101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0616 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  87.25 
 
 		 401 aa  684    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  100 
 
 		 384 aa  790    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  97.49 
 
 		 319 aa  605  9.999999999999999e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  93.82 
 
 		 330 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  81 
 
 		 299 aa  456  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  82.03 
 
 		 276 aa  430  1e-119  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  66.1 
 
 		 334 aa  380  1e-104  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  66.54 
 
 		 334 aa  363  4e-99  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  55.7 
 
 		 320 aa  89.4  9e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  53.01 
 
 		 324 aa  88.2  3e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  62.5 
 
 		 201 aa  82  0.00000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  63.79 
 
 		 206 aa  77  0.0000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  26.06 
 
 		 306 aa  75.5  0.000000000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  48.75 
 
 		 130 aa  73.9  0.000000000005  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  64.81 
 
 		 235 aa  72.8  0.00000000001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  66.67 
 
 		 336 aa  71.2  0.00000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  26.77 
 
 		 284 aa  70.5  0.00000000005  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  64.18 
 
 		 320 aa  69.7  0.00000000008  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  28.47 
 
 		 306 aa  68.9  0.0000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  26.67 
 
 		 296 aa  67.8  0.0000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  24.1 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  25.29 
 
 		 287 aa  67.4  0.0000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  44.87 
 
 		 318 aa  67.4  0.0000000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  51.52 
 
 		 322 aa  67  0.0000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  24.53 
 
 		 282 aa  66.2  0.0000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  25.94 
 
 		 288 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  24.91 
 
 		 300 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  25.48 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  49.23 
 
 		 314 aa  65.1  0.000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  59.26 
 
 		 211 aa  65.5  0.000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  28.52 
 
 		 318 aa  65.5  0.000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  24.72 
 
 		 284 aa  64.7  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  25.52 
 
 		 308 aa  64.7  0.000000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  24.24 
 
 		 292 aa  63.2  0.000000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  23.57 
 
 		 298 aa  62.4  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  24.73 
 
 		 326 aa  62.4  0.00000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  23.36 
 
 		 293 aa  62.8  0.00000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  27.68 
 
 		 314 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  26.67 
 
 		 311 aa  61.6  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  27.3 
 
 		 310 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  26.48 
 
 		 313 aa  61.2  0.00000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  60.8  0.00000004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  23.9 
 
 		 284 aa  59.7  0.00000009  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  23.38 
 
 		 315 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  25.44 
 
 		 313 aa  59.3  0.0000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  24.6 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  23.91 
 
 		 317 aa  57.8  0.0000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  23.53 
 
 		 327 aa  57  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  47.89 
 
 		 345 aa  56.6  0.0000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  56.25 
 
 		 350 aa  56.6  0.0000008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  24 
 
 		 309 aa  56.2  0.0000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  53.03 
 
 		 322 aa  55.8  0.000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  28.81 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  45.07 
 
 		 337 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  34.62 
 
 		 331 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  41.79 
 
 		 339 aa  55.5  0.000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  26.48 
 
 		 325 aa  55.1  0.000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  29.66 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  40.91 
 
 		 343 aa  54.3  0.000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  50.77 
 
 		 314 aa  53.5  0.000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  23.13 
 
 		 319 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  23.16 
 
 		 325 aa  53.5  0.000006  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  23.16 
 
 		 331 aa  53.5  0.000007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  46.97 
 
 		 339 aa  53.1  0.000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  24.24 
 
 		 296 aa  53.1  0.000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  39.68 
 
 		 319 aa  52.4  0.00001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  26.59 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  24.38 
 
 		 322 aa  51.6  0.00002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  42.42 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  42.42 
 
 		 325 aa  52  0.00002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  42.37 
 
 		 329 aa  51.6  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  25.65 
 
 		 233 aa  50.1  0.00006  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  22.15 
 
 		 303 aa  49.7  0.00008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  26.6 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  43.48 
 
 		 330 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  26.6 
 
 		 307 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  26.58 
 
 		 314 aa  49.3  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  22.26 
 
 		 309 aa  48.5  0.0002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  42.37 
 
 		 329 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  41.79 
 
 		 335 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  44.62 
 
 		 166 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  40.91 
 
 		 333 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2785  hypothetical protein  35.94 
 
 		 310 aa  47.4  0.0004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.110353  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  22.73 
 
 		 300 aa  47.4  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0006  hypothetical protein  21.88 
 
 		 313 aa  47.8  0.0004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  0.00155614  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  42.62 
 
 		 323 aa  47.4  0.0005  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0248  hypothetical cytosolic protein  37.31 
 
 		 138 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1946  hypothetical protein  37.31 
 
 		 138 aa  47  0.0006  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000308535  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0807  hypothetical protein  26.53 
 
 		 298 aa  46.6  0.0007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.098381  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  46.43 
 
 		 321 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  46.43 
 
 		 330 aa  46.6  0.0008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  23.3 
 
 		 326 aa  45.8  0.001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0749  hypothetical protein  22.88 
 
 		 288 aa  46.2  0.001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  24.18 
 
 		 298 aa  45.8  0.001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0175  hypothetical protein  27.37 
 
 		 256 aa  45.4  0.002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0958  hypothetical protein  25.36 
 
 		 285 aa  45.4  0.002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2145  hypothetical protein  27.87 
 
 		 285 aa  44.3  0.003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.955694  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  40.3 
 
 		 318 aa  44.3  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1487  hypothetical protein  26.61 
 
 		 302 aa  43.9  0.004  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>