197 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RS03059 on replicon NC_003296
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003296  RS03059  putative esterase protein  100 
 
 		 246 aa  498  1e-140  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.71029  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1962  alpha/beta hydrolase fold  71.54 
 
 		 246 aa  357  9.999999999999999e-98  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3124  alpha/beta hydrolase fold  46.61 
 
 		 247 aa  183  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0321729  normal  0.028375 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0524  Alpha/beta hydrolase  42.39 
 
 		 246 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0610982  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5050  alpha/beta hydrolase fold  41.18 
 
 		 243 aa  151  1e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5167  alpha/beta hydrolase fold  41.56 
 
 		 246 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0855179 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1914  alpha/beta fold family hydrolase  38.68 
 
 		 243 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3254  alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5114  alpha/beta hydrolase fold  40.24 
 
 		 246 aa  143  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0504  inner-membrane translocator  22.13 
 
 		 571 aa  63.9  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.92013  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1534  alpha/beta hydrolase fold protein  28.29 
 
 		 263 aa  60.1  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0444471 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2179  alpha/beta hydrolase fold protein  29.63 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000001  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0507  alpha/beta hydrolase fold  35.48 
 
 		 264 aa  54.7  0.000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1480  Alpha/beta hydrolase fold  23.16 
 
 		 304 aa  53.9  0.000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000000123975  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6811  salicylate esterase  30 
 
 		 247 aa  53.5  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.545917  hitchhiker  0.00506969 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0990  alpha/beta hydrolase fold  39.77 
 
 		 298 aa  53.5  0.000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04345  alpha/beta superfamily hydrolase  31.96 
 
 		 253 aa  53.1  0.000004  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.660124  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06730  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  37 
 
 		 343 aa  52.8  0.000006  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54655  predicted protein  23.42 
 
 		 293 aa  52.4  0.000007  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1201  hypothetical protein  30.69 
 
 		 257 aa  52.4  0.000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000612925  hitchhiker  0.000217368 
 
 
-
 
NC_003296  RS03173  hypothetical protein  28.73 
 
 		 272 aa  52.4  0.000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.188182 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2174  alpha/beta hydrolase fold protein  48.94 
 
 		 277 aa  52.4  0.000008  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.633996  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0831  alpha/beta hydrolase fold protein  40.82 
 
 		 344 aa  52  0.000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4976  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  24.6 
 
 		 304 aa  52  0.000008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.000041043  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4521  alpha/beta hydrolase fold  37.25 
 
 		 270 aa  52  0.000008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.78404  normal  1 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04046  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G03890)  38.18 
 
 		 491 aa  51.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.778204 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0351  putative hydrolase/acyltransferase  35.87 
 
 		 259 aa  51.6  0.00001  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1226  alpha/beta hydrolase fold protein  32.69 
 
 		 292 aa  51.6  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00330311  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3502  alpha/beta hydrolase fold protein  27.2 
 
 		 268 aa  51.6  0.00001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0503333  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3029  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_12070  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  36.54 
 
 		 276 aa  51.6  0.00001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3091  alpha/beta hydrolase fold protein  27.01 
 
 		 305 aa  51.6  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4489  hypothetical protein  29.59 
 
 		 231 aa  50.4  0.00002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1121  hypothetical protein  30 
 
 		 260 aa  51.2  0.00002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.848062  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3762  alpha/beta hydrolase fold  33.33 
 
 		 260 aa  50.8  0.00002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.543729  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_06565  Alpha/beta hydrolase  25.67 
 
 		 254 aa  50.8  0.00002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2510  alpha/beta hydrolase fold protein  35.05 
 
 		 267 aa  50.4  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.00182924  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  26.29 
 
 		 321 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004122  putative esterase/lipase ybfF  34.74 
 
 		 255 aa  50.1  0.00003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000112375  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0023  alpha/beta hydrolase fold  35.11 
 
 		 315 aa  50.4  0.00003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.00672386  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13190  lysophospholipase  29.69 
 
 		 262 aa  50.4  0.00003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0607698  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0821  alpha/beta hydrolase fold  25.91 
 
 		 252 aa  50.1  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1130  alpha/beta hydrolase fold protein  35.4 
 
 		 254 aa  50.4  0.00003  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.755121  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0495  alpha/beta hydrolase fold  36.36 
 
 		 327 aa  49.7  0.00004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1210  hypothetical protein  31.25 
 
 		 259 aa  49.7  0.00004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  unclonable  0.000115762  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1408  alpha/beta hydrolase fold protein  28.85 
 
 		 421 aa  49.7  0.00005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.259617 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1988  alpha/beta hydrolase superfamily protein  29.43 
 
 		 321 aa  49.3  0.00005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.150126 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2983  alpha/beta hydrolase fold protein  39.39 
 
 		 303 aa  49.7  0.00005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.283426 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2065  alpha/beta hydrolase fold protein  31.71 
 
