More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSp1578 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RSp1578  agmatinase  100 
 
 		 318 aa  637    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1957  arginase family protein  65.5 
 
 		 337 aa  429  1e-119  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.430995  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1883  arginase family protein  64.86 
 
 		 337 aa  423  1e-117  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.410037  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1151  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  62.42 
 
 		 329 aa  414  1e-114  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.654271 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4509  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  57.01 
 
 		 323 aa  368  1e-101  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.246382  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1954  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.48 
 
 		 303 aa  230  2e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.17819  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2237  agmatinase  42.71 
 
 		 303 aa  231  2e-59  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.972034  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1777  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  44.48 
 
 		 303 aa  229  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.294858  normal  0.0243796 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3103  agmatinase  39.87 
 
 		 323 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0277  agmatinase  35.69 
 
 		 322 aa  167  2e-40  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.17372 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1098  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.53 
 
 		 305 aa  163  3e-39  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.680676  normal  0.149634 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2732  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  35.27 
 
 		 311 aa  161  1e-38  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.167247  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2290  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  34.32 
 
 		 312 aa  162  1e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1047  agmatinase  36.82 
 
 		 315 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0714  agmatinase  35.59 
 
 		 315 aa  136  4e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.147281  normal  0.0373612 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2907  agmatinase  33.54 
 
 		 317 aa  128  1.0000000000000001e-28  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2148  agmatinase  37.66 
 
 		 319 aa  122  8e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.329382  normal  0.820272 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1421  agmatinase  30.94 
 
 		 297 aa  120  1.9999999999999998e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0939  agmatinase  32.58 
 
 		 315 aa  117  3e-25  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.220122 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46070  guanidinobutyrase  36.76 
 
 		 319 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.781131 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3918  guanidinobutyrase  36.76 
 
 		 319 aa  115  7.999999999999999e-25  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3438  agmatinase  34.91 
 
 		 342 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.878224 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1723  arginase/agmatinase/formiminoglutamase  33.33 
 
 		 271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4523  agmatinase, putative  36.23 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4029  agmatinase  36.23 
 
 		 320 aa  113  3e-24  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.192086  normal  0.0901062 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1388  putative agmatinase  36.23 
 
 		 320 aa  113  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.584775  normal  0.7008 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1797  putative agmatinase  36.27 
 
 		 319 aa  113  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.57797 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3815  agmatinase  36.23 
 
 		 316 aa  113  5e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0376134 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1041  agmatinase  34.91 
 
 		 329 aa  112  6e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.287575  normal  0.4882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2787  agmatinase  33.33 
 
 		 316 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4984  agmatinase  34.98 
 
 		 318 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03770  agmatinase  35.92 
 
 		 318 aa  112  8.000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0898474 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2764  agmatinase  29.94 
 
 		 345 aa  112  9e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.255476  normal  0.814002 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2513  putative agmatinase  32.9 
 
 		 290 aa  112  9e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2757  agmatinase  31.83 
 
 		 324 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2734  agmatinase  30.46 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0638  agmatinase  31.74 
 
 		 330 aa  111  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1877  Guanidinobutyrase  31.36 
 
 		 320 aa  112  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3382  agmatinase  33.44 
 
 		 321 aa  112  1.0000000000000001e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.143421  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2778  agmatinase  30.46 
 
 		 345 aa  112  1.0000000000000001e-23  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.470269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5173  agmatinase  34.57 
 
 		 318 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.144545 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0784  agmatinase, putative  34.2 
 
 		 317 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3083  agmatinase, putative  34.98 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5284  putative agmatinase  34.98 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.190576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3436  agmatinase  34.57 
 
 		 318 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0274667  normal  0.631052 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0379  agmatinase  35.44 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0366  agmatinase  34.16 
 
 		 318 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4346  Agmatinase  34.06 
 
 		 478 aa  110  3e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.534674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0334  putative agmatinase  36.8 
 
