129 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcE24377A_3277 on replicon NC_009801
Organism: Escherichia coli E24377A



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009801  EcE24377A_3277  PTS system fructose IIA component  100 
 
 
142 aa  289  1e-77  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4051  PTS system fructose-specific transporter subunit IIA  85.21 
 
 
141 aa  243  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.0648289 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4102  PTS system fructose IIA component  85.21 
 
 
141 aa  243  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3979  PTS system fructose IIA component  85.21 
 
 
141 aa  243  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3997  PTS system fructose IIA component  85.21 
 
 
141 aa  243  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4165  PTS system fructose transporter subunit IIA  85.21 
 
 
141 aa  243  4e-64  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.315728 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  46.56 
 
 
136 aa  131  3e-30  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  29.84 
 
 
134 aa  66.2  0.0000000001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
130 aa  65.5  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2628  PTS system fructose subfamily IIA component  32.28 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.404863  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3020  PTS system, IIA component, putative  32.28 
 
 
138 aa  64.7  0.0000000004  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.69 
 
 
139 aa  63.9  0.0000000007  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3205  PTS system fructose subfamily IIA component  33 
 
 
143 aa  61.6  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  31.93 
 
 
130 aa  58.9  0.00000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3447  PTS system fructose subfamily IIA component  28.81 
 
 
134 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  23.97 
 
 
140 aa  57.8  0.00000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  33.03 
 
 
136 aa  56.6  0.0000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4627  PTS system fructose subfamily IIA component  30.47 
 
 
135 aa  56.2  0.0000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.156154  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0375  PTS system fructose subfamily IIA component  32.79 
 
 
141 aa  56.2  0.0000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  normal  0.315145 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  29.66 
 
 
130 aa  55.8  0.0000002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1883  PTS system, IIA component, putative  27.97 
 
 
130 aa  55.1  0.0000004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.821865  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2848  PTS system fructose subfamily IIA component  31.5 
 
 
133 aa  54.7  0.0000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.707563  normal  0.315346 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  34.71 
 
 
322 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  34.71 
 
 
322 aa  53.5  0.000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0120  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  22.56 
 
 
132 aa  53.1  0.000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00000167564  hitchhiker  1.7476000000000002e-20 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2412  pentitol phosphotransferase enzyme IIA component  32.84 
 
 
138 aa  52.4  0.000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2903  PTS system fructose subfamily IIA component  27.97 
 
 
134 aa  52.4  0.000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.312046  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2051  PTS system fructose subfamily IIA component  29.51 
 
 
142 aa  52.4  0.000002  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.5089  normal  0.12879 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1501  PTS system fructose subfamily IIA component  28.12 
 
 
145 aa  52.4  0.000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.021335  hitchhiker  0.00841376 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3249  PTS system fructose subfamily IIA component  27.97 
 
 
133 aa  52.4  0.000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  34.88 
 
 
318 aa  52.8  0.000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  35.83 
 
 
323 aa  51.6  0.000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  30.65 
 
 
142 aa  50.8  0.000006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  35 
 
 
322 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  35 
 
 
322 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  35 
 
 
322 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  35 
 
 
322 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  35 
 
 
322 aa  50.8  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  28.93 
 
 
135 aa  50.4  0.000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  25.6 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1775  PTS system, IIA component  25.71 
 
 
152 aa  49.7  0.00001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.714918  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  34.45 
 
 
313 aa  49.7  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0252  PTS system fructose subfamily IIA component  28.1 
 
 
133 aa  48.9  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.173613 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  31.09 
 
 
320 aa  48.5  0.00003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  28.71 
 
 
329 aa  48.5  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  32.5 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.5 
 
 
324 aa  48.5  0.00003  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0423  PTS system fructose subfamily IIA component  28.45 
 
 
172 aa  48.5  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00751527 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1902  PTS system, IIA component  32.77 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00331996  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.43 
 
 
332 aa  48.1  0.00004  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 
137 aa  48.1  0.00004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0594  PTS system fructose subfamily IIA component  32.52 
 
 
133 aa  47.8  0.00005  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0232573  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0047  PTS system IIA component  27.97 
 
 
133 aa  47.8  0.00006  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.5 
 
 
324 aa  47.4  0.00007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2738  PTS system fructose subfamily IIA component  27.97 
 
 
133 aa  47.4  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0857805 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.67 
 
 
323 aa  47  0.00009  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0218  PTS system fructose subfamily IIA component  28 
 
 
130 aa  46.2  0.0002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0370  PTS system fructose subfamily IIA component  32.28 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.0276515 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  29.41 
 
 
136 aa  45.4  0.0002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.0000344944  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3696  PTS system fructose subfamily IIA component  26.72 
 
 
143 aa  45.8  0.0002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000385193  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.21 
 
 
329 aa  45.8  0.0002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4281  PTS system fructose subfamily IIA component  29.09 
 
 
142 aa  45.8  0.0002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0502  PTS system fructose subfamily IIA component  28.24 
 
 
138 aa  45.8  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0358  PTS system fructose subfamily IIA component  33.33 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4293  PTS system fructose subfamily IIA component  25.42 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3966  PTS system fructose subfamily IIA component  25.42 
 
 
133 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.997411  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0971  PTS system fructose subfamily IIA component  25.49 
 
 
147 aa  45.8  0.0002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  25.24 
 
 
330 aa  45.4  0.0003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0825  PTS system fructose subfamily IIA component  25.2 
 
 
133 aa  45.1  0.0003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0295  PTS system fructose subfamily IIA component  36.92 
 
 
151 aa  44.7  0.0004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0440  PTS system fructose subfamily IIA component  32.5 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0398  PTS system fructose subfamily IIA component  29.47 
 
 
135 aa  44.7  0.0004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0287233  normal  0.0945396 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0228  PTS system fructose subfamily IIA component  29.69 
 
 
133 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.836808  normal  0.0202408 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3086  PTS system fructose subfamily IIA component  29.41 
 
 
133 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0373385  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0466  PTS system fructose subfamily IIA component  31.71 
 
 
133 aa  44.3  0.0006  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.582977  normal  0.387162 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0076  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 
135 aa  44.3  0.0006  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  26.21 
 
 
336 aa  43.9  0.0007  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0345  PTS system fructose subfamily IIA component  30.89 
 
 
133 aa  43.9  0.0007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.251749 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  26.56 
 
 
144 aa  43.9  0.0007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  26.4 
 
 
145 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  26.47 
 
 
326 aa  43.9  0.0008  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  28.21 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0146  PTS system fructose subfamily IIA component  27.12 
 
 
136 aa  43.9  0.0009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.376334 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  28.43 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  28.43 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  26.47 
 
 
326 aa  43.5  0.001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  30.77 
 
 
314 aa  43.1  0.001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2967  PTS system fructose subfamily IIA component  26.67 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.434901  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  28.43 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  28.43 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5436  PTS system fructose subfamily IIA component  28.91 
 
 
163 aa  43.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0182502  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1235  PTS system fructose subfamily IIA component  29.46 
 
 
133 aa  43.5  0.001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  26.26 
 
 
131 aa  43.1  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>