More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0393 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007512  Plut_1786  histidyl-tRNA synthetase  74.07 
 
 		 430 aa  667    Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00736899 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1467  histidyl-tRNA synthetase  72.04 
 
 		 425 aa  646    Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.162943  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0393  histidyl-tRNA synthetase  100 
 
 		 429 aa  866    Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0364  histidyl-tRNA synthetase  72.83 
 
 		 429 aa  657    Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00780967  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0295  histidyl-tRNA synthetase  70.78 
 
 		 430 aa  613  9.999999999999999e-175  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.000190773  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0397  histidyl-tRNA synthetase  66.59 
 
 		 434 aa  587  1e-166  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00425435  normal  0.748396 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0362  histidyl-tRNA synthetase  68.03 
 
 		 422 aa  572  1.0000000000000001e-162  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0779555  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1211  histidyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1184  histidyl-tRNA synthetase  48.05 
 
 		 429 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1619  histidyl-tRNA synthetase  45.94 
 
 		 436 aa  366  1e-100  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2507  histidyl-tRNA synthetase  46.7 
 
 		 423 aa  364  2e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000000231867  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12150  histidyl-tRNA synthetase  45.89 
 
 		 419 aa  362  5.0000000000000005e-99  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000175223  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2280  histidyl-tRNA synthetase  45.3 
 
 		 419 aa  358  8e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000301062  unclonable  0.000000000414505 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2263  histidyl-tRNA synthetase  46.41 
 
 		 435 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.383817 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1257  histidyl-tRNA synthetase  45.65 
 
 		 429 aa  357  2.9999999999999997e-97  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0737867  normal  0.65795 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3587  histidyl-tRNA synthetase  45.37 
 
 		 424 aa  350  3e-95  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000170234  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0756  histidyl-tRNA synthetase  43.83 
 
 		 419 aa  348  1e-94  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000330653  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_25401  histidyl-tRNA synthetase  47.46 
 
 		 436 aa  346  5e-94  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5012  histidyl-tRNA synthetase  44.89 
 
 		 430 aa  343  4e-93  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0944  histidyl-tRNA synthetase  45.05 
 
 		 426 aa  343  5e-93  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0220  histidyl-tRNA synthetase  46.74 
 
 		 430 aa  342  5.999999999999999e-93  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2984  histidyl-tRNA synthetase  45.02 
 
 		 429 aa  342  8e-93  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0011  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 417 aa  340  4e-92  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07281  histidyl-tRNA synthetase  45.68 
 
 		 423 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.141798  normal  0.118541 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0592  histidyl-tRNA synthetase  42.58 
 
 		 421 aa  337  1.9999999999999998e-91  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000556243  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0902  histidyl-tRNA synthetase, class IIA  44.12 
 
 		 423 aa  337  1.9999999999999998e-91  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.717157  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0905  histidyl-tRNA synthetase  45.45 
 
 		 420 aa  337  1.9999999999999998e-91  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2105  histidyl-tRNA synthetase  43.06 
 
 		 447 aa  337  2.9999999999999997e-91  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.416377  normal  0.0829956 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0665  histidyl-tRNA synthetase  44.63 
 
 		 442 aa  336  5e-91  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.411907  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0061  histidyl-tRNA synthetase  44.47 
 
 		 426 aa  335  7e-91  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.352385  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1216  histidyl-tRNA synthetase  44.83 
 
 		 432 aa  335  9e-91  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.420305  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2085  histidyl-tRNA synthetase  44.72 
 
 		 456 aa  334  1e-90  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.253683  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1041  histidyl-tRNA synthetase  41.9 
 
 		 419 aa  335  1e-90  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000286548  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1804  histidyl-tRNA synthetase  41.08 
 
 		 421 aa  334  2e-90  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  hitchhiker  0.000951278  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0969  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 411 aa  333  3e-90  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0491418  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1677  histidyl-tRNA synthetase  44.34 
 
 		 423 aa  333  5e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0038851 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0811  histidine--tRNA ligase  42.82 
 
 		 422 aa  332  5e-90  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000276292  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1332  histidyl-tRNA synthetase  42.31 
 
 		 417 aa  333  5e-90  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000373388  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06821  histidyl-tRNA synthetase  44.23 
 
 		 423 aa  332  8e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.254744  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0552  histidyl-tRNA synthetase  42.86 
 
 		 417 aa  330  2e-89  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0188  histidyl-tRNA synthetase  46.01 
 
 		 445 aa  331  2e-89  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.207705  decreased coverage  0.00812888 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2235  histidyl-tRNA synthetase  43.29 
 
