More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_4279 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_4279  alpha/beta hydrolase fold  100 
 
 		 287 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.52768  normal  0.131681 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1192  alpha/beta superfamily hydrolase  62.11 
 
 		 287 aa  372  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.696402  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3372  alpha/beta hydrolase fold  44.21 
 
 		 294 aa  253  3e-66  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.771296 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3352  alpha/beta superfamily hydrolase  41.16 
 
 		 314 aa  220  1.9999999999999999e-56  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0154019  normal  0.941858 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2652  alpha/beta hydrolase fold protein  30.32 
 
 		 268 aa  107  2e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.191504  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2420  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 		 278 aa  103  3e-21  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.0232728  decreased coverage  0.0000010023 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0341  alpha/beta hydrolase fold  30.3 
 
 		 265 aa  102  7e-21  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4967  hydrolase, alpha/beta fold family  26.37 
 
 		 270 aa  102  1e-20  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4985  SHCHC synthase  26.28 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.30423  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4047  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 270 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0321  alpha/beta hydrolase fold protein  29.92 
 
 		 264 aa  100  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1350  alpha/beta hydrolase fold  29.21 
 
 		 270 aa  99.4  6e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.114885 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4540  alpha/beta fold family hydrolase  29.59 
 
 		 270 aa  99  8e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4587  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.64 
 
 		 270 aa  98.6  9e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4749  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3834  alpha/beta hydrolase fold  28.09 
 
 		 270 aa  98.6  1e-19  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.441877 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5110  alpha/beta fold family hydrolase  25.64 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.98697  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0253  hydrolase, alpha/beta fold family  25.64 
 
 		 270 aa  98.2  1e-19  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000360358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3492  alpha/beta hydrolase fold  27.74 
 
 		 270 aa  97.8  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2798  alpha/beta hydrolase fold protein  25.18 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4696  alpha/beta hydrolase fold  25.64 
 
 		 270 aa  97.1  3e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1002  alpha/beta hydrolase fold  30.11 
 
 		 280 aa  97.1  3e-19  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2307  alpha/beta fold family hydrolase  28.15 
 
 		 277 aa  97.1  3e-19  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.974393 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2125  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 280 aa  95.9  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0271359  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4215  alpha/beta hydrolase fold  29.03 
 
 		 271 aa  95.9  7e-19  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.756479  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5014  alpha/beta fold family hydrolase  24.54 
 
 		 270 aa  95.5  1e-18  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4996  hydrolase, alpha/beta fold family  24.54 
 
 		 270 aa  95.1  1e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.556402  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0115  alpha/beta hydrolase fold protein  28.26 
 
 		 267 aa  94.4  2e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2186  alpha/beta hydrolase fold  29.6 
 
 		 276 aa  92.4  7e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000605842  normal  0.0104455 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3547  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 266 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.307445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  25.82 
 
 		 265 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2126  alpha/beta hydrolase fold protein  31.14 
 
 		 263 aa  90.5  3e-17  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1429  Alpha/beta hydrolase fold  27.92 
 
 		 267 aa  90.1  4e-17  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.495278  normal  0.160161 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2308  alpha/beta fold family hydrolase  28.78 
 
 		 283 aa  90.1  4e-17  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  0.628895 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2870  3-oxoadipate enol-lactonase  28.52 
 
 		 266 aa  89.4  6e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4609  hydrolase; menaquinone biosynthesis related protein; prolyl aminopeptidase  25.09 
 
 		 270 aa  89.4  7e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9212  alpha/beta hydrolase fold protein  30.1 
 
 		 283 aa  89  8e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  27.37 
 
 		 273 aa  89  9e-17  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3157  alpha/beta fold family hydrolase  28.11 
 
 		 266 aa  88.2  1e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3943  3-oxoadipate enol-lactonase  29.41 
 
 		 265 aa  87.4  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0394549  normal  0.0878902 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2473  alpha/beta fold family hydrolase  27.54 
 
 		 277 aa  87.4  2e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0084  3-oxoadipate enol-lactonase  26.2 
 
 		 282 aa  87.8  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0780  alpha/beta hydrolase fold  27.87 
 
 		 276 aa  87.8  2e-16  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0600224  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4089  hydrolase, alpha/beta fold family  24.91 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.05653  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3896  alpha/beta hydrolase fold protein  29.85 
 
 		 263 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.407554  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0152  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 		 279 aa  87  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.632153 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0595  putative lactone hydrolase  29.1 
 
 		 265 aa  86.7  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208776 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2472  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 276 aa  86.7  4e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.000154463  normal  0.0300532 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1078  alpha/beta hydrolase fold protein  25.28 
 
 		 253 aa  86.3  5e-16  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1990  alpha/beta hydrolase fold protein  29.52 
 
 		 276 aa  86.3  5e-16  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.0000535519  hitchhiker  0.0000000629591 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3605  alpha/beta hydrolase fold  28.88 
 
