More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPC_0245 on replicon NC_007925
Organism: Rhodopseudomonas palustris BisB18



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_0802  malonyl-CoA synthase  65.92 
 
 		 510 aa  649    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.756606  normal  0.0286315 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2797  malonyl-CoA synthase  74.5 
 
 		 518 aa  764    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.676577 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0226  malonyl-CoA synthase  78.73 
 
 		 508 aa  816    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0526846  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0329  malonyl-CoA synthase  81.27 
 
 		 511 aa  811    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0245  malonyl-CoA synthase  100 
 
 		 504 aa  1022    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0395238 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7251  malonyl-CoA synthase  66.94 
 
 		 507 aa  652    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0483  malonyl-CoA synthase  82.67 
 
 		 503 aa  827    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5371  malonyl-CoA synthase  62.53 
 
 		 504 aa  636    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.132829  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3600  malonyl-CoA synthase  77.58 
 
 		 505 aa  795    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0836  malonyl-CoA synthase  65.92 
 
 		 510 aa  658    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.141452  normal  0.0577882 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0220  malonyl-CoA synthase  80.48 
 
 		 503 aa  828    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.601636  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0876  malonyl-CoA synthase  66.12 
 
 		 510 aa  658    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0768548 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6034  malonyl-CoA synthase  66.06 
 
 		 507 aa  643    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.224104  normal  0.165563 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1719  malonyl-CoA synthase  66.33 
 
 		 503 aa  674    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.982236 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5138  malonyl-CoA synthase  65 
 
 		 510 aa  662    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.809655  normal  0.695279 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0518  malonyl-CoA synthase  66.74 
 
 		 509 aa  634  1e-180  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0574  malonyl-CoA synthase  63.85 
 
 		 504 aa  623  1e-177  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1586  malonyl-CoA synthase  64.94 
 
 		 506 aa  620  1e-176  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1480  malonyl-CoA synthase  64.12 
 
 		 509 aa  619  1e-176  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000189244 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0616  malonyl-CoA synthase  63.79 
 
 		 504 aa  616  1e-175  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.562715  normal  0.268093 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3408  malonyl-CoA synthase  58.45 
 
 		 504 aa  609  1e-173  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.787784 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2999  malonyl-CoA synthase  58.88 
 
 		 506 aa  587  1e-166  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2492  malonyl-CoA synthase  57.26 
 
 		 504 aa  564  1.0000000000000001e-159  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.318474  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3566  malonyl-CoA synthase  58.87 
 
 		 503 aa  556  1e-157  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.676985  normal  0.895128 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1041  malonyl-CoA synthase  56.66 
 
 		 501 aa  553  1e-156  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.200492  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2702  malonyl-CoA synthase  55.86 
 
 		 501 aa  550  1e-155  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.0670195 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3834  malonyl-CoA synthase  53.48 
 
 		 504 aa  546  1e-154  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.610168  normal  0.151644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2771  malonyl-CoA synthase  55.62 
 
 		 536 aa  548  1e-154  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.594073  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2794  malonyl-CoA synthase  55 
 
 		 517 aa  533  1e-150  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.71549  normal  0.398408 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2790  malonyl-CoA synthase  57.02 
 
 		 512 aa  528  1e-149  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000139685  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2870  malonyl-CoA synthase  56.56 
 
 		 506 aa  531  1e-149  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.689672  normal  0.236454 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0996  malonyl-CoA synthase  55.28 
 
 		 519 aa  522  1e-147  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0648  malonyl-CoA synthase  55.58 
 
 		 517 aa  519  1e-146  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1080  malonyl-CoA synthase  55.07 
 
 		 519 aa  519  1e-146  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.261639  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0422  malonyl-CoA synthase  54.05 
 
 		 526 aa  517  1.0000000000000001e-145  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.149212  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2094  malonyl-CoA synthase  54.04 
 
 		 506 aa  514  1e-144  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0754737  normal  0.347898 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2538  malonyl-CoA synthase  53.16 
 
 		 511 aa  508  1e-143  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1293  malonyl-CoA synthase  54.72 
 
 		 510 aa  508  1e-143  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00112545 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2752  malonyl-CoA synthase  53.18 
 
 		 547 aa  507  9.999999999999999e-143  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0433908 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0770  AMP-dependent synthetase and ligase  53.59 
 
 		 501 aa  502  1e-141  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1515  malonyl-CoA synthase  52.88 
 
 		 539 aa  499  1e-140  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.624521  normal  0.177064 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1925  malonyl-CoA synthase  54.6 
 
 		 500 aa  490  1e-137  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0631  malonyl-CoA synthase  50.78 
 
 		 507 aa  491  1e-137  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1101  malonyl-CoA synthase  52.36 
 
 		 530 aa  490  1e-137  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3119  malonyl-CoA synthase  54.72 
 
 		 485 aa  470  1.0000000000000001e-131  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.646837  normal  0.278949 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0559  AMP-dependent synthetase and ligase  43.06 
 
