239  polyprenyl synthetase  26.3 
 
 		 326 aa  111  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  unclonable  0.0000000759134  hitchhiker  0.000000348565 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0863  trans-hexaprenyltranstransferase  28.95 
 
 		 343 aa  110  3e-23  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0603068  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4544  Trans-hexaprenyltranstransferase  31.54 
 
 		 352 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3278  polyprenyl synthetase  28.43 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000293097 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07520  geranylgeranyl pyrophosphate synthase  30.28 
 
 		 337 aa  110  4.0000000000000004e-23  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.0633826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0598  Trans-hexaprenyltranstransferase  29.57 
 
 		 331 aa  110  4.0000000000000004e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0968  polyprenyl synthetase  29.57 
 
 		 313 aa  110  4.0000000000000004e-23  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14830  heptaprenyl diphosphate synthase component II  30.74 
 
 		 326 aa  109  5e-23  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0473  trans-hexaprenyltranstransferase  29.6 
 
 		 337 aa  109  5e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.521014  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3072  octaprenyl-diphosphate synthase  33.84 
 
 		 334 aa  110  5e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.436808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2852  octaprenyl-diphosphate synthase  27.92 
 
 		 348 aa  109  6e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000355591  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0833  trans-hexaprenyltranstransferase  30.16 
 
 		 322 aa  108  8.000000000000001e-23  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0054  Polyprenyl synthetase  30.35 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  hitchhiker  0.00942137  normal  0.0473484 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1983  octaprenyl diphosphate synthase  28.66 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.977315  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1068  polyprenyl synthetase  27.12 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.00000253104  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0966  polyprenyl synthetase  27.12 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000309131  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1035  polyprenyl synthetase  27.12 
 
 		 331 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000587704  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1038  polyprenyl synthetase  25.56 
 
 		 319 aa  107  2e-22  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3324  Polyprenyl synthetase  27.12 
 
 		 331 aa  108  2e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000403675  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06831  polyprenyl synthetase; solanesyl diphosphate synthase (sds)  26.73 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1353  farnesyltranstransferase  29.45 
 
 		 337 aa  107  2e-22  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.350614  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3205  octaprenyl-diphosphate synthase  29.55 
 
 		 322 aa  107  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.192377  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0792  octaprenyl diphosphate synthase  27.63 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  unclonable  0.00000411512  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3481  octaprenyl diphosphate synthase  27.06 
 
 		 323 aa  107  2e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.0000172444  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3676  trans-hexaprenyltranstransferase  30.74 
 
 		 344 aa  107  3e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0766  trans-hexaprenyltranstransferase  34.31 
 
 		 325 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0312  polyprenyl synthetase  26.1 
 
 		 326 aa  107  3e-22  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.440979 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0771  trans-hexaprenyltranstransferase  34.31 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1526  Polyprenyl synthetase  23.3 
 
 		 318 aa  107  3e-22  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.52823  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2702  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.25 
 
 		 335 aa  107  3e-22  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0785  trans-hexaprenyltranstransferase  34.31 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.856198  normal  0.673254 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2517  Polyprenyl synthetase  30.99 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2899  octaprenyl-diphosphate synthase  30.99 
 
 		 322 aa  106  4e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3032  trans-hexaprenyltranstransferase  26.27 
 
 		 345 aa  106  5e-22  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1438  heptaprenyl diphosphate synthase component II  28.06 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1262  Trans-hexaprenyltranstransferase  30.83 
 
 		 320 aa  106  5e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4513  octaprenyl-diphosphate synthase  26.06 
 
 		 327 aa  106  6e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1849  trans-hexaprenyltranstransferase  29.29 
 
 		 323 aa  106  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>