More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_1389 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004311  BRA0218  DNA mismatch repair protein  55.04 
 
 		 623 aa  641    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0787206  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4855  DNA mismatch repair protein  86.31 
 
 		 595 aa  1050    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4062  DNA mismatch repair protein  55.52 
 
 		 643 aa  653    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2548  DNA mismatch repair protein  82.59 
 
 		 603 aa  981    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.17269  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3049  DNA mismatch repair protein  54.23 
 
 		 626 aa  640    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4176  DNA mismatch repair protein  86.31 
 
 		 597 aa  1048    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.285632  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0198  DNA mismatch repair protein  55.04 
 
 		 623 aa  641    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1389  DNA mismatch repair protein  100 
 
 		 599 aa  1195    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.41073  normal  0.777612 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3054  DNA mismatch repair protein  60.1 
 
 		 643 aa  710    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0230443  normal  0.222547 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4032  DNA mismatch repair protein  85.81 
 
 		 597 aa  1045    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.733731  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3169  DNA mismatch repair protein  84.77 
 
 		 603 aa  1013    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.484911  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0539  DNA mismatch repair protein  54.68 
 
 		 600 aa  635    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.111991  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1703  DNA mismatch repair protein  80.91 
 
 		 618 aa  973    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.346146  normal  0.342232 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0441  DNA mismatch repair protein  55.63 
 
 		 620 aa  649    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0293  DNA mismatch repair protein  58.59 
 
 		 602 aa  663    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0616  DNA mismatch repair protein  57.19 
 
 		 633 aa  638    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0800065 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0496  DNA mismatch repair protein  55.67 
 
 		 600 aa  643    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.170626 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0428  DNA mismatch repair protein  54.89 
 
 		 605 aa  634  1e-180  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.329312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2946  DNA mismatch repair protein  57.82 
 
 		 629 aa  630  1e-179  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1011  DNA mismatch repair protein MutL  54.04 
 
 		 637 aa  616  1e-175  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.266056  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2869  DNA mismatch repair protein MutL  55.87 
 
 		 605 aa  616  1e-175  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.110636 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0895  DNA mismatch repair protein  53.13 
 
 		 617 aa  612  9.999999999999999e-175  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.380086  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0102  DNA mismatch repair protein  52.3 
 
 		 644 aa  596  1e-169  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7371  DNA mismatch repair protein MutL  54.65 
 
 		 621 aa  588  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_4047  DNA mismatch repair protein  53.36 
 
 		 610 aa  590  1e-167  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2713  DNA mismatch repair protein  53.86 
 
 		 606 aa  591  1e-167  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0363  DNA mismatch repair protein  54.43 
 
 		 621 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.127252  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1095  DNA mismatch repair protein  53.56 
 
 		 632 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.045837  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2933  DNA mismatch repair protein  53.34 
 
 		 612 aa  581  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.169061 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2758  DNA mismatch repair protein  53.24 
 
 		 616 aa  580  1e-164  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1201  DNA mismatch repair protein  48.38 
 
 		 611 aa  577  1.0000000000000001e-163  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.894444  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0061  DNA mismatch repair protein MutL  51.25 
 
 		 648 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.340953  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6625  DNA mismatch repair protein MutL  53.08 
 
 		 641 aa  573  1.0000000000000001e-162  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.406254  normal  0.264989 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4632  DNA mismatch repair protein MutL  50.46 
 
 		 661 aa  565  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.56362  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4780  DNA mismatch repair protein MutL  49.47 
 
 		 671 aa  561  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.131576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4265  DNA mismatch repair protein MutL  50.38 
 
 		 687 aa  564  1.0000000000000001e-159  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221737 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0491  DNA mismatch repair protein  52.45 
 
 		 594 aa  558  1e-157  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0595243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1626  DNA mismatch repair protein  50.72 
 
 		 603 aa  530  1e-149  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.951242 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2127  DNA mismatch repair protein  49.83 
 
 		 603 aa  523  1e-147  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.633502  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1306  DNA mismatch repair protein  42.3 
 
 		 608 aa  493  9.999999999999999e-139  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.66007  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1040  DNA mismatch repair protein MutL  46.29 
 
 		 632 aa  494  9.999999999999999e-139  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619157 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0884  DNA mismatch repair protein  39.59 
 
 		 673 aa  473  1e-132  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.277202  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0509  DNA mismatch repair protein  39.71 
 
 		 598 aa  451  1e-125  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.587743  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1408  DNA mismatch repair protein MutL  45.2 
 
 		 639 aa  450  1e-125  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0628  DNA mismatch repair protein MutL  47.18 
 
 		 582 aa  447  1.0000000000000001e-124  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.100256  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0571  DNA mismatch repair protein MutL  43.08 
 
 		 636 aa  437  1e-121  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.707368  hitchhiker  0.00000000963067 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_2081  DNA mismatch repair protein  42.28 
 
 		 621 aa  432  1e-120  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_2002  DNA mismatch repair protein  42.25 
 
 		 619 aa  429  1e-119  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1384  DNA mismatch repair protein MutL  42.39 
 
