55 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSP_0459 on replicon NC_007493
Organism: Rhodobacter sphaeroides 2.4.1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007493  RSP_0459  hypothetical protein  100 
 
 		 360 aa  723    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2112  hypothetical protein  99.44 
 
 		 360 aa  721    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2380  hypothetical protein  93.79 
 
 		 361 aa  632  1e-180  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.72362  normal  0.393268 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6115  hypothetical protein  76.72 
 
 		 353 aa  542  1e-153  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3632  hypothetical protein  74.21 
 
 		 363 aa  525  1e-148  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3332  hypothetical protein  73.26 
 
 		 363 aa  518  1e-146  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.643264  normal  0.318214 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0312  hypothetical protein  77.49 
 
 		 364 aa  520  1e-146  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4388  hypothetical protein  73.95 
 
 		 365 aa  514  1e-144  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1706  hypothetical protein  64.47 
 
 		 355 aa  450  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2194  hypothetical protein  65.12 
 
 		 348 aa  448  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0136744  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1465  hypothetical protein  63.77 
 
 		 353 aa  443  1e-123  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1419  hypothetical protein  65.29 
 
 		 319 aa  418  9.999999999999999e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0961  hypothetical protein  57.94 
 
 		 350 aa  403  1e-111  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.107414  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2044  hypothetical protein  55.14 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0244  hypothetical protein  53.04 
 
 		 348 aa  354  2e-96  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2476  hypothetical protein  49.71 
 
 		 339 aa  304  2.0000000000000002e-81  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5505  hypothetical protein  48.18 
 
 		 359 aa  295  8e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.324013  normal  1 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4653  hypothetical protein  47.19 
 
 		 359 aa  295  1e-78  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.219524  normal  0.625872 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1846  hypothetical protein  45.59 
 
 		 341 aa  293  3e-78  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1007  hypothetical protein  45.61 
 
 		 333 aa  290  3e-77  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0764  hypothetical protein  44.41 
 
 		 355 aa  274  2.0000000000000002e-72  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.599399  normal  0.114508 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3676  hypothetical protein  44.76 
 
 		 390 aa  273  3e-72  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.721107 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0770  hypothetical protein  44.6 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.68568 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1787  hypothetical protein  44.6 
 
 		 355 aa  271  2e-71  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.0307879 
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2516  hypothetical protein  43.18 
 
 		 354 aa  266  5.999999999999999e-70  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3310  hypothetical protein  43.87 
 
 		 380 aa  265  1e-69  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.584963  normal  0.17128 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0017  hypothetical protein  44.71 
 
 		 325 aa  261  2e-68  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0358  hypothetical protein  43.62 
 
 		 324 aa  260  3e-68  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0783627  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1056  hypothetical protein  45.57 
 
 		 422 aa  258  1e-67  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.969674 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02894  hypothetical protein  45.87 
 
 		 341 aa  254  2.0000000000000002e-66  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0534  hypothetical protein  44.38 
 
 		 345 aa  249  4e-65  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0740403  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0076  hypothetical protein  41.92 
 
 		 362 aa  249  6e-65  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000415937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0472  hypothetical protein  44.38 
 
 		 345 aa  248  8e-65  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3191  protein of unknown function DUF475  46.79 
 
 		 383 aa  248  1e-64  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0757781  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3015  hypothetical protein  42.02 
 
 		 379 aa  247  3e-64  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000000228142  decreased coverage  0.0000469398 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1193  hypothetical protein  45.86 
 
 		 339 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.622103  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4201  protein of unknown function DUF475  44.74 
 
 		 364 aa  242  6e-63  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0047  hypothetical protein  41.69 
 
 		 348 aa  240  2.9999999999999997e-62  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1294  hypothetical protein  44.92 
 
 		 355 aa  238  1e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4752  protein of unknown function DUF475  42.22 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_33950  hypothetical protein  40.15 
 
 		 419 aa  236  4e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.144001  normal  0.695383 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2489  protein of unknown function DUF475  41.82 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.384164  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13660  hypothetical protein  42.03 
 
 		 365 aa  220  3e-56  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00606112 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2208  hypothetical protein  35.17 
 
 		 356 aa  174  9.999999999999999e-43  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0346  hypothetical protein  33 
 
 		 309 aa  132  6.999999999999999e-30  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1043  hypothetical protein  32.32 
 
 		 294 aa  124  2e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.3637 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1629  hypothetical protein  33.56 
 
 		 307 aa  120  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.458622  normal  0.0210196 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1635  hypothetical protein  32.51 
 
 		 323 aa  112  8.000000000000001e-24  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2120  hypothetical protein  31.94 
 
 		 308 aa  110  5e-23  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1726  hypothetical protein  31.13 
 
 		 255 aa  51.2  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.185755  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1862  Integral membrane protein TerC  24.36 
 
 		 320 aa  49.7  0.00007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.201743  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2016  integral membrane protein TerC  26.05 
 
 		 320 aa  49.3  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1947  Integral membrane protein TerC  24.44 
 
 		 320 aa  47  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.204992  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1856  Integral membrane protein TerC  29.25 
 
 		 266 aa  42.7  0.008  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00332833  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1004  Integral membrane protein TerC  26.52 
 
 		 312 aa  42.7  0.01  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.144845  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>