143 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1877 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007492  Pfl01_2377  protein tyrosine/serine phosphatase  77.08 
 
 		 636 aa  984    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188756 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1877  protein tyrosine/serine phosphatase  100 
 
 		 637 aa  1270    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.880378 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3617  autotransporter beta-domain-containing protein  43.89 
 
 		 671 aa  449  1e-125  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3997  protein tyrosine/serine phosphatase  49 
 
 		 277 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0144957 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_24360  hypothetical protein  35.32 
 
 		 974 aa  200  7.999999999999999e-50  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.861832  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2063  autotransporter beta-domain-containing protein  37.37 
 
 		 954 aa  199  9e-50  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.217829  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3587  protein tyrosine/serine phosphatase  43.36 
 
 		 316 aa  199  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0217752  hitchhiker  0.00000929077 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0371  protein tyrosine/serine phosphatase  45.1 
 
 		 299 aa  192  1e-47  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2785  protein tyrosine/serine phosphatase  42.16 
 
 		 321 aa  191  2.9999999999999997e-47  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4624  protein tyrosine/serine phosphatase  40.16 
 
 		 292 aa  177  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.81745  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2362  protein tyrosine/serine phosphatase  40.33 
 
 		 244 aa  176  9.999999999999999e-43  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.35654  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4542  putative tyrosine protein phosphatase  41.22 
 
 		 265 aa  170  8e-41  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3082  protein tyrosine/serine phosphatase  38.74 
 
 		 295 aa  167  5e-40  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3316  protein tyrosine/serine phosphatase  36.72 
 
 		 265 aa  140  7.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.367248  normal  0.978331 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0804  protein tyrosine/serine phosphatase  36.23 
 
 		 275 aa  137  4e-31  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.808367  normal  0.36802 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3159  protein tyrosine/serine phosphatase  37.08 
 
 		 302 aa  135  1.9999999999999998e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.0124414 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0543  protein tyrosine/serine phosphatase  34.1 
 
 		 306 aa  126  1e-27  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0718  protein tyrosine/serine phosphatase  33.46 
 
 		 269 aa  125  3e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4857  protein tyrosine/serine phosphatase  31.66 
 
 		 266 aa  124  4e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.999319  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4923  protein tyrosine/serine phosphatase  34.51 
 
 		 345 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3362  protein tyrosine/serine phosphatase  34.87 
 
 		 265 aa  123  9.999999999999999e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00258596 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0885  protein tyrosine/serine phosphatase  38.49 
 
 		 275 aa  120  6e-26  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.772986 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0719  protein tyrosine/serine phosphatase  33.71 
 
 		 270 aa  117  1.0000000000000001e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1528  protein tyrosine/serine phosphatase  34.48 
 
 		 273 aa  115  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.567616 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2183  Protein tyrosine/serine phosphatase-like protein  32.79 
 
 		 280 aa  114  5e-24  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.663845  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_27240  protein tyrosine/serine phosphatase  32.16 
 
 		 269 aa  112  1.0000000000000001e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3134  hypothetical protein  35.59 
 
 		 265 aa  110  8.000000000000001e-23  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.93159  normal  1 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1578  protein tyrosine/serine phosphatase  32.94 
 
 		 260 aa  108  2e-22  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0548  protein tyrosine/serine phosphatase  33.71 
 
 		 344 aa  108  2e-22  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1779  protein tyrosine/serine phosphatase  32.79 
 
 		 260 aa  105  3e-21  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4511  protein tyrosine/serine phosphatase  36.1 
 
 		 250 aa  103  1e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.271075  normal  0.539759 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3861  protein tyrosine/serine phosphatase  34.92 
 
 		 274 aa  101  5e-20  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.464823  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2360  protein tyrosine/serine phosphatase  32.48 
 
 		 250 aa  99.8  1e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.388249 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3890  protein tyrosine/serine phosphatase  34.32 
 
 		 250 aa  100  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.990954 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4313  protein tyrosine/serine phosphatase  32.19 
 
 		 247 aa  99  2e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.640067 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3163  protein tyrosine/serine phosphatase  34.75 
 
 		 264 aa  99.4  2e-19  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2208  hypothetical protein  28.12 
 
 		 332 aa  97.4  7e-19  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.797475  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3073  protein tyrosine/serine phosphatase  28.8 
 
 		 342 aa  97.1  9e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.810774  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3371  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.69 
 
 		 340 aa  97.1  9e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.004022  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4203  protein tyrosine/serine phosphatase  32.93 
 
 		 257 aa  96.3  1e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.537851  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3134  protein-tyrosine-phosphatase  28.69 
 
 		 340 aa  95.9  2e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.809037  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0097  protein tyrosine/serine phosphatase  31.23 
 
 		 266 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0106  protein tyrosine/serine phosphatase  31.23 
 
 		 266 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.32864 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0087  protein tyrosine/serine phosphatase  31.23 
 
 		 266 aa  95.9  2e-18  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.356676 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0646  protein tyrosine/serine phosphatase  27.27 
 
 		 316 aa  95.5  2e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.821476  normal  0.141742 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3383  protein tyrosine/serine phosphatase  32.03 
 
 		 250 aa  95.5  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000524951  hitchhiker  0.000566628 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1731  protein tyrosine phosphatase  30.65 
 
 		 264 aa  95.1  3e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0698  protein tyrosine/serine phosphatase  29.52 
 
 		 306 aa  94.7  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.456776  normal  0.0702791 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3369  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.29 
 
 		 340 aa  94.4  6e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3147  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.29 
 
