More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1329 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1098  FAD dependent oxidoreductase  83.92 
 
 		 457 aa  744    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.264877  normal  0.339438 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1329  FAD dependent oxidoreductase  100 
 
 		 457 aa  905    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5539  putative FAD dependent oxidoreductase  71.33 
 
 		 476 aa  619  1e-176  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.300713  normal  0.1806 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1479  FAD dependent oxidoreductase  70.44 
 
 		 474 aa  581  1.0000000000000001e-165  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.484971 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1662  FAD dependent oxidoreductase  63 
 
 		 486 aa  558  1e-158  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.739475  normal  0.281341 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3822  FAD dependent oxidoreductase  62.53 
 
 		 487 aa  549  1e-155  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4460  FAD dependent oxidoreductase  64.85 
 
 		 486 aa  538  9.999999999999999e-153  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.131027  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2579  FAD dependent oxidoreductase  35.68 
 
 		 431 aa  237  4e-61  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.612583  normal  0.495768 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2849  FAD dependent oxidoreductase  34.43 
 
 		 426 aa  213  4.9999999999999996e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.563047  normal  0.480515 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3264  FAD dependent oxidoreductase  31.5 
 
 		 427 aa  189  1e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4572  FAD dependent oxidoreductase  33.33 
 
 		 426 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3597  FAD dependent oxidoreductase  33.66 
 
 		 425 aa  181  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7678  FAD dependent oxidoreductase  32.39 
 
 		 430 aa  179  7e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.428823  normal  0.196419 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0378  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 422 aa  173  5.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0322129  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0887  putative FAD-binding oxidoreductase  33.33 
 
 		 426 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3449  FAD dependent oxidoreductase  31.65 
 
 		 422 aa  168  2e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0935  putative oxidoreductase  30.61 
 
 		 430 aa  163  6e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.340528  normal  0.725116 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4659  FAD dependent oxidoreductase  30.1 
 
 		 430 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1338  FAD dependent oxidoreductase  31.13 
 
 		 425 aa  161  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3049  FAD dependent oxidoreductase  31.35 
 
 		 433 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2911  FAD dependent oxidoreductase  32.44 
 
 		 433 aa  160  5e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0628  oxidoreductase  31.56 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.161285  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0720  oxidoreductase  31.56 
 
 		 430 aa  160  5e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.890874  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5161  FAD dependent oxidoreductase  31.6 
 
 		 651 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.45475 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6070  FAD dependent oxidoreductase  31.98 
 
 		 430 aa  160  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.21193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2014  oxidoreductase  31.3 
 
 		 430 aa  159  1e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2996  FAD dependent oxidoreductase  31.38 
 
 		 433 aa  159  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4632  FAD dependent oxidoreductase  31.51 
 
 		 422 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1954  oxidoreductase, FAD-binding  31.3 
 
 		 430 aa  157  3e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0501  oxidoreductase, FAD-binding  32.21 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1990  oxidoreductase, FAD-binding  32.21 
 
 		 433 aa  156  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2086  oxidoreductase, FAD-binding  32.21 
 
 		 433 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.133623  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5272  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.168403  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0774  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0684  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0572  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0464061  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3002  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1637  oxidoreductase, FAD-binding  31.93 
 
 		 433 aa  155  2e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3095  FAD dependent oxidoreductase  31.76 
 
 		 422 aa  155  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3021  FAD dependent oxidoreductase  30.27 
 
 		 433 aa  154  4e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6351  FAD dependent oxidoreductase  30.34 
 
 		 433 aa  153  5.9999999999999996e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4996  FAD dependent oxidoreductase  31.27 
 
 		 422 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.156113  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1741  FAD dependent oxidoreductase  29.06 
 
 		 441 aa  152  1e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000206707 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0892  oxidoreductase, FAD-binding  31.2 
 
 		 461 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2625  FAD dependent oxidoreductase  30.54 
 
 		 423 aa  146  7.0000000000000006e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.526109  normal  0.108457 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0242  FAD dependent oxidoreductase  29.85 
 
 		 437 aa  145  2e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1899  oxidoreductase  28.57 
 
 		 449 aa  144  5e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.152308 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0721  oxidoreductase  30.23 
 
 		 468 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.625822  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0629  oxidoreductase  30.23 
 
 		 468 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.356025  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3146  oxidoreductase, putative  29.74 
 
 		 431 aa  141  3e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4658  FAD dependent oxidoreductase  28.21 
 
 		 449 aa  141  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2568  FAD dependent oxidoreductase  29.91 
 
 		 431 aa  140  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2015  oxidoreductase  29.97 
 
