294 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPD_2092 on replicon NC_007958
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB5



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007958  RPD_2092  MgtC/SapB transporter  100 
 
 		 169 aa  329  9e-90  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3350  MgtC/SapB transporter  86.71 
 
 		 166 aa  259  1e-68  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.412283  normal  0.0394509 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2236  MgtC/SapB transporter  68.87 
 
 		 159 aa  189  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2114  MgtC/SapB transporter  59.75 
 
 		 178 aa  172  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.170064 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0789  MgtC/SapB transporter  50.75 
 
 		 155 aa  99  3e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187673  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2512  MgtC/SapB transporter  52.07 
 
 		 231 aa  98.6  3e-20  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.775208  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0515  MgtC/SapB transporter  42.58 
 
 		 233 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.14823  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0520  MgtC/SapB transporter  42.86 
 
 		 233 aa  97.4  9e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960712  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6895  MgtC/SapB transporter  40.91 
 
 		 164 aa  97.1  1e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.651851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3389  MgtC/SapB transporter  41.79 
 
 		 151 aa  97.1  1e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2106  MgtC/SapB transporter  44.19 
 
 		 163 aa  96.7  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0531  MgtC/SapB transporter  42.37 
 
 		 245 aa  95.9  2e-19  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.772543  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1072  MgtC/SapB transporter  42.42 
 
 		 150 aa  95.1  4e-19  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.270701 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1988  MgtC/SapB transporter  43.09 
 
 		 162 aa  95.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.45523 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2209  Mg2+ transporter  40.48 
 
 		 162 aa  94.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.60782  normal  0.0151422 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4053  MgtC/SapB transporter  47.37 
 
 		 173 aa  93.2  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0487  MgtC/SapB transporter  41.61 
 
 		 232 aa  94  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2296  MgtC/SapB transporter  39.87 
 
 		 174 aa  93.2  2e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00897409  hitchhiker  0.00000501406 
 
 
-
 
NC_007595  Synpcc7942_B2621  hypothetical protein  37.36 
 
 		 182 aa  91.7  4e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.613191 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1508  MgtC/SapB transporter  48.15 
 
 		 161 aa  91.3  6e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1595  MgtC/SapB transporter  44 
 
 		 158 aa  90.5  1e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0175  MgtC/SapB transporter  47.93 
 
 		 229 aa  89.7  2e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000171884 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1354  MgtC/SapB transporter  50.47 
 
 		 189 aa  89.4  2e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.154231  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1213  MgtC/SapB transporter  42.22 
 
 		 176 aa  88.2  4e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.463741  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2506  MgtC/SapB transporter  50.47 
 
 		 189 aa  88.2  5e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.174906  normal  0.0242046 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2532  MgtC/SapB transporter  48.62 
 
 		 194 aa  86.7  1e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.643445 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1106  mgtC family protein  41.59 
 
 		 237 aa  85.9  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2209  putative Mg(2+) transport ATPase  41.13 
 
 		 219 aa  84.3  8e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.849166  normal  0.287318 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1805  putative Mg(2+) transport ATPase  41.13 
 
 		 219 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1915  putative Mg(2+) transport ATPase  41.13 
 
 		 219 aa  84.3  8e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1929  MgtC family protein  40.71 
 
 		 225 aa  83.6  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2836  MgtC/SapB transporter  39.63 
 
 		 175 aa  83.6  0.000000000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0690629  normal  0.200649 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0202  MgtC/SapB transporter  37.98 
 
 		 226 aa  83.6  0.000000000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000128946  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1216  MgtC/SapB transporter  46.09 
 
 		 250 aa  83.6  0.000000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.20546  normal  0.177657 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0991  MgtC/SapB transporter  39.08 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3628  MgtC/SapB transporter  36.57 
 
 		 170 aa  83.2  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3329  MgtC/SapB transporter  35.44 
 
 		 170 aa  82.4  0.000000000000003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.689759  normal  0.197682 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0894  MgtC family protein  38.73 
 
 		 221 aa  81.6  0.000000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00160229  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0446  MgtC/SapB transporter  35.33 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.631605  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2849  MgtC/SapB transporter  41.07 
 
 		 225 aa  80.9  0.000000000000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1271  MgtC/SapB transporter  36.11 
 
 		 264 aa  80.9  0.000000000000009  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2677  Mg2+ transporter  47.11 
 
 		 250 aa  80.9  0.000000000000009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1942  MgtC/SapB transporter  45.6 
 
 		 172 aa  80.9  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.968132  hitchhiker  0.00172297 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3906  putative Mg(2+) transport ATPase  41.67 
 
 		 215 aa  80.5  0.00000000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7027  MgtC/SapB transporter  44.19 
 
 		 165 aa  80.5  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5837  MgtC/SapB transporter  44 
 
