124 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0596 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0596  hypothetical protein  100 
 
 		 401 aa  818    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.320961  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0616  hypothetical protein  89.25 
 
 		 384 aa  683    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.618084  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0599  hypothetical protein  93.73 
 
 		 319 aa  607  1e-173  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0597  hypothetical protein  90.94 
 
 		 330 aa  525  1e-148  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.946017  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2444  hypothetical protein  83.03 
 
 		 299 aa  457  1e-127  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.445451  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2294  hypothetical protein  82.94 
 
 		 276 aa  426  1e-118  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1240  hypothetical protein  67.71 
 
 		 334 aa  389  1e-107  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0820  hypothetical protein  65.12 
 
 		 334 aa  372  1e-102  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1248  hypothetical protein  70.24 
 
 		 336 aa  99.8  8e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1257  hypothetical protein  65.71 
 
 		 324 aa  94.4  3e-18  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.591425  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2379  hypothetical protein  65.15 
 
 		 320 aa  90.9  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6237  putative transposase  54.88 
 
 		 345 aa  86.3  8e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.62735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2348  hypothetical protein  62.9 
 
 		 201 aa  83.6  0.000000000000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2384  hypothetical protein  28.34 
 
 		 325 aa  79.7  0.00000000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000000252943  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1608  hypothetical protein  30.03 
 
 		 306 aa  78.6  0.0000000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.0000774697  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2345  hypothetical protein  63.79 
 
 		 206 aa  78.6  0.0000000000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.387086  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0624  hypothetical protein  54.29 
 
 		 130 aa  77.8  0.0000000000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0436757  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2623  hypothetical protein  56.34 
 
 		 322 aa  76.3  0.0000000000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0276584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1045  putative transposase  47.67 
 
 		 343 aa  74.7  0.000000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0831423  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1410  hypothetical protein  64.81 
 
 		 235 aa  73.2  0.000000000007  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1178  hypothetical protein  27.89 
 
 		 314 aa  72.4  0.00000000001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0049  hypothetical protein  24.74 
 
 		 296 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2707  hypothetical protein  25.45 
 
 		 300 aa  72  0.00000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1611  hypothetical protein  29 
 
 		 318 aa  71.6  0.00000000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  unclonable  1.5466e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2698  hypothetical protein  55.22 
 
 		 318 aa  71.2  0.00000000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.444632 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0257  hypothetical protein  24.77 
 
 		 306 aa  70.9  0.00000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2183  hypothetical protein  66.67 
 
 		 320 aa  70.9  0.00000000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0403  hypothetical protein  27.67 
 
 		 284 aa  70.1  0.00000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.000003324  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1976  hypothetical protein  25 
 
 		 287 aa  68.6  0.0000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4940  hypothetical protein  24.32 
 
 		 327 aa  67.4  0.0000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1236  hypothetical protein  26.95 
 
 		 311 aa  67  0.0000000005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00145215  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1691  hypothetical protein  25.28 
 
 		 288 aa  66.6  0.0000000007  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2781  hypothetical protein  53.97 
 
 		 314 aa  66.6  0.0000000007  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.664556  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0294  hypothetical protein  23.86 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1399  hypothetical protein  59.26 
 
 		 211 aa  66.2  0.0000000009  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.0266105  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2863  hypothetical protein  57.75 
 
 		 322 aa  65.5  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.113899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1344  hypothetical protein  24.44 
 
 		 292 aa  65.5  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2719  hypothetical protein  25.48 
 
 		 296 aa  65.1  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2560  hypothetical protein  24.32 
 
 		 282 aa  64.3  0.000000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2565  hypothetical protein  26.3 
 
 		 313 aa  64.7  0.000000003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.136363  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0669  hypothetical protein  23.68 
 
 		 292 aa  64.3  0.000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1091  hypothetical protein  25.25 
 
 		 322 aa  63.9  0.000000005  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0528026  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0007  hypothetical protein  25.5 
 
 		 284 aa  63.5  0.000000006  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2583  hypothetical protein  24.28 
 
 		 317 aa  63.2  0.000000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  6.21441e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0511  hypothetical protein  23.16 
 
 		 309 aa  61.6  0.00000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  decreased coverage  0.00971553  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0142  hypothetical protein  23.81 
 
 		 298 aa  62  0.00000002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.836251  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1114  hypothetical protein  27.6 
 
 		 310 aa  62  0.00000002  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4715  hypothetical protein  23.43 
 
 		 331 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5077  hypothetical protein  23.43 
 
 		 325 aa  61.2  0.00000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4711  hypothetical protein  23.68 
 