 		 340 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.761513  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3394  protein-tyrosine phosphatase-like protein  28.29 
 
 		 340 aa  93.6  9e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3041  protein-tyrosine-phosphatase  27.49 
 
 		 340 aa  92.4  2e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0553  protein tyrosine/serine phosphatase  29.81 
 
 		 254 aa  92.8  2e-17  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.371687  normal  0.150838 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2126  protein tyrosine/serine phosphatase  29.44 
 
 		 339 aa  92.4  2e-17  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4351  protein tyrosine/serine phosphatase  28.84 
 
 		 260 aa  92.4  2e-17  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_23060  protein tyrosine/serine phosphatase  29.63 
 
 		 354 aa  92  3e-17  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.463058  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4066  protein tyrosine/serine phosphatase  28.84 
 
 		 260 aa  90.5  8e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1747  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 		 267 aa  89  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000126573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0115  protein tyrosine/serine phosphatase  30.63 
 
 		 266 aa  89.4  2e-16  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0245  protein tyrosine/serine phosphatase  30.56 
 
 		 260 aa  88.6  3e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0576613 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_02130  protein tyrosine/serine phosphatase  29.2 
 
 		 256 aa  88.2  4e-16  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.393393  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0136  protein tyrosine/serine phosphatase  29.89 
 
 		 295 aa  88.2  4e-16  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0624  protein tyrosine/serine phosphatase  32.88 
 
 		 276 aa  87.4  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1919  hypothetical protein  26.45 
 
 		 319 aa  87.4  7e-16  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0332  protein tyrosine/serine phosphatase  28.74 
 
 		 263 aa  87.4  7e-16  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.43096  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1882  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.87 
 
 		 339 aa  87.4  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3365  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.87 
 
 		 340 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.788719  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2344  protein tyrosine/serine phosphatase  29.73 
 
 		 262 aa  86.3  0.000000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4624  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 		 349 aa  86.3  0.000000000000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.713169  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0561  protein tyrosine/serine phosphatase  30.51 
 
 		 279 aa  85.9  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2661  protein tyrosine/serine phosphatase  31.5 
 
 		 249 aa  85.9  0.000000000000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00000022841  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0660  protein tyrosine/serine phosphatase  30.95 
 
 		 253 aa  86.3  0.000000000000002  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.107087  hitchhiker  0.00669457 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3931  protein tyrosine/serine phosphatase  29.06 
 
 		 260 aa  86.3  0.000000000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3348  protein-tyrosine phosphatase-like protein  27.87 
 
 		 339 aa  85.9  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0735  protein tyrosine/serine phosphatase  29.32 
 
 		 266 aa  85.5  0.000000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.385908  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4145  protein tyrosine/serine phosphatase  28.62 
 
 		 269 aa  85.1  0.000000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.377709  normal  0.195824 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3645  hypothetical protein  27.13 
 
 		 274 aa  84.3  0.000000000000006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1239  protein tyrosine/serine phosphatase  29.96 
 
 		 261 aa  83.6  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.030043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3949  protein tyrosine/serine phosphatase  26.62 
 
 		 281 aa  82.4  0.00000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2109  protein tyrosine/serine phosphatase  30.04 
 
 		 298 aa  82.8  0.00000000000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.636738  normal  0.361776 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0714  autotransporter, putative  27.37 
 
 		 763 aa  81.6  0.00000000000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10154  phosphotyrosine protein phosphatase ptpb  29.23 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_24750  protein tyrosine/serine phosphatase  29.5 
 
 		 315 aa  80.9  0.00000000000007  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0606708  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0188  protein tyrosine/serine phosphatase  28 
 
 		 260 aa  80.5  0.00000000000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0267  hypothetical protein  25.64 
 
 		 289 aa  79.3  0.0000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0620  Outer membrane autotransporter barrel  29.01 
 
 		 759 aa  79  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.553237 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1781  protein tyrosine/serine phosphatase  25.3 
 
 		 258 aa  79  0.0000000000003  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000745544 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0127  protein tyrosine/serine phosphatase  28.4 
 
 		 267 aa  77.8  0.0000000000006  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.000000401238  hitchhiker  0.000000000048511 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0410  protein tyrosine/serine phosphatase  28.73 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000007  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.93291 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2291  protein tyrosine/serine phosphatase  28.97 
 
 		 247 aa  76.6  0.000000000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3678  protein tyrosine/serine phosphatase  27.98 
 
 		 238 aa  76.3  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0733676  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1268  protein tyrosine/serine phosphatase  32.95 
 
 		 251 aa  73.6  0.00000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.322481  normal  0.321151 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_10864  conserved hypothetical protein  27.06 
 
 		 289 aa  72.4  0.00000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2330  protein tyrosine/serine phosphatase  35.58 
 
 		 233 aa  70.9  0.00000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0950011  normal  0.396609 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0027  protein tyrosine/serine phosphatase  25.61 
 
 		 246 aa  70.5  0.00000000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1050  protein tyrosine/serine phosphatase  29.17 
 
 		 262 aa  70.5  0.00000000009  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.0000000542198  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1131  protein tyrosine/serine phosphatase  27.69 
 
 		 260 aa  68.6  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000123663 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1689  protein tyrosine/serine phosphatase  27.71 
 
 		 279 aa  65.9  0.000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0673  protein tyrosine/serine phosphatase  26.1 
 
 		 240 aa  64.3  0.000000007  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00206907  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2202  protein tyrosine/serine phosphatase  29.84 
 
 		 243 aa  63.9  0.000000009  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.534636  normal  0.21358 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>