31 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3857 on replicon NC_008608
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008608  Ppro_3857  initiator RepB protein  100 
 
 		 274 aa  573  1.0000000000000001e-162  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  5.688790000000001e-19  n/a   
 
 
-
 
NC_012851  Rpic12D_5391  initiator RepB protein  42.62 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010683  Rpic_4962  initiator RepB protein  42.62 
 
 		 251 aa  178  7e-44  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008320  Shewmr7_4036  initiator RepB protein  28.32 
 
 		 230 aa  91.3  2e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.937889  n/a   
 
 
-
 
NC_006298  HS_p02  replication protein  28.64 
 
 		 323 aa  89.4  5e-17  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011316  VSAL_p43_01  putative replication initiation protein  29.82 
 
 		 219 aa  89.7  5e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010181  BcerKBAB4_5421  initiator RepB protein  25.65 
 
 		 404 aa  85.1  0.000000000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013412  GYMC61_3588  initiator RepB protein  25.23 
 
 		 383 aa  84  0.000000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  hitchhiker  0.000000240112  n/a   
 
 
-
 
NC_010486  EcSMS35_C0001  initiator replication protein RepB  27.19 
 
 		 233 aa  84.3  0.000000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007968  Pcryo_2493  initiator RepB protein  26.51 
 
 		 315 aa  79.7  0.00000000000005  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.769372  normal  1 
 
 
-
 
NC_006298  HS_p03  replication protein  27.03 
 
 		 323 aa  78.6  0.0000000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012794  GWCH70_3452  initiator RepB protein  24.88 
 
 		 381 aa  77  0.0000000000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.892853  normal  0.996555 
 
 
-
 
NC_013734  Slin_7015  initiator RepB protein  26.14 
 
 		 324 aa  75.5  0.0000000000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  decreased coverage  0.0000194269  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0315  initiator RepB protein family protein  25.66 
 
 		 320 aa  74.3  0.000000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013736  Slin_7050  initiator RepB protein  29.76 
 
 		 331 aa  70.9  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.948666  n/a   
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4178  initiator RepB protein  25.76 
 
 		 409 aa  63.9  0.000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0022  truncated replication protein  28.97 
 
 		 214 aa  59.3  0.00000007  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011148  SeAg_A0036  plasmid replication protein  24.31 
 
 		 354 aa  57.8  0.0000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D23  replication initiator protein  23.71 
 
 		 384 aa  56.2  0.0000005  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  decreased coverage  0.000665285  n/a   
 
 
-
 
NC_009705  YpsIP31758_B0136  plasmid replication protein  22.32 
 
 		 342 aa  54.3  0.000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3693  hypothetical protein  38.96 
 
 		 447 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.319003  normal  0.276461 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3494  plasmid replication initiation protein  38.96 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0939309  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_1425  plasmid replication initiation protein  38.96 
 
 		 437 aa  53.1  0.000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.81076  n/a   
 
 
-
 
NC_008505  LACR_C16  replication initiator protein  23.46 
 
 		 388 aa  52.4  0.000008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3790  initiator RepB protein  33.72 
 
 		 399 aa  48.9  0.00009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.744533  n/a   
 
 
-
 
NC_008507  LACR_E8  replication initiator protein  18.68 
 
 		 443 aa  47.4  0.0003  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009796  CCC13826_1364  putative pNL871104_p1  22.17 
 
 		 319 aa  46.2  0.0005  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008503  LACR_A06  replication initiator protein  23.32 
 
 		 386 aa  45.8  0.0008  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0201763  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3407  initiator RepB protein  32.47 
 
 		 430 aa  44.3  0.002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.835339 
 
 
-
 
NC_009959  Dshi_4214  initiator RepB protein  32.88 
 
 		 390 aa  43.5  0.004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011351  ECH74115_A0001  plasmid replication protein  22.03 
 
 		 336 aa  43.1  0.004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.773057 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>