 		 293 aa  61.2  0.00000003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0013874  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1947  hypothetical protein  25.09 
 
 		 299 aa  60.1  0.00000006  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000247154  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0885  hypothetical protein  25.78 
 
 		 313 aa  60.1  0.00000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0165  hypothetical protein  23.9 
 
 		 284 aa  59.3  0.0000001  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3010  hypothetical protein  24.41 
 
 		 326 aa  59.3  0.0000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0413061  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1248  hypothetical protein  45.78 
 
 		 330 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.442555 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4944  hypothetical protein  23.18 
 
 		 319 aa  59.3  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0517  conserved hypothetical cytosolic protein  41.38 
 
 		 339 aa  58.5  0.0000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.269297  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1931  hypothetical protein  24.41 
 
 		 308 aa  58.5  0.0000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0862  hypothetical protein  24.3 
 
 		 284 aa  58.2  0.0000003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2497  hypothetical protein  22.35 
 
 		 309 aa  56.6  0.0000007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1108  putative transposase  43.37 
 
 		 339 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1994  putative transposase  38.75 
 
 		 319 aa  56.2  0.0000009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.735151 
 
 
-
 
NC_011656  BCAH187_E0058  hypothetical protein  28.81 
 
 		 315 aa  55.8  0.000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00639651  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1504  putative transposase  55.32 
 
 		 350 aa  55.1  0.000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2547  hypothetical protein  55.56 
 
 		 314 aa  55.5  0.000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0376053  normal  0.0608447 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1089  putative transposase  40.24 
 
 		 337 aa  55.1  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.693638  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0615  hypothetical protein  23.16 
 
 		 300 aa  55.1  0.000002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0181  hypothetical protein  41.1 
 
 		 325 aa  54.7  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000266297  normal  0.396651 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0598  hypothetical protein  22.46 
 
 		 296 aa  54.3  0.000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1261  hypothetical protein  29.66 
 
 		 290 aa  54.3  0.000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2880  hypothetical protein  40.66 
 
 		 323 aa  54.3  0.000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.149752  normal  0.426146 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1349  hypothetical protein  47.3 
 
 		 166 aa  54.3  0.000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.072063  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3230  hypothetical protein  23.62 
 
 		 326 aa  53.9  0.000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.593282  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1963  putative transposase  37.21 
 
 		 331 aa  53.5  0.000006  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0706346  normal  0.536642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2384  hypothetical protein  26.24 
 
 		 314 aa  53.1  0.000007  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000288219  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2960  putative transposase  45 
 
 		 329 aa  52.8  0.00001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.26307  normal  0.0520741 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1941  hypothetical protein  26.59 
 
 		 288 aa  52.4  0.00001  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  unclonable  0.00000016272  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2902  putative transposase  45.31 
 
 		 335 aa  52  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5306  hypothetical protein  24.08 
 
 		 308 aa  52  0.00002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.939469  normal  0.0565222 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1059  putative transposase  45 
 
 		 329 aa  49.7  0.00008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0031  hypothetical protein  26.6 
 
 		 307 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1348  hypothetical protein  43.42 
 
 		 318 aa  49.7  0.00009  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0527396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0127  hypothetical protein  26.6 
 
 		 303 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000393642 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1131  hypothetical protein  24.57 
 
 		 298 aa  49.7  0.0001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0101  hypothetical protein  28 
 
 		 298 aa  49.3  0.0001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0158  hypothetical protein  26.6 
 
 		 307 aa  49.7  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.459825  hitchhiker  4.24073e-17 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0014  hypothetical protein  24.91 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0012  hypothetical protein  24.91 
 
 		 286 aa  49.3  0.0001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0802  putative transposase  46.03 
 
 		 333 aa  49.3  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.672564 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4573  hypothetical protein  23.92 
 
 		 230 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2695  hypothetical protein  26.53 
 
 		 304 aa  48.5  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0536722 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3289  hypothetical protein  56.52 
 
 		 324 aa  48.5  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00577897 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2152  hypothetical cytosolic protein  39.19 
 
 		 325 aa  48.5  0.0002  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0026  hypothetical protein  39.19 
 
 		 325 aa  48.1  0.0002  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2677  hypothetical protein  36.67 
 
 		 331 aa  48.5  0.0002  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0878  putative transposase  44.26 
 
 		 321 aa  48.5  0.0002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.110546  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1534  hypothetical protein  25.45 
 
 		 233 aa  48.1  0.0003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0354  hypothetical protein  39.47 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1150  putative transposase  44.26 
 
 		 330 aa  48.1  0.0003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0361  hypothetical protein  39.47 
 
 		 294 aa  48.1  0.0003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.926631  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>