185 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PICST_48297 on replicon NC_009046
Organism: Scheffersomyces stipitis CBS 6054



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009046  PICST_48297  hypothetical protein  100 
 
 
305 aa  628  1e-179  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.117145 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_04161  DUF159 domain protein (AFU_orthologue; AFUA_4G13150)  33.47 
 
 
388 aa  124  2e-27  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0736847  normal  0.55935 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1737  hypothetical protein  27.87 
 
 
222 aa  93.6  4e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0536  hypothetical protein  27.31 
 
 
250 aa  90.5  4e-17  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.932733  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0049  hypothetical protein  27.95 
 
 
232 aa  89  1e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.435898  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1305  hypothetical protein  26.64 
 
 
217 aa  89  1e-16  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1866  hypothetical protein  32.79 
 
 
222 aa  88.2  2e-16  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0971626  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4325  hypothetical protein  27.5 
 
 
257 aa  87  4e-16  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.250305 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2926  hypothetical protein  26.36 
 
 
253 aa  85.9  8e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_4011  hypothetical protein  29.7 
 
 
254 aa  84.7  0.000000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1772  hypothetical protein  29.44 
 
 
252 aa  83.6  0.000000000000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.290966  normal  0.767063 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1903  protein of unknown function DUF159  28.74 
 
 
252 aa  84  0.000000000000003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4098  hypothetical protein  25 
 
 
239 aa  84  0.000000000000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00942019 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2698  hypothetical protein  29.85 
 
 
255 aa  83.2  0.000000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.107504  normal  0.966546 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1044  protein of unknown function DUF159  27.55 
 
 
251 aa  83.2  0.000000000000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2049  protein of unknown function DUF159  29.75 
 
 
247 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000012263 
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2361  protein of unknown function DUF159  29.07 
 
 
226 aa  81.6  0.00000000000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_25410  hypothetical protein  27.94 
 
 
261 aa  81.6  0.00000000000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0698226  normal  0.491918 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1130  hypothetical protein  29.95 
 
 
259 aa  80.1  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0207355  normal  0.486659 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1393  protein of unknown function DUF159  25.62 
 
 
262 aa  80.1  0.00000000000004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.12322  normal  0.0795799 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2820  protein of unknown function DUF159  26.14 
 
 
256 aa  80.1  0.00000000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.107889  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1704  hypothetical protein  25.28 
 
 
253 aa  79.7  0.00000000000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0118518  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2394  protein of unknown function DUF159  29.58 
 
 
221 aa  79.7  0.00000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.19161e-31 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3892  hypothetical protein  28.15 
 
 
233 aa  78.6  0.0000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1994  hypothetical protein  27.31 
 
 
224 aa  79  0.0000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2323  hypothetical protein  28.87 
 
 
248 aa  78.6  0.0000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.059756  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3948  hypothetical protein  27.27 
 
 
231 aa  78.6  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1457  hypothetical protein  27.05 
 
 
219 aa  78.6  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00000398604  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0601  protein of unknown function DUF159  27.31 
 
 
234 aa  78.2  0.0000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0208739  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1971  protein of unknown function DUF159  26.48 
 
 
233 aa  77.8  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.442457 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1054  hypothetical protein  26.94 
 
 
231 aa  78.2  0.0000000000002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7889  protein of unknown function DUF159  27.73 
 
 
253 aa  78.2  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.332914  normal  0.451082 
 
 
-
 
NC_008538  Arth_4324  hypothetical protein  26.98 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2344  protein of unknown function DUF159  26.99 
 
 
226 aa  77.4  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.670421  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1363  hypothetical protein  25.61 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.809012  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1381  hypothetical protein  25.61 
 
 
266 aa  76.3  0.0000000000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011667  Tmz1t_2360  protein of unknown function DUF159  26.77 
 
 
222 aa  76.3  0.0000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.680503  hitchhiker  0.0000951308 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6295  protein of unknown function DUF159  25.69 
 
 
253 aa  75.9  0.0000000000008  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1397  hypothetical protein  25.2 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0881488  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1245  hypothetical protein  29.44 
 
 
259 aa  75.1  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4694  hypothetical protein  28.92 
 
 
268 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.601869  normal  0.0756375 
 
 
-
 
NC_013531  Xcel_3478  protein of unknown function DUF159  30 
 
 
236 aa  74.7  0.000000000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1328  protein of unknown function DUF159  29.18 
 
 
224 aa  74.3  0.000000000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_16700  hypothetical protein  25.89 
 
 
237 aa  74.3  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5191  hypothetical protein  28.51 
 
 
239 aa  73.9  0.000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.786619  normal  0.272593 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18820  hypothetical protein  27.19 
 
 
274 aa  73.9  0.000000000003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1384  protein of unknown function DUF159  24.7 
 
 
234 aa  73.9  0.000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.243083  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13255  hypothetical protein  25.41 
 
 
252 aa  73.9  0.000000000003  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.837677  normal  0.703311 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30760  hypothetical protein  26.03 
 