 		 468 aa  139  7e-32  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2064  FAD dependent oxidoreductase  27.96 
 
 		 426 aa  139  7.999999999999999e-32  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0863  FAD dependent oxidoreductase  30.4 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2032  FAD dependent oxidoreductase  29.3 
 
 		 433 aa  139  1e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2383  FAD dependent oxidoreductase  28.86 
 
 		 435 aa  139  1e-31  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.155247  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3518  FAD dependent oxidoreductase  27.39 
 
 		 425 aa  138  2e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.239755 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2899  FAD dependent oxidoreductase  30.14 
 
 		 431 aa  138  2e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0934  putative oxidoreductase  27.92 
 
 		 440 aa  138  2e-31  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.154441  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0942  FAD dependent oxidoreductase  27.43 
 
 		 435 aa  139  2e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0378  hypothetical protein  29.3 
 
 		 433 aa  137  4e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.18492  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1953  oxidoreductase, FAD-binding  29.87 
 
 		 443 aa  137  4e-31  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1057  FAD dependent oxidoreductase  27.23 
 
 		 435 aa  137  4e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5529  FAD dependent oxidoreductase  28.4 
 
 		 436 aa  137  5e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.460053 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5325  FAD dependent oxidoreductase  27.52 
 
 		 430 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0381154 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_48010  D-amino acid oxidoreductase family protein  29.66 
 
 		 438 aa  135  9.999999999999999e-31  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2709  FAD dependent oxidoreductase  30.33 
 
 		 431 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.362524 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2995  FAD dependent oxidoreductase  29.78 
 
 		 433 aa  135  1.9999999999999998e-30  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3188  FAD dependent oxidoreductase  28.03 
 
 		 428 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0304337  hitchhiker  0.00908383 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2830  FAD dependent oxidoreductase  29.7 
 
 		 433 aa  134  3e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6350  FAD dependent oxidoreductase  28.76 
 
 		 434 aa  134  3e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1909  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 427 aa  134  3.9999999999999996e-30  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.275266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1203  FAD dependent oxidoreductase  27.55 
 
 		 428 aa  134  5e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0141926  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3093  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 428 aa  134  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0147187  normal  0.775348 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2914  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 428 aa  133  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00154313  normal  0.633175 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1098  FAD dependent oxidoreductase  27.47 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.289023  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0637  hypothetical protein  27.9 
 
 		 429 aa  133  6.999999999999999e-30  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2996  FAD dependent oxidoreductase  27.01 
 
 		 428 aa  133  6.999999999999999e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0244962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1127  FAD dependent oxidoreductase  25.85 
 
 		 435 aa  133  7.999999999999999e-30  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1170  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.000237219  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1112  FAD dependent oxidoreductase  27.81 
 
 		 428 aa  132  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000918343  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_70100  putative oxidoreductase  28.07 
 
 		 439 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28180  hypothetical protein  26.84 
 
 		 427 aa  132  1.0000000000000001e-29  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0347636  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3245  FAD dependent oxidoreductase  26.96 
 
 		 427 aa  131  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.363775  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0537  FAD dependent oxidoreductase  31.22 
 
 		 419 aa  132  2.0000000000000002e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2448  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4808  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 429 aa  131  3e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3524  FAD dependent oxidoreductase  26.7 
 
 		 427 aa  131  3e-29  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.193766 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1124  FAD dependent oxidoreductase  28.75 
 
 		 453 aa  130  4.0000000000000003e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.564615  normal  0.27217 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1949  FAD dependent oxidoreductase  26.44 
 
 		 427 aa  130  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.764265  decreased coverage  0.00013363 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3020  FAD dependent oxidoreductase  29.03 
 
 		 434 aa  130  6e-29  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2456  hypothetical protein  26.58 
 
 		 427 aa  130  6e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0482132  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0197  FAD dependent oxidoreductase  26.83 
 
 		 430 aa  130  6e-29  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00048613 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1398  FAD dependent oxidoreductase  31.06 
 
 		 436 aa  130  6e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.35524 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0950  FAD dependent oxidoreductase  24.67 
 
 		 440 aa  129  8.000000000000001e-29  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00465  oxidoreductase  31.5 
 
 		 438 aa  129  8.000000000000001e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.835263  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0232  FAD dependent oxidoreductase  27.65 
 
 		 437 aa  129  9.000000000000001e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1090  FAD dependent oxidoreductase  27.21 
 
 		 435 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.143362  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3005  FAD dependent oxidoreductase  26.47 
 
 		 428 aa  129  9.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.432332  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>