More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_1571 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_2052  HAD superfamily hydrolase  89.43 
 
 		 707 aa  1263    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.380026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3689  HAD family hydrolase  89.29 
 
 		 707 aa  1255    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1729  HAD family hydrolase  55.24 
 
 		 728 aa  784    Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.696153  hitchhiker  0.000289006 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1571  HAD family hydrolase  100 
 
 		 714 aa  1466    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.882263 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2172  HAD family hydrolase  85.71 
 
 		 710 aa  1214    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0461  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  40.47 
 
 		 217 aa  160  6e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2267  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  41.67 
 
 		 219 aa  151  4e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0780  HAD family hydrolase  39.53 
 
 		 227 aa  149  2.0000000000000003e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0037  haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase family protein  36.92 
 
 		 219 aa  132  3e-29  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001299  CbbY family protein  37.67 
 
 		 216 aa  131  3e-29  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.916657  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05174  phosphoglycolate phosphatase  38.78 
 
 		 256 aa  130  9.000000000000001e-29  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3074  HAD family hydrolase  35.55 
 
 		 222 aa  126  2e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2266  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  37.11 
 
 		 220 aa  122  1.9999999999999998e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3528  HAD family hydrolase  35.21 
 
 		 222 aa  119  1.9999999999999998e-25  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.894258  hitchhiker  0.00350401 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0542  hydrolase  33.64 
 
 		 225 aa  111  6e-23  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.491879  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3933  HAD family hydrolase  34.9 
 
 		 271 aa  110  8.000000000000001e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.71 
 
 		 227 aa  109  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4817  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  35.98 
 
 		 235 aa  109  2e-22  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.821962  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0717  HAD-superfamily hydrolase  35.21 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2296  HAD-superfamily hydrolase  35.21 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2990  HAD-superfamily hydrolase  35.21 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1060  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.21 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1066  haloacid dehalogenase, IA family protein  35.21 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1609  HAD-superfamily hydrolase  35.21 
 
 		 224 aa  108  3e-22  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1286  HAD family hydrolase  35.26 
 
 		 229 aa  107  6e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0479  HAD family hydrolase  32.71 
 
 		 225 aa  105  2e-21  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1218  putative hydrolase  34.56 
 
 		 762 aa  105  3e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0846  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.51 
 
 		 231 aa  105  3e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.814852 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0935  HAD family hydrolase  34.01 
 
 		 235 aa  105  3e-21  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.941543  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4133  HAD family hydrolase  33.85 
 
 		 223 aa  103  9e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1791  putative haloacid dehalogenase/epoxide hydrolase  31.16 
 
 		 218 aa  100  6e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3772  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.16 
 
 		 218 aa  100  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3054  HAD family hydrolase  35.08 
 
 		 224 aa  100  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.751068  normal  0.223571 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0820  HAD family hydrolase  29.52 
 
 		 221 aa  99.8  2e-19  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.420721  hitchhiker  0.00000000104285 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0864  HAD family hydrolase  32.38 
 
 		 226 aa  99.8  2e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0381  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.12 
 
 		 221 aa  99  3e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0071153  normal  0.324571 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0437  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.58 
 
 		 221 aa  98.6  4e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000647119  hitchhiker  0.00000756317 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3073  HAD family hydrolase  34.44 
 
 		 223 aa  97.8  7e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00582956  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3473  HAD family hydrolase  33.67 
 
 		 243 aa  96.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1034  hydrolase  30.77 
 
 		 217 aa  94.7  5e-18  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1819  HAD family hydrolase  33.81 
 
 		 230 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2430  HAD family hydrolase  33.81 
 
 		 230 aa  94.7  5e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3346  HAD family hydrolase  29.69 
 
 		 221 aa  94.4  6e-18  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.363754  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1460  HAD family hydrolase  32.56 
 
 		 229 aa  94.4  6e-18  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.00552213  normal  0.266811 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1634  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.1 
 
 		 221 aa  92.4  2e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0501975  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3148  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 228 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0274068  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3210  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 228 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.742759  normal  0.278604 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3160  HAD family hydrolase  34.46 
 
 		 228 aa  92.4  2e-17  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0720917  normal  0.533727 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1853  HAD-superfamily hydrolase  33.16 
 
 		 213 aa  92  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2452  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.69 
 
 		 232 aa  92  3e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2435  HAD family hydrolase  33.33 
 
 		 227 aa  92.4  3e-17  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.396573  normal  0.95205 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1824  HAD family hydrolase  36.11 
 
