More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_1866 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_1866  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 151 aa  297  3e-80  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0515  AsnC family transcriptional regulator  99.34 
 
 		 151 aa  296  5e-80  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.900323  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0652  AsnC family transcriptional regulator  94.7 
 
 		 151 aa  286  1e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.22955 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1759  AsnC family transcriptional regulator  66.23 
 
 		 151 aa  203  7e-52  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0120773  normal  0.159255 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1239  AsnC family transcriptional regulator  62.91 
 
 		 151 aa  192  2e-48  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.677106 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2302  AsnC family transcriptional regulator  64.9 
 
 		 151 aa  187  4e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2395  transcriptional regulator  66 
 
 		 152 aa  183  7e-46  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3259  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0640404  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5248  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  100  9e-21  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.58536  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38300  putative transcriptional regulator  31.33 
 
 		 157 aa  100  9e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0128903 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4299  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 155 aa  99.8  1e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5095  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 156 aa  99.4  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5188  transcriptional regulator BkdR, putative  30.67 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.354058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0928  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 158 aa  98.6  2e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0275  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 156 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5422  AsnC family transcriptional regulator  28.67 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.439003  normal  0.0250136 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1867  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 152 aa  95.5  2e-19  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1974  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  95.9  2e-19  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.739408  normal  0.486405 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0516  AsnC family transcriptional regulator  38.13 
 
 		 152 aa  94.7  4e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.904906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0653  AsnC family transcriptional regulator  38.85 
 
 		 152 aa  94  7e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.594431  normal  0.222983 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6537  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  93.2  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.201415 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0783  AsnC family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 150 aa  93.2  1e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.514102  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3156  transcriptional regulator, AsnC family  34.67 
 
 		 155 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  unclonable  0.000000033258  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0251  regulatory proteins, AsnC/Lrp  30 
 
 		 156 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3022  regulatory proteins, AsnC/Lrp  34 
 
 		 155 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  unclonable  0.00000000242064  normal  0.0404205 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0321  transcriptional regulator, AsnC family  29.33 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1485  AsnC family transcriptional regulator  31.54 
 
 		 159 aa  91.3  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.457516  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2413  AsnC family transcriptional regulator  33.55 
 
 		 159 aa  90.5  6e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.17098 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1569  AsnC family transcriptional regulator  36.3 
 
 		 172 aa  90.5  7e-18  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.194361  normal  0.155211 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0819  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 180 aa  89.7  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1240  AsnC family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 151 aa  89.7  1e-17  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.659935 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1325  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1319  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0270  AsnC family transcriptional regulator  36.67 
 
 		 155 aa  89  2e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.784596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0841  AsnC family transcriptional regulator  35.33 
 
 		 167 aa  89.4  2e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2510  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.161372  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0301  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0951908  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0576  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1253  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0991  AsnC family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 160 aa  88.6  2e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1351  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 155 aa  88.6  3e-17  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.986607  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1676  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 156 aa  87.8  4e-17  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0583665  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5614  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 162 aa  87.8  4e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.41474  normal  0.0388981 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4647  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 158 aa  87.8  5e-17  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0216  AsnC family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 164 aa  87.8  5e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.496692  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1620  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 168 aa  87.8  5e-17  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.120011  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1758  AsnC family transcriptional regulator  35.25 
 
 		 153 aa  86.7  1e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  hitchhiker  0.00375085  normal  0.163096 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3648  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1263  AsnC family transcriptional regulator  31.79 
 
 		 156 aa  86.3  1e-16  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.106245  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3081  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3042  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0915  AsnC family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 152 aa  85.5  2e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.72349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1869  AsnC family transcriptional regulator  34 
 
 		 156 aa  85.9  2e-16  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3223  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3254  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 		 153 aa  85.9  2e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0263827  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1057  transcriptional regulator, AsnC family  35.06 
 
 		 153 aa  85.5  2e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0985  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 157 aa  85.9  2e-16  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.228113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1752  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.531408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2859  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 155 aa  85.1  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.368271 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2394  transcriptional regulator  34.97 
 
 		 152 aa  84.7  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2198  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 160 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4141  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.845485  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2001  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 156 aa  84.7  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.295064  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3375  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4793  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 166 aa  84.7  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1520  AsnC family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 161 aa  84.7  4e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.186133 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4009  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3359  transcriptional regulator, AsnC family  33.33 
 
 		 168 aa  84.3  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3226  transcriptional regulator, AsnC family  31.33 
 
 		 171 aa  84  7e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2266  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  84  7e-16  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.400993  normal  0.321257 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0870  AsnC family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 169 aa  84  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.592101  normal  0.410533 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1963  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 160 aa  83.2  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0213  AsnC family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 153 aa  82.8  0.000000000000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.757841 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1694  transcriptional regulator, AsnC family  32.67 
 
 		 156 aa  83.2  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.849273  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3060  transcriptional regulator, AsnC family  30.46 
 
 		 153 aa  83.2  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2025  AsnC family transcriptional regulator  29.14 
 
 		 157 aa  83.6  0.000000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.742298  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2877  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 159 aa  83.2  0.000000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.49085  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3655  AsnC family transcriptional regulator  31.51 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.182716 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6107  AsnC family transcriptional regulator  30.46 
 
 		 154 aa  82.8  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.352577  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0736  AsnC family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 171 aa  83.6  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2996  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 156 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0252668  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3162  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1307  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4264  AsnC family transcriptional regulator  30 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.898523  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0370  transcriptional regulator, AsnC family  31.17 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0509  AsnC family transcriptional regulator  32 
 
 		 167 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0842444  normal  0.148048 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1610  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 158 aa  82.4  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0562  glutamate uptake regulatory protein  31.82 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.426244  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4417  AsnC family transcriptional regulator  32.68 
 
 		 159 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.60947 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3168  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.634105  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1447  transcriptional regulator, AsnC family  34.64 
 
 		 161 aa  82.8  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.190932  normal  0.829418 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0518  glutamate uptake regulatory protein  31.82 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1106  AsnC family transcriptional regulator  29.8 
 
 		 153 aa  82.4  0.000000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000218061 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0524  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0499  glutamate uptake regulatory protein  31.82 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0483  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0490  AsnC family transcriptional regulator  31.17 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.918354  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0502  glutamate uptake regulatory protein  31.82 
 
 		 152 aa  82.8  0.000000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2301  AsnC family transcriptional regulator  36.88 
 
 		 152 aa  82.4  0.000000000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0914  AsnC family transcriptional regulator  32.03 
 
 		 159 aa  82  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.222083  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>