More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1479 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007925  RPC_1479  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 474 aa  941    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1329  FAD dependent oxidoreductase  68.07 
 
 		 457 aa  597  1e-169  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5539  putative FAD dependent oxidoreductase  67.54 
 
 		 476 aa  584  1e-166  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300713  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1662  FAD dependent oxidoreductase  65.7 
 
 		 486 aa  585  1e-166  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.739475  normal  0.281341 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1098  FAD dependent oxidoreductase  65.54 
 
 		 457 aa  579  1e-164  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3822  FAD dependent oxidoreductase  66.74 
 
 		 487 aa  568  1e-161  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4460  FAD dependent oxidoreductase  66.75 
 
 		 486 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  34.59 
 
 		 431 aa  231  1e-59  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  35.35 
 
 		 426 aa  223  4e-57  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  31.01 
 
 		 427 aa  183  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.84 
 
 		 426 aa  179  1e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  32.67 
 
 		 425 aa  173  5e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  30.79 
 
 		 430 aa  173  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.66 
 
 		 425 aa  169  7e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  32.37 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  32.37 
 
 		 430 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  32.37 
 
 		 430 aa  167  4e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  33.08 
 
 		 426 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 422 aa  162  9e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  31.09 
 
 		 430 aa  161  3e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 437 aa  158  2e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  31.27 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.67 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  31.27 
 
 		 433 aa  157  3e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  31.27 
 
 		 433 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  30.37 
 
 		 422 aa  157  5.0000000000000005e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  31.02 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  31.02 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0572  oxidoreductase, FAD-binding  31.02 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0464061  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  31.02 
 
 		 433 aa  156  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  30.85 
 
 		 430 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.13 
 
 		 430 aa  153  5e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 433 aa  153  7e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  31.49 
 
 		 438 aa  152  8.999999999999999e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  30.19 
 
 		 433 aa  152  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5161  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 651 aa  152  2e-35  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.45475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  30.6 
 
 		 449 aa  152  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  30.25 
 
 		 433 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 		 423 aa  150  3e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4632  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 		 422 aa  150  7e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  29.35 
 
 		 427 aa  149  8e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  27.03 
 
 		 425 aa  149  8e-35  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  28.5 
 
 		 435 aa  149  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  32.21 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  32.66 
 
 		 438 aa  148  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.58 
 
 		 433 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  30.27 
 
 		 461 aa  148  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 422 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3095  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 422 aa  148  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  31.27 
 
 		 468 aa  147  3e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  31.27 
 
 		 468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  28.24 
 
 		 427 aa  147  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  27.98 
 
 		 427 aa  147  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  28.15 
 
 		 435 aa  147  6e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  28.43 
 
 		 426 aa  146  1e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  28.54 
 
 		 427 aa  145  1e-33  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  29.04 
 
 		 429 aa  146  1e-33  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  31 
 
 		 468 aa  145  2e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  28.54 
 
 		 427 aa  145  2e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4996  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 422 aa  145  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156113  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  29.43 
 
 		 440 aa  145  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.7 
 
 		 431 aa  144  3e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  28.31 
 
 		 441 aa  144  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  31.83 
 
 		 439 aa  144  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 431 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30.17 
 
 		 431 aa  142  9e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  30.71 
 
 		 433 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  30.05 
 
 		 431 aa  142  1.9999999999999998e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  30.89 
 
 		 434 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  29.97 
 
 		 429 aa  140  4.999999999999999e-32  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  28.27 
 
 		 453 aa  140  6e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 434 aa  139  7.999999999999999e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  31.2 
 
 		 434 aa  139  1e-31  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  30.2 
 
 		 436 aa  139  1e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.25 
 
 		 428 aa  139  1e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  28.04 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0098  hypothetical protein  30.54 
 
 		 437 aa  138  2e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 428 aa  138  2e-31  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  29.77 
 
 		 433 aa  138  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  31.4 
 
 		 443 aa  138  2e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28.46 
 
 		 439 aa  139  2e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  29.81 
 
 		 439 aa  138  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1975  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 427 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.185752  normal  0.0484481 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 		 428 aa  137  3.0000000000000003e-31  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  29.55 
 
 		 429 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  25.99 
 
 		 440 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1198  FAD dependent oxidoreductase  25.72 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.98 
 
 		 428 aa  137  4e-31  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 437 aa  136  8e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  29.15 
 
 		 435 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0969  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 434 aa  135  1.9999999999999998e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  26.72 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  26.6 
 
 		 428 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>