 		 507 aa  353  2.9999999999999997e-96  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3776  AMP-dependent synthetase and ligase  41.49 
 
 		 502 aa  345  2e-93  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.597037  normal  0.34641 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3859  AMP-dependent synthetase and ligase  41.2 
 
 		 504 aa  341  2e-92  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.447607  hitchhiker  0.00632845 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1867  AMP-dependent synthetase and ligase  38.34 
 
 		 507 aa  302  9e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  35.57 
 
 		 514 aa  285  1.0000000000000001e-75  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2136  AMP-dependent synthetase and ligase  33.93 
 
 		 493 aa  282  1e-74  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1803  AMP-dependent synthetase and ligase  35.19 
 
 		 539 aa  281  3e-74  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1423  AMP-dependent synthetase and ligase  37.23 
 
 		 510 aa  279  8e-74  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2184  AMP-dependent synthetase and ligase  33.73 
 
 		 493 aa  279  9e-74  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.944129  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3040  long-chain acyl-CoA synthetase  33.06 
 
 		 518 aa  276  6e-73  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.01 
 
 		 512 aa  275  2.0000000000000002e-72  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4183  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.41 
 
 		 510 aa  274  2.0000000000000002e-72  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.341045  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0297  AMP-dependent synthetase and ligase  36.22 
 
 		 498 aa  273  5.000000000000001e-72  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.292337 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1006  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 		 510 aa  272  8.000000000000001e-72  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1330  AMP-dependent synthetase and ligase  34.3 
 
 		 502 aa  272  9e-72  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.982491 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1250  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 		 510 aa  272  1e-71  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1169  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.65 
 
 		 510 aa  271  2e-71  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1193  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1019  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1091  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 510 aa  270  5e-71  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1003  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.44 
 
 		 510 aa  270  5.9999999999999995e-71  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1123  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.23 
 
 		 510 aa  269  8e-71  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1008  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  34.23 
 
 		 510 aa  268  2e-70  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1569  long-chain fatty-acid-CoA ligase, putative  36.86 
 
 		 510 aa  267  4e-70  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.890411  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0814  AMP-dependent synthetase and ligase  36.31 
 
 		 508 aa  266  8e-70  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1581  AMP-dependent synthetase and ligase  34.52 
 
 		 518 aa  265  1e-69  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0255292  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2474  AMP-dependent synthetase and ligase  35.6 
 
 		 522 aa  263  4e-69  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3798  AMP-dependent synthetase and ligase  36.29 
 
 		 499 aa  262  1e-68  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1553  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 495 aa  261  2e-68  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.215812  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 521 aa  260  3e-68  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0840  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33 
 
 		 510 aa  260  4e-68  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  33.26 
 
 		 512 aa  259  9e-68  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2432  AMP-dependent synthetase and ligase  34.31 
 
 		 508 aa  257  3e-67  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0601  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 561 aa  256  5e-67  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3969  AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 500 aa  256  7e-67  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.130763  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0108  AMP-dependent synthetase and ligase  31.1 
 
 		 569 aa  256  7e-67  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.824706  normal  0.320607 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4653  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 561 aa  256  8e-67  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4654  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.87 
 
 		 561 aa  256  8e-67  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4634  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.87 
 
 		 582 aa  256  8e-67  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.188142  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4261  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 563 aa  255  1.0000000000000001e-66  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0503  AMP-dependent synthetase and ligase  35.16 
 
 		 492 aa  255  1.0000000000000001e-66  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  33.4 
 
 		 559 aa  255  1.0000000000000001e-66  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.0495218 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4335  AMP-dependent synthetase and ligase  34.65 
 
 		 521 aa  255  1.0000000000000001e-66  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.153441  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2335  AMP-dependent synthetase and ligase  37.96 
 
 		 509 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4238  AMP-dependent synthetase and ligase  33.53 
 
 		 527 aa  255  2.0000000000000002e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0667  putative O-succinylbenzoate--CoA ligase  34.27 
 
 		 516 aa  254  2.0000000000000002e-66  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.604577  normal  0.0579833 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4273  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.74 
 
 		 563 aa  254  3e-66  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4072  AMP-dependent synthetase and ligase  34.62 
 
 		 508 aa  254  3e-66  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.979079 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1775  AMP-dependent synthetase and ligase  35.03 
 
 		 525 aa  253  7e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  33.19 
 
 		 662 aa  253  8.000000000000001e-66  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1592  AMP-dependent synthetase and ligase  33.21 
 
 		 561 aa  253  8.000000000000001e-66  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.185317  normal  0.745369 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4354  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.88 
 
 		 561 aa  252  1e-65  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.180837  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1062  AMP-dependent synthetase and ligase  35.61 
 
 		 490 aa  251  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0978563  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003081  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  33.4 
 
 		 513 aa  251  2e-65  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000326821  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3226  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  32.28 
 
 		 561 aa  251  3e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>