 
268 aa  73.9  0.000000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0442356  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3711  protein of unknown function DUF159  24.49 
 
 
261 aa  73.6  0.000000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.750809  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1100  protein of unknown function DUF159  26.95 
 
 
254 aa  73.2  0.000000000005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3891  hypothetical protein  26.96 
 
 
235 aa  73.2  0.000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.356516  normal  0.457869 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_28660  hypothetical protein  25.42 
 
 
237 aa  73.2  0.000000000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1339  protein of unknown function DUF159  24.02 
 
 
234 aa  73.2  0.000000000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.455204  normal  0.858262 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0284  protein of unknown function DUF159  25.51 
 
 
243 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.69379  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8327  hypothetical protein  25.93 
 
 
253 aa  72  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1263  protein of unknown function DUF159  27.27 
 
 
257 aa  72  0.00000000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.805714  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0985  hypothetical protein  26.58 
 
 
227 aa  71.2  0.00000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3527  protein of unknown function DUF159  26.02 
 
 
255 aa  71.2  0.00000000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2142  hypothetical protein  25.86 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000002  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0312675 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20440  hypothetical protein  31.95 
 
 
248 aa  71.6  0.00000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  decreased coverage  0.00702652  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1248  hypothetical protein  26.75 
 
 
226 aa  70.5  0.00000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.61122  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0189  hypothetical protein  27.5 
 
 
238 aa  70.5  0.00000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4181  protein of unknown function DUF159  26.6 
 
 
231 aa  70.9  0.00000000003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_14680  hypothetical protein  26.73 
 
 
281 aa  70.5  0.00000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.29654  normal  0.170747 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3028  protein of unknown function DUF159  23.35 
 
 
237 aa  69.7  0.00000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2471  hypothetical protein  25.14 
 
 
252 aa  69.7  0.00000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00656423 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2380  protein of unknown function DUF159  22.22 
 
 
233 aa  69.3  0.00000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000423794  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3717  hypothetical protein  25.44 
 
 
242 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1254  hypothetical protein  27.27 
 
 
338 aa  68.6  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0999798 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2203  protein of unknown function DUF159  23.81 
 
 
240 aa  68.6  0.0000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.690835 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2330  protein of unknown function DUF159  29.19 
 
 
227 aa  68.2  0.0000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0040  hypothetical protein  27.08 
 
 
223 aa  67.8  0.0000000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0767  hypothetical protein  24.9 
 
 
244 aa  68.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.573199 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0489  hypothetical protein  26.09 
 
 
222 aa  67.4  0.0000000003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1024  protein of unknown function DUF159  27.5 
 
 
253 aa  67.4  0.0000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.458547  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3110  hypothetical protein  28.8 
 
 
240 aa  67.4  0.0000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.11099  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2952  hypothetical protein  23.83 
 
 
242 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.916913  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1531  hypothetical protein  24.89 
 
 
225 aa  67  0.0000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2559  protein of unknown function DUF159  26.15 
 
 
221 aa  67  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0964  hypothetical protein  25.1 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2013  protein of unknown function DUF159  31.3 
 
 
206 aa  65.5  0.000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3538  hypothetical protein  24.56 
 
 
236 aa  65.5  0.000000001  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2747  hypothetical protein  24.57 
 
 
239 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0840  protein of unknown function DUF159  24.47 
 
 
238 aa  64.3  0.000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0715  hypothetical protein  25 
 
 
223 aa  63.5  0.000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.0740905 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2685  hypothetical protein  25.1 
 
 
221 aa  63.5  0.000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.378433  hitchhiker  0.0016423 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1581  protein of unknown function DUF159  26.34 
 
 
247 aa  63.5  0.000000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0117565  normal  0.0972934 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1423  hypothetical protein  24.89 
 
 
230 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.918741 
 
 
-
 
NC_011673  PHATRDRAFT_44809  predicted protein  27.4 
 
 
385 aa  62.8  0.000000006  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0853  protein of unknown function DUF159  23.79 
 
 
270 aa  62.8  0.000000008  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  decreased coverage  0.000000182403  normal 
 
 
-
 
NC_006366  plpl0057  hypothetical protein  24.24 
 
 
222 aa  61.6  0.00000001  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0546  hypothetical protein  24.22 
 
 
285 aa  62  0.00000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1467  hypothetical protein  22.96 
 
 
251 aa  61.6  0.00000001  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1080  protein of unknown function DUF159  28.86 
 
 
222 aa  62  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000409345  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2201  hypothetical protein  26.44 
 
 
337 aa  62.4  0.00000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0851  protein of unknown function DUF159  28.8 
 
 
221 aa  62  0.00000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00651427  normal  0.246274 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3273  protein of unknown function DUF159  26.92 
 
 
248 aa  62  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1711  hypothetical protein  24.78 
 
 
229 aa  62  0.00000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.501792  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2763  hypothetical protein  25 
 
 
229 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.607414  normal  0.0250851 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>