 		 446 aa  331  2e-89  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1290  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 442 aa  331  2e-89  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.315921  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1453  histidyl-tRNA synthetase  43.21 
 
 		 421 aa  330  4e-89  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1722  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.50762 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0485  histidyl-tRNA synthetase  41.91 
 
 		 415 aa  329  7e-89  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1749  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 446 aa  329  7e-89  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.192488  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0713  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 423 aa  328  9e-89  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00404453  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4486  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.451544  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14890  histidyl-tRNA synthetase  43.44 
 
 		 429 aa  328  1.0000000000000001e-88  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4523  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.845471  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4536  histidyl-tRNA synthetase  42.92 
 
 		 423 aa  328  1.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000118978  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1835  histidyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.969857  normal  0.905369 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5112  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 446 aa  327  2.0000000000000001e-88  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.238333  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4483  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  327  2.0000000000000001e-88  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.6071e-17 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6268  histidyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.674375  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1419  histidyl-tRNA synthetase  42.56 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.022633 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1811  histidyl-tRNA synthetase  43.09 
 
 		 446 aa  327  3e-88  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4298  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.408041  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4136  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4146  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0483726  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4633  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 423 aa  327  4.0000000000000003e-88  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.4414  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2189  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 446 aa  326  4.0000000000000003e-88  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3119  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 423 aa  326  5e-88  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0109936  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2227  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1106  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1344  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2353  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1834  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.283546  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0063  histidyl-tRNA synthetase  42.59 
 
 		 446 aa  326  6e-88  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00160741  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1464  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 446 aa  325  7e-88  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.49092  normal  0.444006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1472  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 418 aa  325  8.000000000000001e-88  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000135965  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1653  histidyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 420 aa  325  1e-87  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.52822  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1152  histidyl-tRNA synthetase  44.14 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.537787 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1193  histidyl-tRNA synthetase  40.91 
 
 		 424 aa  324  2e-87  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000346938  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1425  histidyl-tRNA synthetase  43.33 
 
 		 461 aa  323  2e-87  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1913  histidyl-tRNA synthetase  42.4 
 
 		 413 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.282682  hitchhiker  0.000195117 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4250  histidyl-tRNA synthetase  42.45 
 
 		 423 aa  323  2e-87  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.0000611517  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1060  histidyl-tRNA synthetase  44.39 
 
 		 450 aa  324  2e-87  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.110203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3389  histidyl-tRNA synthetase  45.14 
 
 		 431 aa  324  2e-87  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1659  histidyl-tRNA synthetase  42.01 
 
 		 413 aa  323  3e-87  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0302823  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0079  histidyl-tRNA synthetase  44.55 
 
 		 441 aa  323  3e-87  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1595  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 446 aa  323  5e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0413234  normal  0.116448 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2540  histidyl-tRNA synthetase  43.1 
 
 		 446 aa  322  7e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0401041  hitchhiker  0.00166777 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1312  histidyl-tRNA synthetase  43.2 
 
 		 429 aa  322  8e-87  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.187766  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1166  histidyl-tRNA synthetase  41.87 
 
 		 416 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000433915 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3096  histidyl-tRNA synthetase  42.2 
 
 		 416 aa  322  9.000000000000001e-87  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000698115  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5018  histidyl-tRNA synthetase  43.53 
 
 		 431 aa  322  9.999999999999999e-87  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.303821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1381  histidyl-tRNA synthetase  42.3 
 
 		 414 aa  322  9.999999999999999e-87  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.158923  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1726  histidyl-tRNA synthetase  42.52 
 
 		 420 aa  321  1.9999999999999998e-86  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1887  histidyl-tRNA synthetase  41.42 
 
 		 415 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1619  histidyl-tRNA synthetase  41.43 
 
 		 419 aa  321  1.9999999999999998e-86  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000977083 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4324  histidyl-tRNA synthetase  42.96 
 
 		 429 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.439284  hitchhiker  0.0000000761597 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1171  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 429 aa  320  3e-86  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0744  histidyl-tRNA synthetase  41.63 
 
 		 419 aa  320  3e-86  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.100604  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1091  histidyl-tRNA synthetase  42.69 
 
 		 429 aa  319  5e-86  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0595  histidyl-tRNA synthetase  42.82 
 
 		 419 aa  319  6e-86  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.430312 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1674  histidyl-tRNA synthetase  42.15 
 
 		 429 aa  318  9e-86  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1291  histidyl-tRNA synthetase  44.25 
 
 		 423 aa  318  1e-85  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0897904  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1291  histidyl-tRNA synthetase  40.86 
 
 		 421 aa  318  1e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0371866  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>