 		 284 aa  86.3  6e-16  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.753861  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0569  alpha/beta hydrolase fold protein  24.31 
 
 		 270 aa  85.9  7e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2123  alpha/beta hydrolase fold  28.52 
 
 		 276 aa  85.9  8e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.412554  hitchhiker  0.000231398 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1855  alpha/beta hydrolase fold  26.97 
 
 		 276 aa  85.5  9e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.121487  decreased coverage  0.00000000112067 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3126  Alpha/beta hydrolase  27.05 
 
 		 261 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2505  alpha/beta family hydrolase  29 
 
 		 279 aa  85.5  0.000000000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2369  alpha/beta hydrolase fold  29.15 
 
 		 276 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00123435  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001619  beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  29.74 
 
 		 271 aa  85.5  0.000000000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00597314  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2356  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 		 276 aa  85.5  0.000000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0240084  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3016  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.352868  normal  0.357434 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2974  3-oxoadipate enol-lactonase  27.57 
 
 		 260 aa  84  0.000000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.108542  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3207  alpha/beta fold family hydrolase  29.29 
 
 		 271 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.39974  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2473  hypothetical protein  25.29 
 
 		 286 aa  83.6  0.000000000000004  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3959  alpha/beta hydrolase fold  30.18 
 
 		 264 aa  83.2  0.000000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.166818 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1645  alpha/beta hydrolase fold  29.7 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.996172  normal  0.353966 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3910  alpha/beta hydrolase fold  29.93 
 
 		 263 aa  83.2  0.000000000000005  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.399825  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1860  alpha/beta hydrolase fold  27.41 
 
 		 277 aa  83.2  0.000000000000005  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000272829 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0733  alpha/beta hydrolase fold  28.74 
 
 		 280 aa  83.2  0.000000000000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.204474  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0751  alpha/beta hydrolase fold  28.99 
 
 		 270 aa  83.2  0.000000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.158146 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5110  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4401  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 		 275 aa  83.2  0.000000000000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4474  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5749  3-oxoadipate enol-lactonase  26.07 
 
 		 261 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.74876  normal  0.111233 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3939  Alpha/beta hydrolase fold  27.96 
 
 		 270 aa  82.8  0.000000000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1232  alpha/beta hydrolase fold protein  27.57 
 
 		 277 aa  82.8  0.000000000000006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2398  alpha/beta hydrolase fold protein  27.44 
 
 		 282 aa  82.8  0.000000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.240634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5320  3-oxoadipate enol-lactonase  28.4 
 
 		 260 aa  82.4  0.000000000000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.753316 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1259  3-oxoadipate enol-lactonase  25.55 
 
 		 261 aa  82.8  0.000000000000007  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0220  alpha/beta hydrolase fold  26.21 
 
 		 272 aa  82  0.000000000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.723702 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0298  B-ketoadipate enol-lactone hydrolase protein  27.27 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3988  alpha/beta hydrolase fold protein  29.56 
 
 		 263 aa  82  0.00000000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0050  putative beta-ketoadipate enol-lactone hydrolase  27.17 
 
 		 270 aa  82  0.00000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000263931  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0675  arylesterase  27.02 
 
 		 272 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1168  alpha/beta hydrolase fold protein  26.67 
 
 		 271 aa  81.6  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.375352  normal  0.0130652 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3161  3-oxoadipate enol-lactonase  27.05 
 
 		 261 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4878  alpha/beta hydrolase fold  28.14 
 
 		 279 aa  81.6  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0658691 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1910  alpha/beta hydrolase fold  27.78 
 
 		 276 aa  82  0.00000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.1426  hitchhiker  0.0000239826 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5285  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 		 261 aa  80.9  0.00000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.221975  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3377  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 		 273 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00853  hypothetical protein  28.31 
 
 		 275 aa  80.9  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3588  alpha/beta hydrolase fold protein  27.99 
 
 		 282 aa  81.3  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.291858  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2225  alpha/beta hydrolase fold  29.74 
 
 		 273 aa  80.9  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5253  arylesterase, putative  26.64 
 
 		 272 aa  80.5  0.00000000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  28.36 
 
 		 263 aa  80.5  0.00000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1380  alpha/beta hydrolase fold  23.99 
 
 		 268 aa  80.5  0.00000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0135  alpha/beta hydrolase fold  29.45 
 
 		 265 aa  80.5  0.00000000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5020  3-oxoadipate enol-lactonase  26.69 
 
 		 261 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  27.11 
 
 		 265 aa  80.1  0.00000000000004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2207  alpha/beta hydrolase  28.29 
 
 		 260 aa  79.7  0.00000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.649454  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3736  alpha/beta hydrolase fold  26.62 
 
 		 305 aa  79.7  0.00000000000005  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.265867  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>