227 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_1039 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010501  PputW619_1039  hypothetical protein  100 
 
 		 201 aa  417  1e-116  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.708626  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1398  hypothetical protein  93.53 
 
 		 201 aa  389  1e-107  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.709674  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4325  hypothetical protein  93.03 
 
 		 201 aa  387  1e-107  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.590963 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4414  hypothetical protein  91.54 
 
 		 201 aa  382  1e-105  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4462  hypothetical protein  82.27 
 
 		 209 aa  344  4e-94  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.70984  normal  0.854602 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4298  hypothetical protein  79.8 
 
 		 207 aa  338  4e-92  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4002  hypothetical protein  79.8 
 
 		 207 aa  337  5e-92  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.548606  normal  0.130195 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0863  flavin reductase domain protein FMN-binding  74.26 
 
 		 209 aa  317  9e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1011  hypothetical protein  70.15 
 
 		 202 aa  303  2.0000000000000002e-81  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000116177  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1051  hypothetical protein  65 
 
 		 230 aa  286  2e-76  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.106662  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2703  hypothetical protein  67.66 
 
 		 206 aa  286  2e-76  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.113365  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0081  hypothetical protein  66.34 
 
 		 209 aa  286  2e-76  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04002  nitrilotriacetate monooxygenase component B  65.17 
 
 		 209 aa  282  3.0000000000000004e-75  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0832  hypothetical protein  68.16 
 
 		 206 aa  278  4e-74  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.158602  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1150  flavoprotein oxygenase  65.52 
 
 		 207 aa  276  1e-73  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.462825 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1359  hypothetical protein  64.18 
 
 		 208 aa  274  8e-73  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.262276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1242  hypothetical protein  64.36 
 
 		 208 aa  271  6e-72  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1215  hypothetical protein  64.36 
 
 		 208 aa  270  8.000000000000001e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4219  hypothetical protein  63.18 
 
 		 205 aa  268  2.9999999999999997e-71  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.269485 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2682  hypothetical protein  63.68 
 
 		 205 aa  268  5e-71  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0761  hypothetical protein  63.86 
 
 		 208 aa  268  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1133  hypothetical protein  63.37 
 
 		 208 aa  265  2.9999999999999995e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.311037 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1122  hypothetical protein  63.37 
 
 		 221 aa  265  4e-70  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0498  flavoprotein oxygenase  63.18 
 
 		 209 aa  263  1e-69  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6039  hypothetical protein  62 
 
 		 206 aa  261  3e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.8711  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4899  hypothetical protein  61.69 
 
 		 205 aa  262  3e-69  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2217  hypothetical protein  60.4 
 
 		 207 aa  260  8.999999999999999e-69  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0565603 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3989  flavoprotein oxygenase  61.39 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0452  flavoprotein oxygenase  61.39 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0458  flavoprotein oxygenase  61.39 
 
 		 209 aa  260  1e-68  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6898  hypothetical protein  62.5 
 
 		 203 aa  259  2e-68  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.800563  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2943  hypothetical protein  62.5 
 
 		 216 aa  259  2e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4071  hypothetical protein  60.7 
 
 		 205 aa  259  2e-68  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.261199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3807  flavin reductase domain protein FMN-binding  61.39 
 
 		 209 aa  259  3e-68  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1469  flavoprotein oxygenase  64.04 
 
 		 212 aa  258  5.0000000000000005e-68  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3864  flavoprotein oxygenase  60.89 
 
 		 209 aa  257  9e-68  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0492  flavoprotein oxygenase  60.4 
 
 		 209 aa  256  1e-67  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3355  flavoprotein oxygenase  60.4 
 
 		 210 aa  256  2e-67  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.522125  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3626  flavoprotein oxygenase  58.21 
 
 		 209 aa  255  3e-67  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1820  hypothetical protein  59.9 
 
 		 207 aa  252  3e-66  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0502  flavoprotein oxygenase  58.91 
 
 		 208 aa  251  6e-66  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0053  hypothetical protein  58.62 
 
 		 210 aa  250  1e-65  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.234931  normal  0.568294 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3528  flavoprotein oxygenase  58.42 
 
 		 208 aa  249  3e-65  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4312  hypothetical protein  59.8 
 
 		 205 aa  248  6e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2049  hypothetical protein  56 
 
 		 205 aa  246  1e-64  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0503  flavoprotein oxygenase  58.42 
 
 		 208 aa  246  1e-64  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6051  hypothetical protein  57.5 
 
 		 218 aa  242  3e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.52164  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02220  hypothetical protein  52.48 
 
 		 208 aa  235  3e-61  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.686893  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4267  hypothetical protein  57.92 
 
 		 221 aa  231  7.000000000000001e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.308533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3466  hypothetical protein  56.22 
 
