74 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene EcSMS35_4480 on replicon NC_010498
Organism: Escherichia coli SMS-3-5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010498  EcSMS35_4480  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  100 
 
 		 135 aa  277  5e-74  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.569448 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5497  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  93.33 
 
 		 135 aa  263  7e-70  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4522  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA component  93.33 
 
 		 135 aa  261  2e-69  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1992  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  38.93 
 
 		 135 aa  95.9  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.340579  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1768  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  39 
 
 		 314 aa  72  0.000000000003  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  unclonable  0.0000481917  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3022  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  29.85 
 
 		 134 aa  69.3  0.00000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0818  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.39 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0804  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  32.61 
 
 		 326 aa  67.8  0.00000000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0372  mannose PTS system component IIAB  34 
 
 		 330 aa  66.2  0.0000000001  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.0000136714  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1863  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  28.8 
 
 		 329 aa  65.9  0.0000000002  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00596376  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1272  PTS system fructose subfamily IIA component  26.98 
 
 		 140 aa  65.5  0.0000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0948  PTS system fructose subfamily IIA component  27.82 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0978  PTS system fructose subfamily IIA component  29.75 
 
 		 130 aa  65.1  0.0000000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0150  PTS system fructose subfamily IIA component  25.62 
 
 		 141 aa  64.7  0.0000000004  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0382  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.41 
 
 		 139 aa  64.3  0.0000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2021  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  32.76 
 
 		 313 aa  62  0.000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.511847  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3396  PTS system fructose subfamily IIA component  29.84 
 
 		 145 aa  62  0.000000003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1926  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  35.79 
 
 		 322 aa  62  0.000000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.684419  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2219  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  35.79 
 
 		 322 aa  61.6  0.000000003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.854974  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0464  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  26.83 
 
 		 331 aa  60.8  0.000000005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000451703  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0361  PTS system, mannose-specific IIAB components  31 
 
 		 336 aa  59.7  0.00000001  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.00370358  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2813  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.82 
 
 		 323 aa  60.1  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.047129 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0609  protein-N(pi)-phosphohistidine-sugar phosphotransferase (phosphotransferase system mannose/fructose-specific IIA component)  36.46 
 
 		 323 aa  58.9  0.00000002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  decreased coverage  0.000000226836  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1651  PTS system mannose/fructose/sorbose family transporter subunit IIB  32.63 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.133869  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2464  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  32.63 
 
 		 324 aa  59.3  0.00000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.134183  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0200  protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  33.33 
 
 		 329 aa  58.5  0.00000003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.000000259121  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0132  PTS system fructose subfamily IIA component  27.97 
 
 		 136 aa  58.5  0.00000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1983  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIB subunit  34.55 
 
 		 318 aa  58.2  0.00000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2368  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIB subunit  31.58 
 
 		 324 aa  57.8  0.00000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.15235  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2162  PTS system fructose subfamily IIA component  28.57 
 
 		 130 aa  57.8  0.00000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3696  PTS system fructose subfamily IIA component  29.27 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000385193  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1486  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  31.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1302  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000497751  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1973  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00730165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2030  PTS system mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0638718  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1969  PTS system mannose-specific transporter subunit IIAB  31.82 
 
 		 322 aa  57.4  0.00000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.000485794  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2096  PTS system fructose subfamily IIA component  29.84 
 
 		 142 aa  57  0.00000008  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2390  PTS system fructose subfamily IIA component  25.87 
 
 		 144 aa  57  0.00000008  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1795  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  34 
 
 		 332 aa  56.6  0.0000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.172068  hitchhiker  1.3720900000000001e-24 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01787  fused mannose-specific PTS enzymes: IIA component/IIB component  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0965607  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2083  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.000000000444348  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1371  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000647863  normal  0.0229749 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3433  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  27.68 
 
 		 144 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01775  hypothetical protein  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0856085  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1826  PTS system, mannose/fructose/sorbose family, IIA subunit  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000156617  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2045  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000183907  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1907  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000431359  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2546  PTS system, mannose-specific IIAB component  31.82 
 
 		 323 aa  55.5  0.0000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.0000579402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0451  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIAB subunit  32.04 
 
 		 322 aa  55.5  0.0000003  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.178007  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3326  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  26.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3616  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  26.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03001  putative phosphotransferase system enzyme subunit (N-acetyl-galactosamine/galactosamine PTS system enzyme IIA component)  26.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02952  hypothetical protein  26.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0564  PTS system fructose subfamily IIA component  26.79 
 
 		 144 aa  53.9  0.0000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.576662  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2386  PTS system mannose/fructose/sorbose family IIA subunit  32.74 
 
 		 320 aa  53.9  0.0000007  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4450  PTS system, mannose/sorbose-specific, IIA component  25.89 
 
 		 144 aa  51.2  0.000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.236223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1287  PTS system fructose subfamily IIA component  23.97 
 
 		 130 aa  50.1  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.178169  hitchhiker  0.00000226517 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1665  PTS system fructose subfamily IIA component  28.87 
 
 		 128 aa  49.7  0.00001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.0000000418969  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3576  PTS system fructose subfamily IIA component  22.22 
 
 		 144 aa  49.7  0.00001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.440401  normal  0.531464 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3864  PTS system fructose subfamily IIA component  26.89 
 
 		 136 aa  49.3  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4281  PTS system fructose subfamily IIA component  26.97 
 
 		 142 aa  48.9  0.00002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3386  PTS system fructose subfamily IIA component  24.37 
 
 		 131 aa  48.1  0.00004  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0345  PTS system, IIA component  25.41 
 
 		 143 aa  48.1  0.00004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0873  PTS system fructose subfamily IIA component  24.37 
 
 		 131 aa  47.4  0.00006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2965  PTS system, IIA component  24.22 
 
 		 134 aa  47.8  0.00006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1273  phosphotransferase system, mannose/fructose-specific component IIA  27.01 
 
 		 143 aa  46.6  0.0001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0243136  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1068  PTS system fructose subfamily IIA component  27.07 
 
 		 146 aa  45.8  0.0002  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3844  PTS system fructose subfamily IIA component  27.19 
 
 		 144 aa  45.4  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3009  PTS system fructose subfamily IIA component  23.94 
 
 		 142 aa  44.3  0.0006  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0677471  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0464  Protein-N(pi)-phosphohistidine--sugar phosphotransferase  24.8 
 
 		 332 aa  42  0.003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  decreased coverage  0.00000027828  normal  0.826743 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0114  PTS system fructose subfamily IIA component  21.05 
 
 		 135 aa  41.2  0.005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.204192  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0137  PTS system IIA component domain protein  26.09 
 
 		 146 aa  40.8  0.007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00127  hypothetical protein  22.14 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00128  predicted PTS Enzyme IIA  22.14 
 
 		 146 aa  40.4  0.008  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>