More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnuc_0108 on replicon NC_009379
Organism: Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009379  Pnuc_0108  histidinol-phosphate aminotransferase  100 
 
 		 355 aa  728    Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.346201  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3383  histidinol-phosphate aminotransferase  61.34 
 
 		 356 aa  448  1e-125  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.495635  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1712  histidinol-phosphate aminotransferase  62.61 
 
 		 357 aa  447  1.0000000000000001e-124  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.935772  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0872  histidinol-phosphate aminotransferase  60.91 
 
 		 350 aa  447  1.0000000000000001e-124  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.942515  normal  0.720307 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4132  histidinol-phosphate aminotransferase  60.06 
 
 		 350 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0249  histidinol-phosphate aminotransferase  61.41 
 
 		 354 aa  441  1e-123  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000202018  normal  0.0284136 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0967  histidinol-phosphate aminotransferase  61.43 
 
 		 348 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1006  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 		 348 aa  438  9.999999999999999e-123  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.533333  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2700  histidinol-phosphate aminotransferase  60.11 
 
 		 353 aa  440  9.999999999999999e-123  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4437  histidinol-phosphate aminotransferase  60.06 
 
 		 350 aa  437  1e-121  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0995635  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0974  histidinol-phosphate aminotransferase  60.86 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.433516  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4248  histidinol-phosphate aminotransferase  61.14 
 
 		 348 aa  436  1e-121  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0905  histidinol-phosphate aminotransferase  60.83 
 
 		 357 aa  436  1e-121  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1113  histidinol-phosphate aminotransferase  59.44 
 
 		 357 aa  433  1e-120  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.459225  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0591  histidinol-phosphate aminotransferase  59.6 
 
 		 356 aa  434  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_12940  histidinol-phosphate aminotransferase  60.86 
 
 		 351 aa  431  1e-119  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5019  histidinol-phosphate aminotransferase  61.54 
 
 		 351 aa  429  1e-119  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2955  histidinol-phosphate aminotransferase  58.76 
 
 		 352 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.692015  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57770  histidinol-phosphate aminotransferase  60.68 
 
 		 351 aa  427  1e-118  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7238  histidinol-phosphate aminotransferase  57.75 
 
 		 355 aa  423  1e-117  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3123  histidinol-phosphate aminotransferase  60.73 
 
 		 351 aa  420  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0510  histidinol-phosphate aminotransferase  57.14 
 
 		 355 aa  418  1e-116  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0885  histidinol-phosphate aminotransferase  58.97 
 
 		 350 aa  420  1e-116  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.224809  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2345  histidinol-phosphate aminotransferase  59.15 
 
 		 356 aa  407  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.155092  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  55.31 
 
 		 355 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.199347  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2805  histidinol-phosphate aminotransferase  55.31 
 
 		 355 aa  408  1.0000000000000001e-112  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.2353  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6135  histidinol-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 		 355 aa  404  1e-111  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0894233  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0471  histidinol-phosphate aminotransferase  55.31 
 
 		 355 aa  403  1e-111  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2816  histidinol-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 		 371 aa  402  1e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.989524  normal  0.744266 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0768  histidinol-phosphate aminotransferase  55.52 
 
 		 369 aa  398  9.999999999999999e-111  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.98949  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2723  histidinol-phosphate aminotransferase  56.02 
 
 		 355 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.038969  normal  0.682675 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4158  histidinol-phosphate aminotransferase  55.21 
 
 		 353 aa  400  9.999999999999999e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.773643 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3123  histidinol-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 		 356 aa  395  1e-109  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0750  histidinol-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 		 356 aa  397  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.331282  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3830  histidinol-phosphate aminotransferase  56.06 
 
 		 353 aa  395  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  56.42 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0929244  normal  0.0336702 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3368  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 		 355 aa  395  1e-109  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0582  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 		 357 aa  395  1e-109  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.127641  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0566  histidinol-phosphate aminotransferase  54.75 
 
 		 357 aa  396  1e-109  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0230695  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2865  histidinol-phosphate aminotransferase  55.46 
 
 		 355 aa  396  1e-109  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.445667  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2927  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4136  histidinol-phosphate aminotransferase  56.42 
 
 		 359 aa  394  1e-108  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496704  normal  0.454929 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3021  histidinol-phosphate aminotransferase  54.9 
 
 		 355 aa  394  1e-108  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0091  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1499  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 		 357 aa  393  1e-108  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0312  histidinol-phosphate aminotransferase  55.4 
 
 		 363 aa  384  1e-105  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.55347  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1133  histidinol-phosphate aminotransferase  53.93 
 
 		 353 aa  383  1e-105  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0610  histidinol-phosphate aminotransferase  50.28 
 
 		 355 aa  380  1e-104  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.413209  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1696  histidinol-phosphate aminotransferase  54.55 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.571407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01850  histidinol-phosphate aminotransferase  49.01 
 
 		 353 aa  374  1e-102  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1408  histidinol-phosphate aminotransferase  54.47 
 
 		 370 aa  374  1e-102  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0507  histidinol-phosphate aminotransferase  48.73 
 