 		 222 aa  91.7  5e-17  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0863  HAD-superfamily hydrolase  34.58 
 
 		 224 aa  91.3  6e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.00905337  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4498  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  31.12 
 
 		 223 aa  91.3  6e-17  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.511661  normal  0.0143777 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2787  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.84 
 
 		 230 aa  90.9  7e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00137861  hitchhiker  0.0000132599 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3425  2-deoxyglucose-6-phosphatase  29.55 
 
 		 223 aa  90.9  8e-17  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.000919178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3378  2-deoxyglucose-6-phosphatase  27.19 
 
 		 225 aa  90.5  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2733  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3 family protein  30.62 
 
 		 237 aa  89.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.53567  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2469  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.81 
 
 		 224 aa  89.7  2e-16  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.618161  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1174  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.02 
 
 		 225 aa  89.4  2e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0424  2-deoxyglucose-6-phosphatase  30.41 
 
 		 222 aa  89  3e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2212  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  34.78 
 
 		 220 aa  88.6  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1697  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.67 
 
 		 221 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5761  HAD family hydrolase  31.1 
 
 		 230 aa  88.6  4e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.434406 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1808  2-deoxyglucose-6-phosphatase  33.67 
 
 		 221 aa  88.6  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.417032  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1566  HAD family hydrolase  34.83 
 
 		 216 aa  88.2  5e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20940  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  30.22 
 
 		 273 aa  87.4  8e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.650807 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1912  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.18 
 
 		 223 aa  87.4  8e-16  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0120822  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03084  HAD superfamily hydrolase  31.63 
 
 		 226 aa  87  0.000000000000001  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1517  HAD family hydrolase  34.27 
 
 		 216 aa  87  0.000000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2245  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.33 
 
 		 247 aa  85.9  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.56873  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22200  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  36.27 
 
 		 217 aa  86.3  0.000000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.172111  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10160  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  31.84 
 
 		 217 aa  86.3  0.000000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.64096  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0179  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.76 
 
 		 218 aa  85.5  0.000000000000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3898  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.56 
 
 		 233 aa  85.1  0.000000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0426  HAD family sugar phosphatase  29.95 
 
 		 212 aa  84.7  0.000000000000005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.0044369  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0822  HAD family hydrolase  31.49 
 
 		 396 aa  84.3  0.000000000000007  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4044  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  32.13 
 
 		 228 aa  84  0.000000000000009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.363357  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1517  HAD family hydrolase  29.38 
 
 		 272 aa  84  0.000000000000009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00550293  decreased coverage  0.0000688846 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3236  fructose-1-phosphatase  32.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000293158  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3371  fructose-1-phosphatase  32.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000009  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.0000166362  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0893  fructose-1-phosphatase  32.18 
 
 		 188 aa  84  0.000000000000009  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.000000160736  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  31.31 
 
 		 218 aa  83.2  0.00000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_22130  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  30.6 
 
 		 229 aa  83.2  0.00000000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2125  2-deoxyglucose-6-phosphatase  32.29 
 
 		 221 aa  82.8  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0177126  hitchhiker  0.00144451 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0452  HAD family hydrolase  30.34 
 
 		 221 aa  82.4  0.00000000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2412  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  33.53 
 
 		 222 aa  82.4  0.00000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0708  HAD-superfamily hydrolase  30.85 
 
 		 212 aa  82  0.00000000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27350  HAD-superfamily hydrolase  30.6 
 
 		 229 aa  82.4  0.00000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2008  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.27 
 
 		 213 aa  82.4  0.00000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.296794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1481  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.69 
 
 		 233 aa  82  0.00000000000003  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1509  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.63 
 
 		 231 aa  81.6  0.00000000000004  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000193428 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2205  2-deoxyglucose-6-phosphatase  31.73 
 
 		 221 aa  81.6  0.00000000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.100097  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2232  HAD family hydrolase  34.5 
 
 		 233 aa  81.6  0.00000000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.470588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2205  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 3  32.95 
 
 		 228 aa  81.6  0.00000000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.322675  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2485  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.48 
 
 		 238 aa  81.6  0.00000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2790  HAD family hydrolase  27.69 
 
 		 223 aa  81.3  0.00000000000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2349  HAD family hydrolase  33.93 
 
 		 215 aa  81.3  0.00000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.355354 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1545  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.26 
 
 		 213 aa  81.3  0.00000000000006  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39300  haloacid dehalogenase superfamily protein, subfamily IA, variant 3 with third motif having DD or ED  28.9 
 
 		 218 aa  80.9  0.00000000000008  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>