 		 209 aa  229  2e-59  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.421094 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6309  hypothetical protein  55.22 
 
 		 207 aa  226  2e-58  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4215  hypothetical protein  53.5 
 
 		 184 aa  216  2e-55  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.380151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1899  hypothetical protein  52.28 
 
 		 202 aa  214  5.9999999999999996e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.843142  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2631  hypothetical protein  51.26 
 
 		 202 aa  206  2e-52  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3787  hypothetical protein  71.88 
 
 		 140 aa  201  7e-51  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1057  hypothetical protein  47.74 
 
 		 200 aa  192  2e-48  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.535631 
 
 
-
 
NC_004310  BR1068  hypothetical protein  45.96 
 
 		 203 aa  185  5e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0726405  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1032  hypothetical protein  45.96 
 
 		 203 aa  183  1.0000000000000001e-45  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.863891  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2221  hypothetical protein  43.5 
 
 		 201 aa  182  2.0000000000000003e-45  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.378667  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2151  hypothetical protein  44.95 
 
 		 203 aa  181  6e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1842  hypothetical protein  46 
 
 		 203 aa  180  1e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0994516  normal  0.0170416 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2591  flavin reductase domain protein FMN-binding  48.76 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.40537 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2316  hypothetical protein  48.76 
 
 		 201 aa  180  1e-44  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0978794 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2041  flavin reductase domain protein FMN-binding  46 
 
 		 203 aa  179  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0801878  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2270  hypothetical protein  47.26 
 
 		 201 aa  177  9e-44  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2065  conserved hypothetical FMN binding protein  42.93 
 
 		 201 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.111591  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1646  hypothetical protein  47.47 
 
 		 212 aa  170  1e-41  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7205  flavin reductase domain protein FMN-binding  45.41 
 
 		 209 aa  169  2e-41  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.981743  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6295  hypothetical protein  44.44 
 
 		 208 aa  167  9e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.19889  normal  0.194247 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2319  hypothetical protein  41.95 
 
 		 201 aa  166  2e-40  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0267  hypothetical protein  44.16 
 
 		 209 aa  163  2.0000000000000002e-39  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1838  hypothetical protein  43.15 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0487  flavin reductase domain-containing protein  43.15 
 
 		 194 aa  161  6e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.660755  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3209  flavin reductase-like, FMN-binding  42.16 
 
 		 201 aa  161  7e-39  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0627  flavin reductase domain-containing protein  42.13 
 
 		 194 aa  160  8.000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07162  conserved hypothetical protein  44.21 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.574629  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3621  hypothetical protein  40.69 
 
 		 220 aa  150  1e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2269  hypothetical protein  41.15 
 
 		 229 aa  148  5e-35  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2736  hypothetical protein  40.28 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2679  hypothetical protein  40.28 
 
 		 230 aa  147  8e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3064  hypothetical protein  39.81 
 
 		 209 aa  141  5e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.883432  normal  0.0355565 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1916  hypothetical protein  39.13 
 
 		 203 aa  130  1.0000000000000001e-29  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4414  hypothetical protein  38.05 
 
 		 218 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.629184  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2444  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  40.11 
 
 		 199 aa  128  5.0000000000000004e-29  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0889  hypothetical protein  37.7 
 
 		 200 aa  126  2.0000000000000002e-28  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.581973  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1786  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  37.38 
 
 		 228 aa  127  2.0000000000000002e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.60124  normal  0.96149 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2435  hypothetical protein  36.41 
 
 		 211 aa  125  3e-28  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C5933  hypothetical protein  35.48 
 
 		 209 aa  125  6e-28  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1479  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  36.95 
 
 		 206 aa  122  5e-27  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4263  flavin reductase domain-containing protein  38.17 
 
 		 210 aa  120  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.644656 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5792  hypothetical protein  36.59 
 
 		 218 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.926616 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2487  hypothetical protein  39.9 
 
 		 203 aa  120  1.9999999999999998e-26  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.239635  normal  0.0244852 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4644  hypothetical protein  35.98 
 
 		 231 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3293  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.53 
 
 		 216 aa  118  7e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.902968  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2366  flavoprotein oxygenase DIM6/NTAB family-like protein  38.78 
 
 		 203 aa  115  3e-25  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.460598  normal  0.14144 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2815  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.63 
 
 		 219 aa  115  5e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.112665  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01680  hypothetical protein  36.36 
 
 		 292 aa  114  1.0000000000000001e-24  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0405  hypothetical protein  36.63 
 
 		 207 aa  112  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0602  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  35.45 
 
 		 217 aa  113  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.413112 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6314  flavin reductase domain protein FMN-binding protein  37.57 
 
 		 294 aa  113  2.0000000000000002e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>