209 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppro_0978 on replicon NC_008609
Organism: Pelobacter propionicus DSM 2379



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  100 
 
 
130 aa  263  7e-70  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  60.77 
 
 
130 aa  170  6.999999999999999e-42  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  59.23 
 
 
130 aa  159  1e-38  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  56.15 
 
 
130 aa  154  3e-37  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  59.23 
 
 
131 aa  154  3e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  56.15 
 
 
131 aa  141  2e-33  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  54.62 
 
 
131 aa  139  1.9999999999999998e-32  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1934  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  42.42 
 
 
133 aa  108  3e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.841781  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
134 aa  101  3e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0153  PTS system fructose subfamily IIA component  41.67 
 
 
139 aa  100  6e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.327367 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  40.77 
 
 
135 aa  100  9e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  38.64 
 
 
172 aa  99  2e-20  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  38.76 
 
 
145 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1597  PTS system fructose subfamily IIA component  41.98 
 
 
136 aa  95.9  2e-19  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  36.15 
 
 
133 aa  95.1  2e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0148  phosphotransferase system, fructose subfamily IIA component  39.26 
 
 
138 aa  95.1  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  37.98 
 
 
147 aa  95.5  2e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  37.69 
 
 
133 aa  95.9  2e-19  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1397  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
133 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.136359 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1176  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.459375  normal  0.718803 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  42.28 
 
 
133 aa  95.1  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  41.54 
 
 
133 aa  94.7  3e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  39.85 
 
 
163 aa  94.4  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  37.12 
 
 
138 aa  94  7e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2013  PTS system, IIA component  41.54 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0744543  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  39.1 
 
 
133 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_004310  BR2094  PTS system, IIA component  41.54 
 
 
133 aa  93.6  9e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.98601  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  38.35 
 
 
133 aa  92.8  1e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  39.23 
 
 
133 aa  92  2e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
133 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0155  PTS system fructose subfamily IIA component  38.52 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
152 aa  92.4  2e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0166  PTS system fructose subfamily IIA component  38.52 
 
 
138 aa  92.8  2e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
133 aa  92  2e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  40 
 
 
133 aa  91.7  3e-18  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  40.3 
 
 
135 aa  91.3  4e-18  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  38.46 
 
 
133 aa  90.1  9e-18  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  39.53 
 
 
152 aa  89.7  1e-17  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 
134 aa  88.6  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  38.21 
 
 
133 aa  88.6  2e-17  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  34.62 
 
 
136 aa  87.4  5e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  39.39 
 
 
133 aa  87.8  5e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  35.38 
 
 
142 aa  85.5  2e-16  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  35.11 
 
 
135 aa  85.1  3e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3574  PTS system fructose subfamily IIA component  35.11 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  36.59 
 
 
133 aa  84  7e-16  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  35.11 
 
 
135 aa  81.6  0.000000000000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  36.72 
 
 
332 aa  79  0.00000000000002  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 
140 aa  78.2  0.00000000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  32.03 
 
 
331 aa  77.8  0.00000000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  33.87 
 
 
141 aa  76.3  0.0000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.2 
 
 
134 aa  76.3  0.0000000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1901  PTS system fructose subfamily IIA component  36.22 
 
 
165 aa  76.3  0.0000000000001  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.128091 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0445  PTS system fructose subfamily IIA component  33.85 
 
 
140 aa  75.9  0.0000000000002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2065  PTS system fructose subfamily IIA component  34.09 
 
 
147 aa  75.1  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.03 
 
 
326 aa  74.3  0.0000000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  39.05 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000006  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  34.13 
 
 
137 aa  73.9  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  34.95 
 
 
142 aa  72  0.000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  30.47 
 
 
326 aa  71.6  0.000000000003  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  35.58 
 
 
329 aa  72  0.000000000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  31.71 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  31.71 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  31.71 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.71 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.71 
 
 
322 aa  68.9  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0346  hypothetical protein  33.33 
 
 
169 aa  67.8  0.00000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.55769  normal  0.700442 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  31.2 
 
 
134 aa  67.4  0.00000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0221  PTS system fructose subfamily IIA component  35.85 
 
 
151 aa  67.4  0.00000000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000694463 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  31.97 
 
 
320 aa  67.4  0.00000000006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  31.3 
 
 
143 aa  66.6  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0202  PTS system fructose subfamily IIA component  35.85 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.262504  normal  0.29106 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0244  PTS system fructose subfamily IIA component  37.5 
 
 
151 aa  66.2  0.0000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.533558  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7371  PTS system permease (IIAMan), nitrogen regulatory IIA protein  41.89 
 
 
82 aa  65.9  0.0000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.846581  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3277  PTS system fructose IIA component  33.33 
 
 
142 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  30.89 
 
 
323 aa  65.5  0.0000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4480  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  29.75 
 
 
135 aa  65.1  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.569448 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4082  PTS system fructose subfamily IIA component  29.6 
 
 
129 aa  64.7  0.0000000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  30 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5497  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  28.8 
 
 
135 aa  64.3  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4522  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  28.8 
 
 
135 aa  63.9  0.0000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  30.58 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  31.75 
 
 
151 aa  63.9  0.0000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  29.51 
 
 
323 aa  63.9  0.0000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  28.35 
 
 
336 aa  63.2  0.000000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0540  PTS system fructose subfamily IIA component  33.06 
 
 
130 aa  63.5  0.000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  31.71 
 
 
318 aa  63.2  0.000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  30.08 
 
 
324 aa  62.8  0.000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  30.53 
 
 
143 aa  62.8  0.000000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  31.2 
 
 
138 aa  62.4  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3997  PTS system fructose IIA component  34.15 
 
 
141 aa  62.4  0.000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>