More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_1270 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008609  Ppro_1270  radical SAM domain-containing protein  100 
 
 		 344 aa  679    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.391836  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1017  Radical SAM domain protein  43.87 
 
 		 345 aa  251  9.000000000000001e-66  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1280  Radical SAM domain protein  45.37 
 
 		 346 aa  224  2e-57  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0433  radical SAM domain-containing protein  32.17 
 
 		 365 aa  138  1e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.293902  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0105  radical SAM domain-containing protein  27.84 
 
 		 290 aa  122  9e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.287918  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2473  radical SAM domain-containing protein  27.79 
 
 		 458 aa  93.2  6e-18  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.0000751779  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2372  Radical SAM domain protein  28.53 
 
 		 463 aa  89.4  9e-17  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.545422  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0029  Radical SAM domain protein  29.34 
 
 		 452 aa  87.4  3e-16  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2456  radical SAM domain-containing protein  28.37 
 
 		 470 aa  86.3  7e-16  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.677183 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0534  Radical SAM domain protein  26.18 
 
 		 447 aa  85.9  0.000000000000001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00011095  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1532  Radical SAM domain protein  23.97 
 
 		 405 aa  84.3  0.000000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.171129  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1264  putative sulfatase regulator  23.16 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3029  radical SAM family protein  27.33 
 
 		 484 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  hitchhiker  0.0038885  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1379  radical SAM domain-containing protein  22.88 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3149  putative sulfatase regulator  23.16 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.997665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0906  radical SAM family protein  24.65 
 
 		 450 aa  84.3  0.000000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000066146  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0109  Radical SAM domain protein  26.71 
 
 		 465 aa  83.2  0.000000000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0862  radical SAM domain-containing protein  26.46 
 
 		 317 aa  80.9  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000001092  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3930  hypothetical protein  37.04 
 
 		 414 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.298545  normal  0.584174 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1460  radical SAM domain-containing protein  23.46 
 
 		 461 aa  79.7  0.00000000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000686349  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3080  arylsulfatase regulator  25 
 
 		 438 aa  79.3  0.00000000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.482835  normal  0.0699226 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1479  Radical SAM domain protein  26.94 
 
 		 414 aa  79  0.0000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1008  Radical SAM domain protein  25.81 
 
 		 460 aa  78.2  0.0000000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2700  arylsulfatase regulator  25 
 
 		 380 aa  78.2  0.0000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00619293  normal  0.114693 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0871  radical SAM domain-containing protein  25.07 
 
 		 489 aa  78.2  0.0000000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.128121  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0616  anaerobic sulfatase-maturase  27.89 
 
 		 370 aa  78.6  0.0000000000002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.512735  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1687  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 385 aa  77.8  0.0000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1676  radical SAM domain-containing protein  22.22 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2110  radical SAM domain protein  22.22 
 
 		 385 aa  78.2  0.0000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.73629  normal  0.549751 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4919  Radical SAM domain protein  26.29 
 
 		 476 aa  77.4  0.0000000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000220499  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4174  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.54 
 
 		 447 aa  77.4  0.0000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1683  radical SAM family protein  30.26 
 
 		 460 aa  77  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.24704  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3234  radical SAM domain-containing protein  38.19 
 
 		 397 aa  76.6  0.0000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3391  radical SAM domain-containing protein  26.27 
 
 		 800 aa  76.3  0.0000000000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.228566 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01455  hypothetical protein  21.91 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2149  Radical SAM domain protein  21.91 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.967723  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4197  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.32 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01468  hypothetical protein  21.91 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2160  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.821975 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1582  radical SAM domain-containing protein  21.91 
 
 		 385 aa  75.9  0.0000000000009  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.28073  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4293  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.54 
 
 		 431 aa  75.9  0.0000000000009  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4353  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.25 
 
 		 431 aa  75.5  0.000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0102  radical SAM domain-containing protein  26.6 
 
 		 323 aa  75.9  0.000000000001  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0101  radical SAM domain-containing protein  24.85 
 
 		 323 aa  74.7  0.000000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4246  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  22.25 
 
 		 431 aa  73.9  0.000000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.598382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1267  radical SAM family protein  28.9 
 
 		 473 aa  74.3  0.000000000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.361932  normal  0.190487 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0762  Radical SAM domain protein  36.72 
 
 		 476 aa  73.9  0.000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.502838  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0515  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 400 aa  74.3  0.000000000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000107878  hitchhiker  0.000774187 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6677  radical SAM family protein  34.52 
 
 		 470 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.444981  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6916  hypothetical protein  36.25 
 
 		 399 aa  73.9  0.000000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2465  radical SAM domain-containing protein  28.3 
 
 		 378 aa  73.6  0.000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2974  radical SAM family protein  25 
 
 		 477 aa  73.6  0.000000000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2101  Radical SAM domain protein  29.01 
 