 		 170 aa  80.5  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.574002  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2382  MgtC/SapB transporter  46.4 
 
 		 184 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.186606  normal  0.884832 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2233  MgtC/SapB transporter  46.4 
 
 		 172 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3994  putative Mg(2+) transport ATPase  41.67 
 
 		 215 aa  80.1  0.00000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7046  MgtC/SapB transporter  39.22 
 
 		 165 aa  80.1  0.00000000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03356  predicted Mg(2+) transport ATPase inner membrane protein  41.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.564701  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3541  Mg2+ transporter  45.6 
 
 		 172 aa  79.7  0.00000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03309  hypothetical protein  41.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.707373  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3710  putative Mg(2+) transport ATPase  41.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000797618  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1376  MgtC/SapB transporter  48.62 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3810  putative Mg(2+) transport ATPase  41.67 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0471375 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4867  putative Mg(2+) transport ATPase  41.67 
 
 		 219 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.555507 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2811  MgtC/SapB transporter  43.48 
 
 		 227 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0209  putative Mg(2+) transport ATPase  41.67 
 
 		 215 aa  79.7  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0346212 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2993  MgtC/SapB transporter  40.18 
 
 		 225 aa  79.7  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1335  MgtC/SapB transporter  46.28 
 
 		 250 aa  78.6  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.295436 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3464  MgtC/SapB transporter  42.5 
 
 		 176 aa  78.2  0.00000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.158085  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1981  MgtC/SapB transporter  38.89 
 
 		 225 aa  77.8  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0166435  normal  0.0845453 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2051  MgtC/SapB transporter  39.06 
 
 		 216 aa  77  0.0000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2170  putative MgtC/SapB transporter  35.53 
 
 		 168 aa  77.4  0.0000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1919  MgtC/SapB transporter  39.37 
 
 		 232 aa  77  0.0000000000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000262716  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3637  mgtC family protein  41.07 
 
 		 225 aa  76.6  0.0000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0348  MgtC/SapB transporter  36.84 
 
 		 185 aa  76.6  0.0000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.184436 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1679  mgtC family protein  41.07 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00131484  hitchhiker  2.42161e-20 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3324  mgtC family protein  40.18 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.230158  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3539  mgtC family protein  40.18 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  7.980840000000001e-24 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0663  putative Mg(2+) transporter  46.32 
 
 		 161 aa  75.9  0.0000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.373124  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3897  MgtC/SapB transporter  35.62 
 
 		 178 aa  76.3  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.174225 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0058  MgtC/SapB transporter  34.91 
 
 		 173 aa  76.3  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460783 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3585  mgtC family protein  40.18 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.859552  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2953  MgtC/SapB transporter  41.41 
 
 		 150 aa  75.9  0.0000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.932886  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2277  MgtC/SapB transporter  47.83 
 
 		 205 aa  76.3  0.0000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.188532  hitchhiker  0.000000264043 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0293  MgtC/SapB transporter  39.68 
 
 		 231 aa  75.9  0.0000000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3239  MgtC/SapB family membrane protein  40.18 
 
 		 225 aa  75.9  0.0000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4858  MgtC/SapB transporter  42.19 
 
 		 218 aa  75.5  0.0000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.891892  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2314  MgtC/SapB transporter  40.32 
 
 		 228 aa  75.9  0.0000000000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000678509  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1410  MgtC/SapB transporter  41.48 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.000273538  normal  0.129974 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2216  MgtC/SapB transporter  35.46 
 
 		 225 aa  75.1  0.0000000000004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000000668009  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1346  MgtC/SapB transporter  41.48 
 
 		 240 aa  75.1  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.340819  normal  0.0449923 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1909  MgtC/SapB transporter  40.35 
 
 		 227 aa  74.7  0.0000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.269087 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3230  MgtC/SapB transporter  38.21 
 
 		 225 aa  74.7  0.0000000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3543  mgtC family protein  40.18 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.82916  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3287  MgtC/SapB family membrane protein  40.18 
 
 		 225 aa  74.3  0.0000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3921  MgtC/SapB transporter  32.9 
 
 		 167 aa  73.9  0.0000000000009  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_6387  predicted protein  39.69 
 
 		 135 aa  73.9  0.0000000000009  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0649963  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3506  MgtC/SapB transporter  41.07 
 
 		 226 aa  73.9  0.0000000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000542084  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5034  sapB protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00683852  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4604  MgtC/SapB family membrane protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4626  MgtC/SapB family membrane protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.395521  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5127  sapb protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0207  sapB protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000857338  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5039  sapB protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000279435  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4717  MgtC/SapB transporter  41.07 
 
 		 227 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00330239  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5006  sapB protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.6  0.000000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5027  sapB protein  41.07 
 
 		 226 aa  73.9  0.000000000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0246703  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>