 		 351 aa  366  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.571943  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0504  histidinol-phosphate aminotransferase  50.7 
 
 		 367 aa  363  2e-99  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.829789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1479  histidinol-phosphate aminotransferase  52.96 
 
 		 362 aa  357  1.9999999999999998e-97  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.247325  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1901  histidinol-phosphate aminotransferase  50.69 
 
 		 377 aa  353  2.9999999999999997e-96  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.0329593 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2176  histidinol-phosphate aminotransferase  47.46 
 
 		 355 aa  351  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2191  histidinol-phosphate aminotransferase  49.86 
 
 		 377 aa  345  1e-93  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.523427  normal  0.0110693 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1336  histidinol-phosphate aminotransferase  46.57 
 
 		 356 aa  342  4e-93  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.130829  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1615  histidinol-phosphate aminotransferase  43.94 
 
 		 354 aa  327  3e-88  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3529  histidinol-phosphate aminotransferase  44.6 
 
 		 349 aa  315  6e-85  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000117585  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05350  PLP-dependent enzyme, histidinol-phosphate/aromatic aminotransferase or cobyric acid decarboxylase  41.81 
 
 		 356 aa  294  2e-78  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1207  histidinol-phosphate aminotransferase  37.86 
 
 		 350 aa  259  5.0000000000000005e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4334  histidinol phosphate aminotransferase  37.36 
 
 		 350 aa  238  2e-61  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0321  histidinol-phosphate aminotransferase  37.07 
 
 		 347 aa  231  1e-59  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000130338  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3041  histidinol-phosphate aminotransferase  36.26 
 
 		 350 aa  228  2e-58  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.333532  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0823  histidinol-phosphate aminotransferase  36.54 
 
 		 350 aa  227  2e-58  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00191301  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1472  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1499  histidinol-phosphate aminotransferase  37.35 
 
 		 348 aa  225  7e-58  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0236  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000273523  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0220  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 		 350 aa  223  3e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4240  histidinol-phosphate aminotransferase  37.61 
 
 		 354 aa  221  9.999999999999999e-57  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4286  histidinol-phosphate aminotransferase  37.71 
 
 		 347 aa  219  3.9999999999999997e-56  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3099  histidinol-phosphate aminotransferase  34.67 
 
 		 350 aa  219  5e-56  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0385  histidinol phosphate aminotransferase  33.24 
 
 		 350 aa  218  1e-55  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0106  histidinol-phosphate aminotransferase  37.85 
 
 		 358 aa  214  9.999999999999999e-55  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3594  histidinol phosphate aminotransferase  34.53 
 
 		 365 aa  209  7e-53  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3414  histidinol-phosphate aminotransferase  36.21 
 
 		 358 aa  207  2e-52  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0189  histidinol-phosphate aminotransferase  37.18 
 
 		 364 aa  204  2e-51  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2354  histidinol-phosphate aminotransferase  30.94 
 
 		 371 aa  178  1e-43  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.880639  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1851  histidinol-phosphate aminotransferase  36.56 
 
 		 369 aa  176  5e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.328665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3872  histidinol-phosphate aminotransferase  32.78 
 
 		 370 aa  172  5.999999999999999e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.795977 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4254  histidinol-phosphate aminotransferase  32.69 
 
 		 365 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1868  histidinol-phosphate aminotransferase  34.17 
 
 		 386 aa  169  7e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0318031  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2111  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 365 aa  168  1e-40  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0515  histidinol phosphate aminotransferase  33.42 
 
 		 386 aa  167  2.9999999999999998e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.839874  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1679  histidinol-phosphate aminotransferase  33.63 
 
 		 362 aa  167  4e-40  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0175  histidinol-phosphate aminotransferase  34.82 
 
 		 370 aa  166  4e-40  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.645733  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4101  histidinol-phosphate aminotransferase  31.82 
 
 		 365 aa  166  4e-40  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.156349  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0200  histidinol-phosphate aminotransferase  33.79 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1983  histidinol-phosphate aminotransferase  31.28 
 
 		 362 aa  163  4.0000000000000004e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  unclonable  0.000000000438985  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1974  histidinol-phosphate aminotransferase  33.33 
 
 		 369 aa  163  5.0000000000000005e-39  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3864  aminotransferase  32.14 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.502444  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1183  histidinol-phosphate aminotransferase  31.77 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0660  histidinol-phosphate aminotransferase  31.29 
 
 		 370 aa  162  1e-38  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4927  histidinol-phosphate aminotransferase  31.96 
 
 		 365 aa  161  2e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1002  histidinol-phosphate aminotransferase  30.75 
 
 		 351 aa  160  3e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2049  histidinol-phosphate aminotransferase  33.89 
 
 		 373 aa  159  5e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.679361  hitchhiker  0.000000000231729 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1979  histidinol-phosphate aminotransferase  33.06 
 
 		 369 aa  159  6e-38  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4283  histidinol-phosphate aminotransferase  31.72 
 
 		 365 aa  156  5.0000000000000005e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.0212802 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2193  histidinol-phosphate aminotransferase  30.16 
 
 		 392 aa  155  7e-37  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>