More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_4121 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_4121  peptidase C56, PfpI  100 
 
 		 187 aa  377  1e-104  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3967  peptidase C56, PfpI  94.65 
 
 		 187 aa  362  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.578899  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1491  intracellular protease, PfpI family  93.58 
 
 		 187 aa  357  6e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.959016  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0982  peptidase C56, PfpI  86.1 
 
 		 187 aa  333  9e-91  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000702113 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4318  putative intracellular proteinase  74.86 
 
 		 186 aa  286  2e-76  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.176373  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1484  PfpI family intracellular peptidase  71.58 
 
 		 186 aa  277  7e-74  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1867  peptidase C56, PfpI  65.22 
 
 		 186 aa  260  1e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.138304  normal  0.0351864 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5496  PfpI family intracellular peptidase  62.84 
 
 		 190 aa  243  9.999999999999999e-64  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0167613 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1815  intracellular protease, PfpI family  62.84 
 
 		 190 aa  240  7e-63  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0808  intracellular protease, PfpI family  59.67 
 
 		 192 aa  231  5e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.606982  normal  0.0946842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0842  intracellular protease, PfpI family  59.67 
 
 		 192 aa  230  8.000000000000001e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.244965  hitchhiker  0.00871644 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0882  PfpI family intracellular peptidase  59.12 
 
 		 192 aa  228  4e-59  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.131592 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1130  proteinase  57.07 
 
 		 186 aa  224  4e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5375  PfpI family intracellular peptidase  59.12 
 
 		 192 aa  224  4e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.130352 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10413  proteinase  56.35 
 
 		 193 aa  217  7.999999999999999e-56  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0124  intracellular protease  56.98 
 
 		 194 aa  213  1.9999999999999998e-54  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2955  peptidase C56, PfpI  52.94 
 
 		 204 aa  213  1.9999999999999998e-54  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6345  intracellular protease, PfpI family  53.8 
 
 		 189 aa  212  2.9999999999999995e-54  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0737  intracellular protease, PfpI family  53.3 
 
 		 183 aa  207  1e-52  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.102746  hitchhiker  0.0000000174908 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0832  PfpI family intracellular peptidase  51.63 
 
 		 186 aa  204  7e-52  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0605417  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3430  PfpI family intracellular peptidase  56.11 
 
 		 181 aa  202  2e-51  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4290  PfpI family intracellular peptidase  52.81 
 
 		 182 aa  201  4e-51  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.266968  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0175  intracellular protease, PfpI family  50.54 
 
 		 197 aa  201  6e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_16340  intracellular protease, PfpI family  50.27 
 
 		 194 aa  191  6e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3488  PfpI family intracellular peptidase  47.31 
 
 		 188 aa  189  1e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4470  intracellular protease, PfpI family  47.57 
 
 		 189 aa  190  1e-47  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0863  peptidase C56, PfpI  46.99 
 
 		 188 aa  184  5e-46  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.398004 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00918  protease  52.57 
 
 		 183 aa  182  2.0000000000000003e-45  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4592  intracellular protease, PfpI family  50.85 
 
 		 189 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_34380  intracellular protease, PfpI family  46.81 
 
 		 190 aa  182  3e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2626  intracellular protease, PfpI family  46.7 
 
 		 187 aa  181  6e-45  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.516663 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5013  intracellular protease, PfpI family  50 
 
 		 191 aa  180  1e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0325  intracellular protease, PfpI family  46.41 
 
 		 188 aa  179  2e-44  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4193  PfpI family intracellular peptidase  46.11 
 
 		 187 aa  177  7e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.497147 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4763  peptidase C56, PfpI  47.46 
 
 		 179 aa  176  2e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0825927 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5353  peptidase C56, PfpI  48.59 
 
 		 179 aa  175  3e-43  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.500077  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_6331  intracellular protease, PfpI family  49.12 
 
 		 185 aa  176  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.219565  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2045  peptidase C56, PfpI  41.71 
 
 		 190 aa  172  3.9999999999999995e-42  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2970  intracellular protease, PfpI family  46.86 
 
 		 179 aa  170  1e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2725  protease PfpI  46.89 
 
 		 180 aa  169  2e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3029  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 179 aa  169  3e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2316  peptidase C56, PfpI  44.51 
 
 		 189 aa  166  2e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.345415  normal  0.131798 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1341  peptidase C56, PfpI  46.89 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.927736  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6078  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.87309  normal  0.0714327 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5605  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.77662 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6488  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  166  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.00430028  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2013  intracellular protease, PfpI family  44.94 
 
 		 181 aa  166  2e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2603  PfpI family intracellular peptidase  45.76 
 
 		 180 aa  165  2.9999999999999998e-40  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.241839 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6335  PfpI family intracellular peptidase  46.89 
 
 		 182 aa  165  2.9999999999999998e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.31961  normal  0.116394 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2218  intracellular protease, PfpI family  44.83 
 
