More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc2228 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc2228  putative carboxymethylenebutenolidase (dienelactone hydrolase) protein  100 
 
 		 293 aa  597  1e-170  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  81.38 
 
 		 292 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  81.03 
 
 		 292 aa  498  1e-140  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  71.03 
 
 		 291 aa  434  1e-121  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  71.97 
 
 		 291 aa  415  9.999999999999999e-116  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0609  carboxymethylenebutenolidase  64.71 
 
 		 290 aa  385  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  63.92 
 
 		 290 aa  385  1e-106  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1506  carboxymethylenebutenolidase  62.98 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.893969  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4421  carboxymethylenebutenolidase  61.38 
 
 		 290 aa  381  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.842964  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0358  carboxymethylenebutenolidase  62.98 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2398  carboxymethylenebutenolidase  63.32 
 
 		 339 aa  384  1e-105  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2540  carboxymethylenebutenolidase  62.98 
 
 		 339 aa  382  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1700  carboxymethylenebutenolidase  62.98 
 
 		 291 aa  381  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0848  carboxymethylenebutenolidase  62.63 
 
 		 291 aa  380  1e-104  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4825  carboxymethylenebutenolidase  63.32 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00463404  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3245  carboxymethylenebutenolidase  62.98 
 
 		 291 aa  379  1e-104  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0210034 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3771  carboxymethylenebutenolidase  62.98 
 
 		 291 aa  378  1e-104  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0116114 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6786  Carboxymethylenebutenolidase  62.89 
 
 		 294 aa  379  1e-104  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00592953  hitchhiker  0.00000947309 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3653  carboxymethylenebutenolidase  61.94 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.19765  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4491  twin-arginine translocation pathway signal  61.94 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3874  carboxymethylenebutenolidase  61.94 
 
 		 291 aa  374  1e-103  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.630972  normal  0.609004 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3586  carboxymethylenebutenolidase  64.69 
 
 		 295 aa  363  1e-99  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3005  carboxymethylenebutenolidase  61.38 
 
 		 290 aa  358  6e-98  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0541366  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2216  dienelactone hydrolase  61.59 
 
 		 291 aa  357  9.999999999999999e-98  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.60917  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1943  carboxymethylenebutenolidase  60.54 
 
 		 302 aa  355  5.999999999999999e-97  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0524201  normal  0.0241824 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1548  Carboxymethylenebutenolidase  59.73 
 
 		 299 aa  343  2e-93  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0324  carboxymethylenebutenolidase  62.35 
 
 		 256 aa  341  7e-93  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3316  carboxymethylenebutenolidase  59.53 
 
 		 297 aa  338  5e-92  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0813595  normal  0.0640539 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2668  Carboxymethylenebutenolidase  59.53 
 
 		 297 aa  338  5e-92  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.240942  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0181  twin-arginine translocation pathway signal  58.13 
 
 		 291 aa  335  5.999999999999999e-91  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.972702  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5324  carboxymethylenebutenolidase  58.22 
 
 		 298 aa  328  5.0000000000000004e-89  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  54.58 
 
 		 291 aa  324  1e-87  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  53.9 
 
 		 291 aa  322  5e-87  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1710  carboxymethylenebutenolidase  58.66 
 
 		 291 aa  319  3e-86  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  53.22 
 
 		 291 aa  318  9e-86  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  54.45 
 
 		 278 aa  315  4e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1733  carboxymethylenebutenolidase  55.25 
 
 		 307 aa  313  2.9999999999999996e-84  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.353507 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  54.87 
 
 		 280 aa  311  5.999999999999999e-84  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  52.54 
 
 		 291 aa  311  7.999999999999999e-84  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  53.56 
 
 		 291 aa  308  5e-83  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0969  carboxymethylenebutenolidase  54.32 
 
 		 275 aa  304  1.0000000000000001e-81  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.35084  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  55.3 
 
 		 275 aa  299  4e-80  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0774  Carboxymethylenebutenolidase  53.93 
 
 		 300 aa  297  2e-79  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.12147  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3963  carboxymethylenebutenolidase  53.41 
 
 		 268 aa  297  2e-79  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.141261 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  54.72 
 
 		 275 aa  295  5e-79  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  54.44 
 
 		 290 aa  291  6e-78  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  54.07 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  53.99 
 
 		 278 aa  290  2e-77  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  54.07 
 
 		 290 aa  290  2e-77  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4070  Carboxymethylenebutenolidase  52.61 
 
 		 275 aa  289  3e-77  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  51.48 
 
 		 271 aa  287  2e-76  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4353  Carboxymethylenebutenolidase  52.43 
 
