More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_3606 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_3606  TatD family hydrolase  100 
 
 		 269 aa  535  1e-151  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000130951  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3458  TatD-related deoxyribonuclease  52.99 
 
 		 251 aa  255  6e-67  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000153404  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3236  TatD-related deoxyribonuclease:amidohydrolase 2  53.39 
 
 		 252 aa  251  1e-65  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0365762  normal  0.100841 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  49.2 
 
 		 253 aa  242  3.9999999999999997e-63  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  49 
 
 		 259 aa  222  4.9999999999999996e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4021  hydrolase, TatD family  47.79 
 
 		 259 aa  216  5e-55  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  3.45808e-17 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3287  TatD family hydrolase  48.22 
 
 		 258 aa  213  1.9999999999999998e-54  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  36.22 
 
 		 257 aa  176  3e-43  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  38.1 
 
 		 255 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  36.9 
 
 		 255 aa  172  3.9999999999999995e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  37.7 
 
 		 256 aa  172  5e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  38.74 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  38.74 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.74 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  38.74 
 
 		 255 aa  171  1e-41  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  37.3 
 
 		 255 aa  170  3e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  38.34 
 
 		 255 aa  169  4e-41  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  38.34 
 
 		 255 aa  169  5e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  38.34 
 
 		 255 aa  168  8e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  38.82 
 
 		 464 aa  168  9e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  37.3 
 
 		 255 aa  167  2e-40  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  37.94 
 
 		 256 aa  167  2e-40  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3015  TatD family deoxyribonuclease  41.86 
 
 		 262 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.91144e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  35.94 
 
 		 257 aa  162  4.0000000000000004e-39  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  34.24 
 
 		 258 aa  162  7e-39  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  34.5 
 
 		 265 aa  161  1e-38  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0783  TatD family hydrolase  39.38 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2570  TatD-related deoxyribonuclease  41.18 
 
 		 260 aa  159  5e-38  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.54092  normal  0.0246673 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  36.86 
 
 		 258 aa  159  6e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  35.55 
 
 		 258 aa  158  7e-38  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  36.36 
 
 		 257 aa  158  8e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  35.57 
 
 		 256 aa  157  2e-37  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  34.63 
 
 		 260 aa  157  2e-37  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0791  TatD-like deoxyribonuclease  38.46 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.631026  normal  0.262092 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1347  TatD-related deoxyribonuclease  38.13 
 
 		 268 aa  155  9e-37  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  31.47 
 
 		 255 aa  155  9e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  36.19 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  35.97 
 
 		 606 aa  154  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  37.4 
 
 		 459 aa  154  1e-36  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1058  TatD-related deoxyribonuclease  39.25 
 
 		 270 aa  154  1e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.446908 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12140  TatD-related deoxyribonuclease  40 
 
 		 259 aa  153  2e-36  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0555  TatD-related deoxyribonuclease  36.68 
 
 		 265 aa  153  2e-36  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.41598  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1581  hypothetical protein  37.84 
 
 		 259 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  35.71 
 
 		 257 aa  153  2.9999999999999998e-36  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  33.33 
 
 		 258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2305  TatD family hydrolase  35.83 
 
 		 255 aa  152  4e-36  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.352622  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  37.74 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3146  TatD-related deoxyribonuclease  37.65 
 
 		 256 aa  152  4e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.30888  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1609  TatD-related deoxyribonuclease  40.38 
 
 		 275 aa  152  5e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0793663  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0962  TatD-related deoxyribonuclease  38.87 
 
 		 270 aa  152  5e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  decreased coverage  0.00454471  normal  0.0309103 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2271  TatD-related deoxyribonuclease  40.87 
 
 		 263 aa  152  5e-36  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  35.04 
 
 		 256 aa  152  7e-36  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0819  TatD-related deoxyribonuclease  39.92 
 
 		 264 aa  152  8e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.180224 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1932  hypothetical protein  35.83 
 
 		 283 aa  151  1e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000096449  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  32.69 
 
 		 265 aa  151  1e-35  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0489  hydrolase, TatD family  38.65 
 
 		 281 aa  151  1e-35  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.868901 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  32.03 
 
 		 263 aa  150  2e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3060  putative TatD related DNase  38.95 
 
 		 284 aa  150  2e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.074309  normal  0.521889 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  35.97 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  34.13 
 
 		 265 aa  150  2e-35  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2167  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 		 458 aa  150  2e-35  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1630  putative metallodependent hydrolase  37.6 
 
 		 264 aa  149  3e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  unclonable  0.000015742  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1600  hypothetical protein  33.98 
 
 		 255 aa  150  3e-35  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  40.16 
 
 		 256 aa  150  3e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2237  hydrolase, TatD family protein  34.25 
 
 		 262 aa  150  3e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  36.36 
 
 		 457 aa  149  4e-35  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2050  hydrolase, TatD family  34.9 
 
 		 458 aa  149  4e-35  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2547  hydrolase, TatD family  36.61 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000234305  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  34.26 
 
 		 254 aa  149  5e-35  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0807  TatD-related deoxyribonuclease  36.02 
 
 		 267 aa  149  6e-35  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.333261  normal  0.0140186 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0457  TatD-related deoxyribonuclease  35.8 
 
 		 265 aa  148  8e-35  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.723414  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1065  TatD-related deoxyribonuclease  42.28 
 
 		 288 aa  148  9e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.426746  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  38.26 
 
 		 278 aa  148  9e-35  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  36.55 
 
 		 264 aa  148  9e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2247  putative TatD-related deoxyribonuclease  33.6 
 
 		 256 aa  148  1.0000000000000001e-34  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.152142  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2115  TatD family hydrolase  34.39 
 
 		 257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.774766  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1585  putative metallodependent hydrolase  35.91 
 
 		 269 aa  147  1.0000000000000001e-34  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000000288307  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  32.03 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1895  hydrolase, TatD family  34.25 
 
 		 262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.137454 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1776  hydrolase, TatD family  33.07 
 
 		 263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  36.82 
 
 		 258 aa  147  2.0000000000000003e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  39.92 
 
 		 261 aa  147  2.0000000000000003e-34  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002627  putative deoxyribonuclease YjjV  37.39 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00712504  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2456  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 283 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.347591  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1485  hypothetical protein  36.19 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.507354  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04808  putative deoxyribonuclease YjjV  37.25 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  35.43 
 
 		 256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3491  putative metallodependent hydrolase  35.91 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.00000629456  normal  0.0349317 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1693  putative metallodependent hydrolase  35.91 
 
 		 269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.0223862  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  32.03 
 
 		 255 aa  147  2.0000000000000003e-34  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  35.18 
 
 		 462 aa  147  3e-34  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  34.25 
 
 		 259 aa  146  3e-34  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2449  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.716408  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  34.13 
 
 		 255 aa  147  3e-34  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  36.22 
 
 		 265 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2048  TatD-related deoxyribonuclease  34.25 
 
 		 262 aa  146  3e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  32.14 
 
 		 255 aa  146  3e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2569  TatD family hydrolase  34.25 
 
 		 283 aa  147  3e-34  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.285231  normal  0.0418205 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1657  TatD-related deoxyribonuclease  35 
 
 		 261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000576641  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>