 		 186 aa  164  5.9999999999999996e-40  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.554266  normal  0.164233 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3012  PfpI family intracellular peptidase  45.76 
 
 		 179 aa  162  3e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.880979 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2987  PfpI family intracellular peptidase  44.63 
 
 		 180 aa  161  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.34235 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5481  PfpI family intracellular peptidase  48 
 
 		 189 aa  161  5.0000000000000005e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.892859  hitchhiker  0.00158499 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1901  intracellular protease, PfpI family  44.13 
 
 		 177 aa  160  9e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.656041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0320  intracellular protease, PfpI family  44.02 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2570  protease I  45.45 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5287  PfpI family intracellular peptidase  43.24 
 
 		 189 aa  159  2e-38  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17170  intracellular protease, PfpI family  45.98 
 
 		 197 aa  158  3e-38  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.816249  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_31560  intracellular protease, PfpI family  45.11 
 
 		 184 aa  159  3e-38  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.568268  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1953  PfpI family intracellular peptidase  44.15 
 
 		 189 aa  156  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.923866  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2863  intracellular protease, PfpI family  44.26 
 
 		 192 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000125689  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1228  PfpI family intracellular peptidase  44.92 
 
 		 189 aa  157  1e-37  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1178  peptidase C56, PfpI  43.82 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.285648  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6094  PfpI family intracellular peptidase  42.7 
 
 		 189 aa  156  2e-37  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0104  intracellular protease, PfpI family  43.58 
 
 		 182 aa  155  2e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5442  intracellular protease, PfpI family  43.85 
 
 		 183 aa  154  6e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.484256 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09940  putative protease  46.24 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.253725  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2032  intracellular protease, PfpI family  43.93 
 
 		 245 aa  154  6e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0922  putative protease  46.74 
 
 		 187 aa  154  6e-37  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.644454  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2912  PfpI family intracellular peptidase  42.46 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.367289  normal  0.283246 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2882  peptidase C56, PfpI  42.46 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.348106  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0815  PfpI family intracellular peptidase  45.51 
 
 		 189 aa  154  7e-37  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.119747 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2926  PfpI family intracellular peptidase  42.46 
 
 		 185 aa  154  7e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0228  intracellular protease, PfpI family  43.58 
 
 		 185 aa  153  1e-36  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1595  PfpI family intracellular peptidase  41.44 
 
 		 199 aa  152  4e-36  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5298  PfpI family intracellular peptidase  43.09 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.145288  normal  0.0507605 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1164  peptidase C56, PfpI  43.5 
 
 		 183 aa  150  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.314191 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4608  intracellular protease, PfpI family  42.31 
 
 		 189 aa  149  2e-35  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.483982  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4698  intracellular protease PfpI family  41.21 
 
 		 183 aa  149  3e-35  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3041  peptidase C56, PfpI  46.02 
 
 		 188 aa  149  3e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.162458  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3139  intracellular protease, PfpI family  45.45 
 
 		 188 aa  148  5e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3240  intracellular protease, PfpI family  45.45 
 
 		 188 aa  147  7e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0097  intracellular protease, PfpI family  41.57 
 
 		 182 aa  147  8e-35  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.62753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04650  protease PfpI  44 
 
 		 179 aa  145  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1981  intracellular protease, PfpI family  41.67 
 
 		 187 aa  145  3e-34  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0448  protease PfpI  43.43 
 
 		 179 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.493617  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1574  intracellular protease, PfpI family  40.78 
 
 		 241 aa  145  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_03390  Peptidase C56, PfpI  42.25 
 
 		 186 aa  144  6e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0217955  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1035  PfpI family intracellular peptidase  43.18 
 
 		 182 aa  144  6e-34  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6630  intracellular protease, PfpI family  39.31 
 
 		 184 aa  144  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.0685678 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1647  PfpI family intracellular peptidase  44.32 
 
 		 186 aa  144  1e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.920714 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1895  PfpI family intracellular peptidase  41.07 
 
 		 204 aa  143  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.719694 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3942  intracellular protease, PFpI family protein, putative  42.6 
 
 		 181 aa  142  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0375575  hitchhiker  0.00892297 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2033  intracellular protease, PfpI family  43.86 
 
 		 173 aa  142  3e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5796  PfpI family intracellular peptidase  41.34 
 
 		 185 aa  142  4e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1377  PfpI family intracellular peptidase  42.11 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.867663  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_09620  intracellular protease, PfpI family  41.81 
 
 		 193 aa  140  9.999999999999999e-33  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.0277883  normal  0.149704 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4125  intracellular protease, PfpI family  41.11 
 
 		 188 aa  140  9.999999999999999e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1234  PfpI family intracellular peptidase  45.09 
 
 		 204 aa  137  7e-32  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.845868  normal  0.190802 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0077  peptidase C56, PfpI  42.26 
 
 		 174 aa  137  7.999999999999999e-32  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0445898  normal  0.845154 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>