 		 369 aa  73.6  0.000000000005  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1507  radical SAM domain-containing protein  23.93 
 
 		 381 aa  73.6  0.000000000005  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.385023 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2031  radical SAM family protein  35.11 
 
 		 481 aa  73.2  0.000000000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0095  radical SAM domain-containing protein  26.52 
 
 		 316 aa  73.2  0.000000000006  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0204398  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1560  radical SAM family protein  23.93 
 
 		 388 aa  72.8  0.000000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.101502  normal  0.842747 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4272  Radical SAM domain protein  25.46 
 
 		 337 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1225  radical SAM domain-containing protein  31.1 
 
 		 395 aa  72.4  0.00000000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2198  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 457 aa  72.4  0.00000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0602  arylsulfatase regulator, putative  25.17 
 
 		 280 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1909  radical SAM domain-containing protein  23.7 
 
 		 450 aa  72  0.00000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.00558063  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2073  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 410 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0151054  normal  0.88541 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1902  radical SAM domain-containing protein  30 
 
 		 410 aa  72  0.00000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0945  Radical SAM domain protein  26.43 
 
 		 453 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00793831  normal  0.0982171 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4019  arylsulfatase-activating protein AslB  25.75 
 
 		 411 aa  72  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000197695  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6683  Radical SAM domain protein  31.45 
 
 		 428 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.630813  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0409  radical SAM domain-containing protein  21.53 
 
 		 439 aa  71.2  0.00000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3461  radical SAM domain protein  35.38 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.361209 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0328  Radical SAM domain protein  22.87 
 
 		 468 aa  71.2  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3467  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.18 
 
 		 394 aa  70.9  0.00000000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.904338  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2308  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.195773  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2944  radical SAM domain-containing protein  36.92 
 
 		 476 aa  70.9  0.00000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.388692  normal  0.122709 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2476  radical SAM domain-containing protein  35.38 
 
 		 476 aa  71.2  0.00000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.187942  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4206  radical SAM domain-containing protein  25.75 
 
 		 411 aa  70.9  0.00000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000150338  normal  1 
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1837  Radical SAM domain protein  26.58 
 
 		 518 aa  70.1  0.00000000005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.654863  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0623  Radical SAM domain protein  24.25 
 
 		 453 aa  69.7  0.00000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000646743  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1695  radical SAM family protein  26.89 
 
 		 491 aa  69.7  0.00000000006  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.192909  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0349  radical SAM domain-containing protein  24.14 
 
 		 427 aa  69.3  0.00000000008  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4179  Radical SAM domain protein  25.48 
 
 		 411 aa  69.3  0.0000000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000042782  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0884  radical SAM domain-containing protein  29.23 
 
 		 510 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.699879  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1754  Radical SAM domain protein  20.88 
 
 		 447 aa  69.3  0.0000000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.0305986  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1704  radical SAM domain-containing protein  33.86 
 
 		 485 aa  69.3  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.347799  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0679  Radical SAM domain protein  25.37 
 
 		 462 aa  69.3  0.0000000001  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3007  Radical SAM domain protein  31.18 
 
 		 431 aa  69.3  0.0000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.486348 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0893  radical SAM domain-containing protein  24.7 
 
 		 385 aa  68.9  0.0000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.22841  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1706  radical SAM domain-containing protein  24.92 
 
 		 380 aa  69.3  0.0000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0248528 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3372  arylsulfatase-activating protein AtsB  26.76 
 
 		 394 aa  69.3  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3298  arylsulfatase-activating protein AtsB  25.37 
 
 		 394 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1148  molybdenum cofactor biosynthesis protein A  28.62 
 
 		 298 aa  68.2  0.0000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2722  Radical SAM domain protein  34.96 
 
 		 487 aa  68.2  0.0000000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2600  Radical SAM domain protein  23.89 
 
 		 486 aa  68.2  0.0000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3298  radical SAM domain-containing protein  24.03 
 
 		 450 aa  68.6  0.0000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000268991  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2157  radical SAM domain-containing protein  25.74 
 
 		 402 aa  67.8  0.0000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2352  Radical SAM domain protein  27.46 
 
 		 565 aa  67.8  0.0000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1985  Methyltransferase type 11  26.49 
 
 		 1000 aa  67.4  0.0000000004  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1888  chondroitin sulfate/heparin utilization regulation protein  30.26 
 
 		 398 aa  67.4  0.0000000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.422634  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0165  radical SAM domain-containing protein  32.91 
 
 		 376 aa  67  0.0000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.263951  hitchhiker  0.000169446 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0946  Radical SAM domain protein  25.91 
 
 		 492 aa  67.4  0.0000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.21013  normal  0.166002 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0156  radical SAM domain-containing protein  32.5 
 
 		 377 aa  67  0.0000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>