 		 306 aa  110  3e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2243  agmatinase  30.56 
 
 		 317 aa  109  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1457  agmatinase  34.8 
 
 		 316 aa  109  5e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.284678  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2635  putative agmatinase  33.33 
 
 		 315 aa  109  8.000000000000001e-23  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1996  agmatinase  30.56 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.363507  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1597  agmatinase  30.56 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6083  agmatinase  32.05 
 
 		 316 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.998258  normal  0.214815 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0674  agmatinase  30.56 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0226036  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2157  agmatinase  30.56 
 
 		 317 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0207  agmatinase  31.02 
 
 		 290 aa  108  1e-22  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.973687  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1550  agmatinase, putative  35.68 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.793749  normal  0.912006 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2118  agmatinase  30.31 
 
 		 263 aa  108  1e-22  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.563014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8153  agmatinase  30.8 
 
 		 327 aa  108  1e-22  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4644  putative agmatinase  34.16 
 
 		 329 aa  108  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2241  agmatinase  32.76 
 
 		 315 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.014845  normal  0.374196 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3303  putative agmatinase  31.03 
 
 		 340 aa  108  1e-22  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.345323  normal  0.151363 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0639  agmatinase, putative  30.25 
 
 		 317 aa  107  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.19588  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5199  agmatinase  32.48 
 
 		 316 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4872  agmatinase  30.49 
 
 		 351 aa  107  3e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.739258  normal  0.617113 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0178  agmatinase  29.79 
 
 		 285 aa  106  4e-22  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000300631  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1621  agmatinase  28.94 
 
 		 307 aa  106  5e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.644078  normal  0.0544255 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2295  agmatinase  30.72 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.902426 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2256  agmatinase  30.72 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2303  agmatinase  30.72 
 
 		 319 aa  106  6e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.433444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2108  putative agmatinase  32.91 
 
 		 316 aa  105  8e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0426947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2838  agmatinase  33.33 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4700  agmatinase  35.38 
 
 		 318 aa  105  1e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0058  agmatinase  30.87 
 
 		 324 aa  104  2e-21  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.741294  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4275  agmatinase  34.93 
 
 		 321 aa  104  2e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.720547 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5725  agmatinase  31.91 
 
 		 346 aa  104  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.672273 
 
 
-
 
NC_006686  CND03500  arginase, putative  28.04 
 
 		 398 aa  103  3e-21  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1825  agmatinase  31.46 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.028899  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1872  agmatinase  31.46 
 
 		 365 aa  103  3e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.548708  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0543  agmatinase  30.74 
 
 		 305 aa  103  4e-21  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0990  Arginase/agmatinase/formiminoglutamase  30.72 
 
 		 336 aa  103  4e-21  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1082  agmatinase  26.56 
 
 		 396 aa  103  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.193569  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3240  agmatinase  30.74 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3324  agmatinase  30.74 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0546446  normal  0.86641 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3316  agmatinase  30.74 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3258  agmatinase  30.74 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.63142 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06738  agmatinase  28.87 
 
 		 306 aa  102  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0161  putative agmatinase  30.69 
 
 		 329 aa  102  7e-21  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0743  agmatinase  27.33 
 
 		 401 aa  102  8e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.618135  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4643  agmatinase  30 
 
 		 351 aa  102  9e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0273  agmatinase  33.33 
 
 		 317 aa  101  1e-20  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1824  agmatinase  26.42 
 
 		 282 aa  102  1e-20  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000829  agmatinase  28.52 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000138178  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0285  agmatinase  32.53 
 
 		 356 aa  102  1e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0425  agmatinase  32.08 
 
 		 283 aa  101  1e-20  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.509578 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2769  putative agmatinase  31.95 
 
 		 304 aa  102  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.00220418  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5372  putative agmatinase  32.76 
 
 		 326 aa  102  1e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3420  agmatinase  30.74 
 
 		 306 aa  102  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0247827 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>