More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1098 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_1098  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 
457 aa  911    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1329  FAD dependent oxidoreductase  83.92 
 
 
457 aa  747    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5539  putative FAD dependent oxidoreductase  70.55 
 
 
476 aa  617  1e-175  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300713  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1479  FAD dependent oxidoreductase  68.47 
 
 
474 aa  576  1.0000000000000001e-163  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3822  FAD dependent oxidoreductase  60 
 
 
487 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1662  FAD dependent oxidoreductase  59.34 
 
 
486 aa  548  1e-155  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.739475  normal  0.281341 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4460  FAD dependent oxidoreductase  61.19 
 
 
486 aa  530  1e-149  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  34.52 
 
 
431 aa  218  2.9999999999999998e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  34.07 
 
 
426 aa  211  2e-53  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  30.63 
 
 
427 aa  182  1e-44  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  32.66 
 
 
426 aa  176  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  31.44 
 
 
430 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  30.99 
 
 
422 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  32.69 
 
 
425 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  31.67 
 
 
422 aa  169  7e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5161  FAD dependent oxidoreductase  31.57 
 
 
651 aa  167  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.45475 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4632  FAD dependent oxidoreductase  31.48 
 
 
422 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.49 
 
 
430 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 
425 aa  160  3e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  31.55 
 
 
426 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
422 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3095  FAD dependent oxidoreductase  31.72 
 
 
422 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.49 
 
 
430 aa  160  6e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4996  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 
422 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156113  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  30.3 
 
 
430 aa  154  4e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  28.81 
 
 
441 aa  153  5.9999999999999996e-36  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  30.08 
 
 
430 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  31.64 
 
 
433 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  31.36 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 
437 aa  148  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  31.36 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  30.08 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0572  oxidoreductase, FAD-binding  31.36 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0464061  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  31.36 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  30.08 
 
 
430 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 
433 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  30.43 
 
 
461 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  30.93 
 
 
433 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  27.5 
 
 
449 aa  145  1e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  28.72 
 
 
449 aa  145  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
433 aa  145  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  29.35 
 
 
430 aa  144  3e-33  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  29.1 
 
 
435 aa  142  9e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  29.49 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  29.12 
 
 
433 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  27.96 
 
 
440 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  29.22 
 
 
433 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
426 aa  140  6e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 
423 aa  139  1e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  29.72 
 
 
468 aa  138  2e-31  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  26.74 
 
 
425 aa  139  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  29.72 
 
 
468 aa  138  3.0000000000000003e-31  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  29.47 
 
 
468 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  27.78 
 
 
435 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  29.72 
 
 
433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
433 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  28.23 
 
 
434 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  27.27 
 
 
435 aa  134  3.9999999999999996e-30  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.85 
 
 
431 aa  133  5e-30  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30.08 
 
 
431 aa  133  7.999999999999999e-30  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  32.51 
 
 
438 aa  132  1.0000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  28.61 
 
 
433 aa  132  1.0000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  29.82 
 
 
431 aa  132  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.18 
 
 
431 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  28.86 
 
 
443 aa  130  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.53 
 
 
438 aa  129  8.000000000000001e-29  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  28.61 
 
 
433 aa  129  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.39 
 
 
439 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  28.12 
 
 
453 aa  128  2.0000000000000002e-28  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1197  FAD dependent oxidoreductase  26.17 
 
 
429 aa  128  3e-28  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.256895  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  27.88 
 
 
434 aa  127  3e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  27.07 
 
 
430 aa  127  3e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  27.34 
 
 
439 aa  127  3e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  28.28 
 
 
429 aa  127  5e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  25.36 
 
 
435 aa  127  5e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0717  D-amino acid oxidase family protein  29.27 
 
 
428 aa  127  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0770  D-amino acid oxidase family protein  29.27 
 
 
428 aa  126  7e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.451477  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  26.91 
 
 
436 aa  126  8.000000000000001e-28  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  30.15 
 
 
429 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  26.84 
 
 
435 aa  125  1e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
428 aa  125  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
428 aa  125  2e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  27.56 
 
 
428 aa  124  3e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_06960  hypothetical protein  27.76 
 
 
429 aa  124  3e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  26.16 
 
 
428 aa  124  3e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  24.26 
 
 
440 aa  124  5e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6084  putative oxidoreductase  27.34 
 
 
439 aa  124  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1103  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
435 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.988451  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  27.59 
 
 
437 aa  123  6e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 
428 aa  123  6e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3001  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
434 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2387  FAD dependent oxidoreductase  27.15 
 
 
434 aa  123  6e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.356658  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  25.43 
 
 
428 aa  123  6e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
428 aa  123  7e-27  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2910  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 
434 aa  123  7e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1162  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
435 aa  123  8e-27  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.965544  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  27.32 
 
 
430 aa  123  8e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3196  FAD dependent oxidoreductase  25.84 
 
 
435 aa  122  9e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.0472268 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>