 		 252 aa  49.7  0.00005  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0179548  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0708  hypothetical protein  26.26 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000135641  normal  0.38067 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0714  hypothetical protein  26.26 
 
 		 254 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.00000000000145499  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4667  alpha/beta hydrolase fold  31.82 
 
 		 260 aa  48.9  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.113193  normal  0.117505 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2898  hypothetical protein  30.21 
 
 		 255 aa  48.9  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000114451  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0837  putative esterase  31.52 
 
 		 258 aa  48.9  0.00008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2950  alpha/beta hydrolase fold  35.37 
 
 		 461 aa  48.9  0.00008  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2054  alpha/beta hydrolase fold  31.52 
 
 		 252 aa  48.9  0.00008  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0866141  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3121  hypothetical protein  30.21 
 
 		 259 aa  48.5  0.00009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.0000331929  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2986  hypothetical protein  30.21 
 
 		 255 aa  48.5  0.00009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.33197  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00643  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000010714  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2037  Alpha/beta hydrolase fold  31.63 
 
 		 302 aa  48.1  0.0001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.421524 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2935  hypothetical protein  29.41 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.568847  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2970  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000312971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00634  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00000490791  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1920  alpha/beta hydrolase fold  32.29 
 
 		 255 aa  48.5  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  unclonable  0.00000223856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3175  hypothetical protein  27.6 
 
 		 260 aa  47.8  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.567712  normal  0.0913717 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3121  hypothetical protein  29.59 
 
 		 229 aa  48.1  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.864442  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0733  hypothetical protein  27.27 
 
 		 254 aa  48.1  0.0001  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  5.4403099999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00325  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_1G02390)  31 
 
 		 295 aa  47.8  0.0002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0756  hypothetical protein  27.45 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  unclonable  0.0000320823  normal  0.242139 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1879  alpha/beta hydrolase fold  25.98 
 
 		 270 aa  47.8  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0804  hypothetical protein  27.45 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  unclonable  0.0000284969  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0743  hypothetical protein  27.45 
 
 		 256 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  unclonable  0.000000000000786446  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4676  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  31.31 
 
 		 331 aa  47.8  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.318593  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3691  putative hydrolase  36.96 
 
 		 259 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.236062 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0319  hypothetical protein  30.21 
 
 		 255 aa  47.8  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000000242239  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0817  hypothetical protein  27.45 
 
 		 256 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.000104367  normal  0.28548 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0781  hypothetical protein  25.25 
 
 		 254 aa  47  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.00000000454581  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4111  alpha/beta hydrolase fold protein  36.23 
 
 		 288 aa  47  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0346007  normal  0.0462514 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3469  alpha/beta hydrolase fold protein  38.24 
 
 		 304 aa  47  0.0003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.210979  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3210  alpha/beta hydrolase fold protein  28.57 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.45774  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2273  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 		 259 aa  46.6  0.0003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000254072  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  30 
 
 		 314 aa  46.6  0.0003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.143754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6643  putative triacylglycerol lipase  32.11 
 
 		 275 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.192902  normal  0.181736 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01343  hypothetical protein  31.31 
 
 		 255 aa  46.6  0.0003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2951  alpha/beta hydrolase fold protein  25.25 
 
 		 254 aa  46.6  0.0004  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.00000000000000161502  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2120  alpha/beta hydrolase fold protein  39.44 
 
 		 437 aa  46.6  0.0004  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1691  hypothetical protein  33.82 
 
 		 299 aa  46.6  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.517276  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8386  hydrolase, alpha  35.42 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.139718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1078  alpha/beta hydrolase fold  29.25 
 
 		 260 aa  46.2  0.0005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.045467  normal  0.0264161 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1801  hypothetical protein  36.36 
 
 		 238 aa  46.2  0.0005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.0314686 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1923  alpha/beta hydrolase fold protein  25.56 
 
 		 304 aa  46.2  0.0005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  26.52 
 
 		 271 aa  46.2  0.0005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0853  hypothetical protein  26.47 
 
 		 256 aa  46.2  0.0005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  unclonable  0.000000437553  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1052  alpha/beta fold family hydrolase  39.33 
 
 		 302 aa  45.8  0.0006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0564  hypothetical protein  25.25 
 
 		 254 aa  45.8  0.0006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  0.00000000000000107362  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1800  alpha/beta hydrolase fold  34.29 
 
 		 260 aa  45.8  0.0006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.155348 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  26.14 
 
 		 268 aa  45.4  0.0007  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7902  alpha/beta hydrolase fold protein  37.62 
 
 		 295 aa  45.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1217  alpha/beta hydrolase fold protein  22.78 
 
 		 335 aa  45.8  0.0007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2696  alpha/beta hydrolase fold protein  26.17 
 
 		 268 aa  45.4  0.0008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.094894  normal  0.233594 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>