173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0734 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0734  hypothetical protein  100 
 
 		 147 aa  303  6e-82  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  93.88 
 
 		 230 aa  285  2e-76  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  74.48 
 
 		 229 aa  230  6e-60  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  62.76 
 
 		 242 aa  205  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  58.62 
 
 		 239 aa  193  6e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  65.96 
 
 		 229 aa  191  2e-48  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2706  hypothetical protein  48.61 
 
 		 222 aa  142  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.973697  normal  0.320226 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1715  protein of unknown function DUF159  47.92 
 
 		 222 aa  140  6e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.286255  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2167  hypothetical protein  47.92 
 
 		 223 aa  140  8e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1250  hypothetical protein  47.22 
 
 		 222 aa  138  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.336895  normal  0.442169 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1061  hypothetical protein  47.22 
 
 		 223 aa  138  3e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000115986  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1708  hypothetical protein  47.92 
 
 		 223 aa  137  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.0871629 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  46.53 
 
 		 223 aa  132  9.999999999999999e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  44.52 
 
 		 237 aa  130  5e-30  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2433  hypothetical protein  47.55 
 
 		 230 aa  128  3e-29  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2746  hypothetical protein  45.45 
 
 		 221 aa  126  9.000000000000001e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2941  hypothetical protein  45.45 
 
 		 261 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.0433222  normal  0.391333 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2834  hypothetical protein  46.85 
 
 		 229 aa  123  7e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.263955  normal  0.106264 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3296  hypothetical protein  43.06 
 
 		 226 aa  118  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1349  hypothetical protein  38.85 
 
 		 240 aa  114  5e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.307474 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2778  protein of unknown function DUF159  37.97 
 
 		 240 aa  111  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1095  hypothetical protein  47.62 
 
 		 208 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1129  hypothetical protein  47.62 
 
 		 208 aa  98.2  4e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  38.1 
 
 		 239 aa  88.6  2e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  37.5 
 
 		 226 aa  85.1  3e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  37.78 
 
 		 243 aa  84  7e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  37.31 
 
 		 222 aa  80.9  0.000000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  32.91 
 
 		 281 aa  79.7  0.00000000000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  33.11 
 
 		 274 aa  77.4  0.00000000000006  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  34.33 
 
 		 259 aa  75.5  0.0000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  35.95 
 
 		 253 aa  75.1  0.0000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  35.71 
 
 		 248 aa  74.7  0.0000000000004  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0567  protein of unknown function DUF159  32.19 
 
 		 223 aa  74.3  0.0000000000006  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  33.12 
 
 		 253 aa  73.9  0.0000000000007  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  31.03 
 
 		 226 aa  72.4  0.000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  35.07 
 
 		 257 aa  72  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  35.29 
 
 		 259 aa  71.6  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  33.57 
 
 		 224 aa  72  0.000000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  32.45 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  34.51 
 
 		 256 aa  71.6  0.000000000004  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  34.03 
 
 		 257 aa  71.2  0.000000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  32.58 
 
 		 232 aa  70.9  0.000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  33.56 
 
 		 261 aa  71.2  0.000000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  35.25 
 
 		 253 aa  70.9  0.000000000005  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1019  protein of unknown function DUF159  31.69 
 
 		 254 aa  70.9  0.000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.100486  normal  0.338541 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  34.07 
 
 		 242 aa  70.5  0.000000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  31.51 
 
 		 234 aa  68.6  0.00000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  30.77 
 
 		 233 aa  68.6  0.00000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  33.12 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  33.12 
 
 		 266 aa  68.2  0.00000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  33.81 
 
 		 252 aa  67.8  0.00000000004  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  33.12 
 
 		 261 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  33.33 
 
 		 252 aa  68.2  0.00000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  32.89 
 
 		 268 aa  67.8  0.00000000005  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1171  protein of unknown function DUF159  31.69 
 
 		 254 aa  67.4  0.00000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  30.66 
 
 		 231 aa  67.4  0.00000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2605  hypothetical protein  28.97 
 
 		 229 aa  67.4  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  31.72 
 
 		 221 aa  67.4  0.00000000007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1263  hypothetical protein  28.97 
 
 		 229 aa  67  0.00000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.94208 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  29.63 
 
 		 252 aa  66.6  0.00000000009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4193  protein of unknown function DUF159  35.66 
 
 		 248 aa  66.2  0.0000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.772557  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  29.73 
 
 		 238 aa  66.6  0.0000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1749  hypothetical protein  31.03 
 
 		 194 aa  66.6  0.0000000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  28.06 
 
 		 222 aa  65.5  0.0000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  32.14 
 
 		 231 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  32.21 
 
 		 268 aa  65.9  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  28.37 
 
 		 223 aa  65.1  0.0000000003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1918  hypothetical protein  29.25 
 
 		 229 aa  65.1  0.0000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.78991 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  29.86 
 
 		 217 aa  64.7  0.0000000004  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  29.86 
 
 		 254 aa  64.3  0.0000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.95 
 
 		 248 aa  63.5  0.0000000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  34.82 
 
 		 206 aa  63.2  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0673  hypothetical protein  31.21 
 
 		 259 aa  62.8  0.000000001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.834531  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4684  protein of unknown function DUF159  31.03 
 
 		 243 aa  62.4  0.000000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.945433  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  31.47 
 
 		 250 aa  62.4  0.000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  33.11 
 
 		 225 aa  62.8  0.000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  30 
 
 		 221 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  32.68 
 
 		 233 aa  62  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  28.03 
 
 		 285 aa  61.2  0.000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  28.85 
 
 		 253 aa  61.2  0.000000005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  29.22 
 
 		 237 aa  61.2  0.000000005  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0386  hypothetical protein  31.91 
 
 		 207 aa  60.8  0.000000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.782275  normal  0.223625 
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  29.66 
 
 		 236 aa  61.2  0.000000005  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009046  PICST_48297  hypothetical protein  29.75 
 
 		 305 aa  60.8  0.000000006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.117145 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  33.58 
 
 		 234 aa  60.8  0.000000006  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4315  hypothetical protein  30.34 
 
 		 255 aa  60.8  0.000000006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.182894  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  32.67 
 
 		 253 aa  60.5  0.000000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1923  protein of unknown function DUF159  30.56 
 
 		 226 aa  60.5  0.000000007  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.630522 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  34.06 
 
 		 262 aa  60.5  0.000000008  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  26.12 
 
 		 240 aa  60.5  0.000000008  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  27.08 
 
 		 240 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  30.94 
 
 		 238 aa  60.1  0.000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  30.46 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2115  protein of unknown function DUF159  29.45 
 
 		 213 aa  59.7  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  30.07 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  29.58 
 
 		 251 aa  60.1  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3924  hypothetical protein  31.63 
 
 		 220 aa  59.7  0.00000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0405964  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  29.8 
 
 		 247 aa  58.9  0.00000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  30.5 
 
 		 236 aa  58.9  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1107  protein of unknown function DUF159  33.01 
 
 		 191 aa  58.9  0.00000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.485434  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>