 		 613 aa  432  1e-119  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.664684 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2771  DNA mismatch repair protein  42.2 
 
 		 629 aa  428  1e-118  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00410  DNA mismatch repair protein  42.22 
 
 		 625 aa  428  1e-118  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4772  DNA mismatch repair protein  40.98 
 
 		 633 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.209994  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4896  DNA mismatch repair protein  40.51 
 
 		 632 aa  422  1e-117  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4948  DNA mismatch repair protein  40.98 
 
 		 632 aa  423  1e-117  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.167425  normal  0.037125 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4687  DNA mismatch repair protein  40.32 
 
 		 633 aa  424  1e-117  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.427145  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_07520  DNA mismatch repair protein  41.89 
 
 		 641 aa  420  1e-116  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1692  DNA mismatch repair protein  41.22 
 
 		 611 aa  419  1e-116  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2634  DNA mismatch repair protein  39.75 
 
 		 641 aa  420  1e-116  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00330895  unclonable  0.0000000000120627 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3164  DNA mismatch repair protein MutL  42.97 
 
 		 615 aa  420  1e-116  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0633  DNA mismatch repair protein  41.29 
 
 		 623 aa  421  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.211888 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0570  DNA mismatch repair protein  39.81 
 
 		 648 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.963062 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0521  DNA mismatch repair protein  40.65 
 
 		 635 aa  417  9.999999999999999e-116  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0525121  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0895  DNA mismatch repair protein MutL  41.46 
 
 		 611 aa  416  9.999999999999999e-116  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.347619  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2669  DNA mismatch repair protein  38.7 
 
 		 630 aa  415  1e-114  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.680786  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4944  DNA mismatch repair protein MutL  40.26 
 
 		 645 aa  411  1e-113  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3853  DNA mismatch repair protein  39.72 
 
 		 661 aa  409  1e-113  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.558268  normal  0.998912 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0734  DNA mismatch repair protein  39.51 
 
 		 667 aa  407  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2031  DNA mismatch repair protein MutL  43.32 
 
 		 604 aa  409  1.0000000000000001e-112  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.440642  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1517  DNA mismatch repair protein MutL  42.2 
 
 		 598 aa  409  1.0000000000000001e-112  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.249931 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1157  DNA mismatch repair protein MutL  41.04 
 
 		 644 aa  405  1.0000000000000001e-112  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.299575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1144  DNA mismatch repair protein MutL  39.55 
 
 		 616 aa  407  1.0000000000000001e-112  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.513301  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3209  DNA mismatch repair protein MutL  41.61 
 
 		 660 aa  406  1.0000000000000001e-112  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.230102  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0281  DNA mismatch repair protein  39.51 
 
 		 667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65350  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 		 633 aa  405  1.0000000000000001e-112  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0765  DNA mismatch repair protein  39.51 
 
 		 667 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2769  DNA mismatch repair protein  40.47 
 
 		 652 aa  404  1e-111  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.286219  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1320  DNA mismatch repair protein  40.66 
 
 		 705 aa  405  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2485  DNA mismatch repair protein  39.15 
 
 		 691 aa  403  1e-111  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.933999  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5675  DNA mismatch repair protein  39.46 
 
 		 633 aa  405  1e-111  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3264  DNA mismatch repair protein  39.64 
 
 		 681 aa  402  1e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.815986  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2621  DNA mismatch repair protein  39.81 
 
 		 662 aa  405  1e-111  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1466  DNA mismatch repair protein MutL  41.71 
 
 		 635 aa  404  1e-111  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.643627  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2192  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 684 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2314  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 684 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1085  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 684 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3308  DNA mismatch repair protein  39.67 
 
 		 681 aa  402  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.554472  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0514  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 684 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1084  DNA mismatch repair protein MutL  39.19 
 
 		 630 aa  402  9.999999999999999e-111  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.967595  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0685  DNA mismatch repair protein  39.26 
 
 		 661 aa  400  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3297  DNA mismatch repair protein  39.49 
 
 		 684 aa  399  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.365803  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2563  DNA mismatch repair protein  40.44 
 
 		 636 aa  396  1e-109  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0845  DNA mismatch repair protein  39.1 
 
 		 574 aa  396  1e-109  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.00243998  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0494  DNA mismatch repair protein MutL  41.71 
 
 		 626 aa  395  1e-109  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.220055  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3466  DNA mismatch repair protein MutL  41.3 
 
 		 622 aa  397  1e-109  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.52693  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0660  DNA mismatch repair protein  39.26 
 
 		 661 aa  399  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1186  DNA mismatch repair protein  39.53 
 
 		 575 aa  398  1e-109  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  hitchhiker  0.00913008  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1927  mismatch repair protein MutL  39.7 
 
 		 595 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1275  DNA mismatch repair protein  40.62 
 
 		 644 aa  395  1e-108  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1599  DNA mismatch repair protein MutL  39.7 
 
 		 595 aa  394  1e-108  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.907039  normal  0.222038 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2836  DNA mismatch repair protein  39.91 
 
 		 647 aa  395  1e-108  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>