 		 275 aa  287  2e-76  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  51.48 
 
 		 271 aa  287  2e-76  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  51.48 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  51.48 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  51.48 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  51.48 
 
 		 291 aa  286  2.9999999999999996e-76  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  51.85 
 
 		 271 aa  286  2.9999999999999996e-76  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  51.29 
 
 		 269 aa  285  8e-76  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  51.11 
 
 		 271 aa  284  1.0000000000000001e-75  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  50.92 
 
 		 269 aa  284  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  50.92 
 
 		 267 aa  283  2.0000000000000002e-75  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  51.11 
 
 		 271 aa  283  3.0000000000000004e-75  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4302  dienelactone hydrolase family protein  50 
 
 		 270 aa  278  1e-73  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2733  carboxymethylenebutenolidase  50.18 
 
 		 290 aa  265  7e-70  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.193118 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4626  Carboxymethylenebutenolidase  44.16 
 
 		 277 aa  254  2.0000000000000002e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000529247 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5221  putative carboxymethylenebutenolidase precursor (dienelactone hydrolase  49.25 
 
 		 270 aa  249  5e-65  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0554108  normal  0.200336 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0943  Carboxymethylenebutenolidase  44.29 
 
 		 287 aa  228  1e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00110752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0949  Carboxymethylenebutenolidase  36.73 
 
 		 261 aa  141  9.999999999999999e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00366545  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4136  carboxymethylenebutenolidase  35.47 
 
 		 324 aa  127  2.0000000000000002e-28  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0536  carboxymethylenebutenolidase  35.39 
 
 		 239 aa  126  5e-28  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.192606 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4152  dienelactone hydrolase  31.75 
 
 		 251 aa  122  5e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00000773807  normal  0.203435 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1212  Carboxymethylenebutenolidase  33.47 
 
 		 248 aa  120  3e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2806  dienelactone hydrolase family protein  33.22 
 
 		 295 aa  116  5e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.614525  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3405  Carboxymethylenebutenolidase  32.39 
 
 		 246 aa  115  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2787  carboxymethylenebutenolidase  33.74 
 
 		 254 aa  114  3e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2534  carboxymethylenebutenolidase  32.87 
 
 		 295 aa  112  6e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.178351  normal  0.530004 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3409  carboxymethylenebutenolidase  34.19 
 
 		 295 aa  112  1.0000000000000001e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0424  Carboxymethylenebutenolidase  35 
 
 		 313 aa  111  1.0000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0290099 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1491  carboxymethylenebutenolidase  27.97 
 
 		 261 aa  110  2.0000000000000002e-23  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0546343  normal  0.398934 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6635  Carboxymethylenebutenolidase  33.57 
 
 		 295 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.235988 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1445  carboxymethylenebutenolidase  34.02 
 
 		 246 aa  110  4.0000000000000004e-23  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.80402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3733  dienelactone hydrolase  31.69 
 
 		 248 aa  109  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000974999  normal  0.292104 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3327  carboxymethylenebutenolidase  31.82 
 
 		 295 aa  109  5e-23  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2055  dienelactone hydrolase  30.29 
 
 		 251 aa  108  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.731615  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02875  predicted hydrolase  31.54 
 
 		 254 aa  106  5e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3354  Carboxymethylenebutenolidase  30.31 
 
 		 295 aa  106  5e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.000150508  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0431  dienelactone hydrolase  29.88 
 
 		 247 aa  105  6e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.850934 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3286  dienelactone hydrolase family protein  32.77 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4312  dienelactone hydrolase family protein  32.77 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3469  dienelactone hydrolase family protein  32.77 
 
 		 295 aa  105  1e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1423  carboxymethylenebutenolidase  32.6 
 
 		 250 aa  105  1e-21  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.307098  normal  0.828639 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3130  Carboxymethylenebutenolidase  31.51 
 
 		 296 aa  104  2e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0420  Carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 		 247 aa  104  2e-21  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6096  carboxymethylenebutenolidase  33.88 
 
 		 238 aa  103  3e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.0559809 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1987  twin-arginine translocation pathway signal  29.27 
 
 		 291 aa  102  6e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4562  Carboxymethylenebutenolidase  34.91 
 
 		 297 aa  102  7e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.546274  normal  0.125824 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1487  Carboxymethylenebutenolidase  36.2 
 
 		 295 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.108387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0089  carboxymethylenebutenolidase  30.83 
 
 		 244 aa  100  3e-20  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4930  Carboxymethylenebutenolidase  33.05 
 
 		 227 aa  100  3e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0665407  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>